聚合酶鏈式反應的試驗污染：PCR反應的很大特點是具有較大擴增能力與極高的靈敏性，但令人腦袋不適的問題是易污染，極其微量的污染即可造成假陽性的產生。污染原因：標本間交叉污染：標本污染主要有收集標本的容器被污染，或標本放置時，由于密封不嚴溢于容器外，或容器外粘有標本而造成相互間交叉污染；標本核酸模板在提取過程中，由于吸樣污染導致標本間污染；有些微生物標本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴散，導致彼此間的污染。PCR試劑的污染：主要是由于在PCR試劑配制過程中，由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的，逆轉錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內含子的位置。實時熒光定量PCR是一種在DNA擴增反應中，以熒光化學物質測聚合酶鏈式反應循環后產物總量的方法。深圳微量PCR檢測技術網站

聚合酶鏈式反應：三步：變性：模板DNA加熱變性；復性，引物與它的靶序列發生退火，引物DNA量多，使引物和模板在局部形成雜交鏈；延伸，4種dNTP 與 Mg2+ 存在的條件下，DNA合成酶催化以引物為起始點，按5'-3'方向進行延伸。上面三步為一個循環，可使拷貝數到達2*E－6-2*E－7。PCR產物一段雙鏈DNA，是由它的末端引物的5’端決定的。首輪擴增，其產物是大小不均一的DNA分子。長度應大于兩引物之間的長度。在第二個循環中，由于5'固定，其產物長度就由等于兩引物之間的長度。所以幾十個循環后就會產生大量的兩引物之間序列。深圳微量PCR檢測技術網站在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物，內標用基因工程方法合成。

Real-time PCR實驗注意事項-防止RNA酶污染的措施：1.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗（注意：有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕，故不能使用）。3.有機玻璃的電泳槽等，可先用去污劑洗滌，雙蒸水沖洗，乙醇干燥，再浸泡在3%H2O2室溫10min，然后用0.1%DEPC水沖洗，晾干。4.配制的溶液應盡可能的用0.1%DEPC，在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑，應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制，然后經0.22μm濾膜過濾除菌。5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套，實驗過程中手套要勤換。6.設置RNA操作專業使用實驗室，所有器械等應為專業使用。

Real-time PCR：使用Real-time PCR進行基因檢測,被普遍應用于病毒和病原菌檢測、轉基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領域。一般首先需要利用專業使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸（DNAorRNA），并經過精制等復雜的操作（通常稱為前處理操作）之后才可以進行Real-time PCR。不易受反應阻害物的影響，使用時不需要進行復雜的前處理操作，單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產品，可以在更短的時間內，簡便、低成本地進行Real-time PCR檢測。Real-time PCR探針法具有高適應性和可靠性。

Real-time PCR原理：所謂實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團，利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程，通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。DNA結合染料法，應用一種帶有熒光的、非特異的DNA結合染料檢測PCR過程中積累的擴增產物。檢測所有雙鏈DNA擴增產物，包括非特異反應產物，如引物二聚體。可對任何雙鏈DNA進行定量；不需要探針，因此減少了實驗設計及運轉成本；適合于大量基因的分析；簡單易用。實時熒光定量PCR：實時熒光定量PCR（QuantitativeReal-time PCR）是一種在DNA擴增反應中，以熒光化學物質測每次聚合酶鏈式反應（PCR）循環后產物總量的方法。通過內參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴增過程中，通過熒光信號，對PCR進程進行實時檢測。由于在PCR擴增的指數時期，模板的Ct值和該模板的起始拷貝數存在線性關系，所以成為定量的依據。嵌套聚合酶鏈反應的兩組引物用于兩個連續的PCR。深圳微量PCR檢測技術網站

實時熒光定量PCR實現了每一輪循環均檢測一次熒光信號的強度。深圳微量PCR檢測技術網站

聚合酶鏈式反應的常見問題：靶序列變異：如靶序列發生突變或缺失，影響引物與模板特異性結合，或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補序列，其PCR擴增是不會成功的。假陽性：出現的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致，有時其條帶更整齊，亮度更高。引物設計不合適：選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性，因而在進行PCR擴增時，擴增出的PCR產物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短，容易出現假陽性。需重新設計引物。出現片狀拖帶或涂抹帶：PCR擴增有時出現涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質量差，dNTP濃度過高，Mg2+濃度過高，退火溫度過低，循環次數過多引起。其對策有：減少酶量，或調換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃 度。增加模板量，減少循環次數。深圳微量PCR檢測技術網站

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