Real-time PCR：1.DNA或RNA的定量分析：Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉基因動植物轉基因拷貝數的檢測，RNAi基因失活率的檢測等；2.基因表達差異分析：例如比較經過不同處理樣本之間特定基因的表達差異(如藥物處理、物理處理、化學處理等)，特定基因在不同時相的表達差異以及cDNA晶片或差顯結果的確證；3.基因分型：例如SNP檢測，甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen（螢光染料摻入法）和Taqmanprobe（探針法）。實時設備的軟件能使收集到的數據進行正常化處理來彌補背景熒光的差異。莆田組織熒光定量PCR技術服務

聚合酶鏈式反應生物學研究的歷史中占據了重要的地位。以此為基礎發展出包括Real-time PCR在內的多項應用技術。自誕生后Real-time PCR技術持續發展，從簡單的增擴到整個PCR過程，Real-time PCR表現出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個循環增擴曲線的增長。事實并非如此，早期的軟件不能在運行期間提供可視化的增擴曲線。主要是因為SDS軟件采用整個平臺較終的數據執行數據分析工作，而不是分析每個單獨的反應循環。對某些設備來說，必須向分析軟件提供實時的數據，有些設備則不需要。前一種設備允許軟件實時跟蹤每個加樣口的增擴曲線，同時顯示在電腦屏幕上。莆田組織熒光定量PCR技術服務實時熒光定量PCR的定量方法，在Real-time PCR中，模板定量有兩種策略。

Real-time PCR-傳統定量PCR：1）內參照法：在不同的PCR反應管中加入已定量的內標和引物，內標用基因工程方法合成。上游引物用熒光標記，下游引物不標記。在模板擴增的同時，內標也被擴增。在PCR產物中，由于內標與靶模板的長度不同，二者的擴增產物可用電泳或高效液相分離開來，分別測定其熒光強度，以內標為對照定量待檢測模板。2）競爭法：選擇由突變克隆產生的含有一個新內切位點的外源競爭性模板。在同一反應管中，待測樣品與競爭模板用同一對引物同時擴增（其中一個引物為熒光標記）。

實時定量PCR的系統構成及工作原理：熒光定量檢測系統由實時熒光定量PCR儀，實時熒光定量試劑，通用電腦，自動分析軟件等構成。設備由熒光定量系統和計算機組成，用來監測循環過程的熒光。與實時設備相連的計算機收集熒光數據。數據通過開發的實時分析軟件以圖表的形式顯示。原始數據被繪制成熒光強度相對于循環數的圖表。原始數據收集后可以開始分析。實時設備的軟件能使收集到的數據進行正常化處理來彌補背景熒光的差異。正常化后可以設定域值水平，這就是分析熒光數據的水平。所謂實時熒光定量PCR技術，是指在PCR反應體系中加入熒光基團。

Real-time PCR與普通PCR的實驗目的不同，所以對引物的設計要求也不同。普通PCR的實驗目的只是為了獲得目的基因產物，允許有非特異擴增，只要目標條帶清晰明亮，就可以通過切膠回收的方法回收目標條帶，之后進行后續的克隆、測序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進行擴增，只有這樣的擴增后續由Ct值推算出的起始量模板量才準確，基于此，Real-time PCR對非特異性擴增和引物二聚體的存在有較嚴格的要求。因為Real-time PCR的檢測靈敏度比較高，所以相應的對引物設計的要求就很高。莆田組織熒光定量PCR技術服務

聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA，有時是單鏈的。莆田組織熒光定量PCR技術服務

Real-time PCR探針法適用于：1、具有高適應性和可靠性，實驗結果穩定重複性好，特異性更高。2、適用于擴增序列專一的體系的檢測。3、樣品中靶基因含量過低的定量PCR檢測。4、靶基因的特異序列較短，無論怎樣較佳化引物設計條件都不能解決。5、存在與靶基因同源的序列，在PCR中容易出現非特異性擴增，對特異性要求較高的定量。6、普遍用于人類傳染病的診斷和病原定量,在動物病原體基因的檢測,畜禽產品的檢驗檢疫,生物製品的鑒定。Real-time PCR探針法:PCR擴增時在加入一對引物的同時加入一個特異性的螢光探針，該探針為一寡核苷酸，兩端分別標記一個報告螢光基團和一個淬滅螢光基團。探針完整時，報告基團發射的螢光信號被淬滅基團吸收；PCR擴增時，Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解，使報告螢光基團和淬滅螢光基團分離，從而螢光監測系統可接收到螢光信號，即每擴增一條DNA鏈，就有一個螢光分子形成，實現了螢光信號的累積與PCR產物形成完全同步。莆田組織熒光定量PCR技術服務

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