聚合酶鏈式反應：因為PCR擴增了目的DNA區域，所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫檢定法，當時只有微量的DNA可作為證據。聚合酶鏈反應也可用于分析古代DNA那已經有數萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應的技術已經成功地應用于動物身上，例如四萬年前猛犸，以及人類DNA，定量聚合酶鏈反應或者實時聚合酶鏈反應不要與逆轉錄-聚合酶鏈反應方法混淆)允許估計樣品中存在的給定序列的量——這種技術通常用于定量確定基因表達的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具，用于測量每輪PCR擴增后DNA產物的積累。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。實時熒光定量PCR是一種在DNA擴增反應中，以熒光化學物質測聚合酶鏈式反應循環后產物總量的方法。珠海微量數字PCR方案

Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑：1.焦磷酸二乙酯（DEPC）：是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環結合使蛋白質變性，從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍：目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑，它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結構使核酸從蛋白中解離出來，又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物：由氧化釩離子和核苷形成的復合物，它和RNA酶結合形成過渡態類物質，幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑（RNasin）：從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑，可以和多種RNA酶結合，使其失活。5.其它：SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。珠海微量數字PCR方案聚合酶鏈反應是是一種簡單，廉價和可靠的方法復制DN段。

引物的設計對于這個實驗至關重要，因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高，所以相應的對引物設計的要求就很高。普通的要求規則大家都知道，還有幾點必須注意：1，引物的錯配率（引物錯配形成引物二聚體，但是SYBR照樣能嵌入進去，結果導致實驗結果的誤差很大，重復性也不好）。2，引物的特異性一定要高（不像常規PCR，引物同源性不高，只要兩條產物的片段長度相差足夠大，在電泳的時候能夠區分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時候能分開，所以這就造成整個實驗結果誤差很大，不可信）。

Real-time PCR操作流程：1、收集樣品。2相關試劑總RNA提取試劑TREzolReagent(RNA提取試劑),M-MLV（cDNA逆轉錄酶）,RNA純化試劑,RealqPCRMasterMix（螢光定量PCR預混試劑）。3實驗儀器螢光定量PCR儀;PCR儀；低溫離心機。4總RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA（1µg/µl）；Real-time PCR操作流程：2µl隨機引物（T18,10pmol/ul）；2µl10mMdNTPmix；加水至15µl體系。混勻后70℃變性RNA5分鐘，冰上速冷1分鐘，離心將溶液收集至管底加入6µl5×PCRbuffer；1µlRNaseout；1µlM-MLVRT；加水至30µl體系。PCR儀中反應條件設定37℃延伸60min，70℃保溫15min終止反應。合成好的cDNA置于-20℃保存備用。Real-time PCR反應的一個主要限制是，為了產生其選擇性擴增的引物，需要目標序列的先前信息。

實時定量PCR的系統構成及工作原理：熒光定量檢測系統由實時熒光定量PCR儀，實時熒光定量試劑，通用電腦，自動分析軟件等構成。設備由熒光定量系統和計算機組成，用來監測循環過程的熒光。與實時設備相連的計算機收集熒光數據。數據通過開發的實時分析軟件以圖表的形式顯示。原始數據被繪制成熒光強度相對于循環數的圖表。原始數據收集后可以開始分析。實時設備的軟件能使收集到的數據進行正常化處理來彌補背景熒光的差異。正常化后可以設定域值水平，這就是分析熒光數據的水平。實時熒光定量PCR是一種采用外標準曲線定量的方法。珠海微量數字PCR方案

所謂實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團。珠海微量數字PCR方案

Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法：反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質粒DNA的用量應<50ng，而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現條帶：試劑，頭，工作臺污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符：污染。使用全新的試劑和頭，對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板。基因亞型。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜，以確定基因的表達或鑒定RNA轉錄物的序列。珠海微量數字PCR方案

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