Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應(yīng)用于病毒RNA的檢測;以及單位點(diǎn)突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基...
Real-timePCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時(shí)退火溫度。實(shí)時(shí)熒光定量PCR通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定...
Real-time PCR實(shí)驗(yàn)常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認(rèn)為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時(shí)也使RNA酶失活。它既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強(qiáng)烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,...
Real-time PCR螢光染料摻入法:在PCR反應(yīng)體系中,加入過量SYBR螢光染料,SYBR螢光染料特異性地?fù)饺隓NA雙鏈后,發(fā)射螢光信號,而不摻入鏈中的SYBR染料分子不會發(fā)射任何螢光信號,從而保證螢光信號的增加與PCR產(chǎn)物的增加完全同步。此方法適用于:1、靈敏度高:使用SYBR可使螢光效果增強(qiáng)到1000倍以上。2、通用性好,不需要設(shè)計(jì)探針,方法簡便,省時(shí),價(jià)格低廉。3、通用型方法,在國內(nèi)外科研中普遍使用。4、高通量大規(guī)模的定量PCR檢測。5、專一性要求不高的定量PCR檢測。Real-time PCR可看作是生物體外的特殊DNA復(fù)制。上海實(shí)時(shí)Real-time PCR服務(wù)Real-tim...
Real-time PCR鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR。在個(gè)反應(yīng)中,一對引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預(yù)期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)...
Real-time PCR:使用Real-time PCR進(jìn)行基因檢測,被普遍應(yīng)用于病毒和病原菌檢測、轉(zhuǎn)基因食品檢測、遺傳病基因檢測等領(lǐng)域。一般首先需要利用專業(yè)使用的試劑盒從待檢樣品中提取其核酸(DNAorRNA),并經(jīng)過精制等復(fù)雜的操作(通常稱為前處理操作)之后才可以進(jìn)行Real-time PCR。不易受反應(yīng)阻害物的影響,使用時(shí)不需要進(jìn)行復(fù)雜的前處理操作,單單需將待檢樣品直接加入到檢測試劑中即可開始檢測。通過使用本產(chǎn)品,可以在更短的時(shí)間內(nèi),簡便、低成本地進(jìn)行Real-time PCR檢測。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種采用外標(biāo)準(zhǔn)曲線定量的方法。無錫細(xì)胞數(shù)字PCR應(yīng)用Real-time PCR鏈?zhǔn)椒?..
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,或標(biāo)本放置時(shí),由于密封不嚴(yán)溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染;標(biāo)本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,導(dǎo)致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)...
Real-time PCR相對定量中的標(biāo)準(zhǔn)曲線法如何進(jìn)行:主要是相對定量標(biāo)準(zhǔn)品的制作,一般有三種方法:1、比較復(fù)雜的方法:質(zhì)粒,采用Biotnt提供內(nèi)參基因的特異性Real-time PCRmRNA引物,對目的基因進(jìn)行Real-time PCR實(shí)驗(yàn),得到PCR擴(kuò)增產(chǎn)物;PCR擴(kuò)增產(chǎn)物轉(zhuǎn)入質(zhì)粒中,得到相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品;2、一般采用的方法1:比較強(qiáng)的CDNA模板,3、一般采用的方法:PCR擴(kuò)增產(chǎn)物,如果在方法2中找不到比較強(qiáng)的CDNA模板,則選用PCR產(chǎn)物作為相對定量的標(biāo)準(zhǔn)品也是可以的;需要注意的事項(xiàng)是:PCR產(chǎn)物濃度很高,而Real-time PCR的產(chǎn)物片段比較短,容易在稀釋的過程中造成PCR...
Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特點(diǎn):靈敏度高:PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的,能將皮克(pg=10-12)量級的起始待測模板擴(kuò)增到微克(μg=-6)水平。能從100萬個(gè)細(xì)胞中檢出一個(gè)靶細(xì)胞;在病毒的檢測中,PCR的靈敏度可達(dá)3個(gè)RFU(空斑形成單位);在細(xì)菌學(xué)中很小檢出率為3個(gè)細(xì)菌。簡便、快速:PCR反應(yīng)用耐高溫的TaqDNA聚合酶,一次性地將反應(yīng)液加好后,即在DNA擴(kuò)增液和水浴鍋上進(jìn)行變性-退火-延伸反應(yīng),一般在2~4小時(shí)完成擴(kuò)增反應(yīng)。擴(kuò)增產(chǎn)物一般用電泳分析,不一定要用同位素,無放射性污染、易推廣。純度要求低:不需要分離病毒或細(xì)菌及培養(yǎng)細(xì)胞,DNA粗制品及RNA均可作為擴(kuò)增模板。...
Real-time PCR反應(yīng):多重連接依賴探針擴(kuò)增(MLPA):允許用單個(gè)引物對擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。多重聚合酶鏈反應(yīng):由單個(gè)PCR混合物中的多個(gè)引物組組成,以產(chǎn)生對不同DNA序列特異的不同大小的擴(kuò)增子。通過同時(shí)靶向多個(gè)基因,可以從單次測試中獲得額外的信息,否則將需要幾次試劑和更多時(shí)間來執(zhí)行。每個(gè)引物組的退火溫度必須優(yōu)化,以在單個(gè)反應(yīng)中正確工作,并符合擴(kuò)增子尺寸。也就是說,當(dāng)通過凝膠電泳可視化時(shí),它們的堿基對長度應(yīng)該足夠不同以形成不同的條帶。實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測的局限。徐州血液熒光PCR方案Real-time PCR從用途上分可以分為...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉(zhuǎn)基因動植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達(dá)差異分析:例如比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達(dá)差異(如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等),特定基因在不同時(shí)相的表達(dá)差異以及cDNA晶片或差顯結(jié)果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。Real-time PCR探針法具有高適應(yīng)性和可靠性。廈門組織定量PCR原理實(shí)時(shí)熒光定量PCR...
Real-time PCR鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR。在個(gè)反應(yīng)中,一對引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預(yù)期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)...
所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒光信號累積實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,之后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。在real-time技術(shù)的發(fā)展過程中,兩個(gè)重要的發(fā)現(xiàn)起著關(guān)鍵的作用:(1)TaqDNA多聚酶的5′核酸外切酶活性的發(fā)現(xiàn),它能降解特異性熒光記探針,因此使得間接的檢測PCR產(chǎn)物成為可能。(2)此后熒光雙標(biāo)記探針的運(yùn)用使在一密閉的反應(yīng)管中能實(shí)時(shí)地監(jiān)測反應(yīng)全過程。這兩個(gè)發(fā)現(xiàn)的結(jié)合以及相應(yīng)的儀器和試劑的商品化發(fā)展導(dǎo)致real-timeQ-PCR方法在研究工作中的運(yùn)用。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。溫州...
引物的設(shè)計(jì)對于這個(gè)實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要,因?yàn)镽eal-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應(yīng)的對引物設(shè)計(jì)的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點(diǎn)必須注意:1,引物的錯(cuò)配率(引物錯(cuò)配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進(jìn)去,結(jié)果導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的誤差很大,重復(fù)性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時(shí)候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時(shí)候能分開,所以這就造成整個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果誤差很大,不可信)。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同。深圳血液定量PCR方案Real-time PCR:基線(bas...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉(zhuǎn)基因動植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達(dá)差異分析:例如比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達(dá)差異(如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等),特定基因在不同時(shí)相的表達(dá)差異以及cDNA晶片或差顯結(jié)果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)現(xiàn)了每一輪循環(huán)均檢測一次熒光信號的強(qiáng)度。莆田微量數(shù)字PCR供應(yīng)商聚合酶鏈?zhǔn)?..
聚合酶鏈反應(yīng)注意事項(xiàng):在實(shí)驗(yàn)過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴(kuò)增,必須設(shè)陰性對照;內(nèi)參的設(shè)定主要為了用于靶RNA的定量。常用的內(nèi)參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應(yīng)體系中擴(kuò)增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進(jìn)入平臺期,出現(xiàn)平臺效應(yīng)與所擴(kuò)增的目的基因的長度、序列、二級結(jié)構(gòu)以及目標(biāo)DNA起始的數(shù)量有關(guān)。故對于每一個(gè)目標(biāo)序列出現(xiàn)平臺效應(yīng)的循環(huán)數(shù),均應(yīng)通過單獨(dú)實(shí)驗(yàn)來確定;防止DNA的污染:采用DNA酶處理RNA;在可...
引物的設(shè)計(jì)對于這個(gè)實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要,因?yàn)镽eal-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應(yīng)的對引物設(shè)計(jì)的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點(diǎn)必須注意:1,引物的錯(cuò)配率(引物錯(cuò)配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進(jìn)去,結(jié)果導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的誤差很大,重復(fù)性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時(shí)候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時(shí)候能分開,所以這就造成整個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果誤差很大,不可信)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。南通特殊樣...
Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的常見問題:靶序列變異:如靶序列發(fā)生突變或缺失,影響引物與模板特異性結(jié)合,或因靶序列某段缺失使引物與模板失去互補(bǔ)序列,其PCR擴(kuò)增是不會成功的。假陽性:出現(xiàn)的PCR擴(kuò)增條帶與目的靶序列條帶一致,有時(shí)其條帶更整齊,亮度更高。引物設(shè)計(jì)不合適:選擇的擴(kuò)增序列與非目的擴(kuò)增序列有同源性,因而在進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),擴(kuò)增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計(jì)引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶:PCR擴(kuò)增有時(shí)出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差,dNTP濃度過高,Mg2+濃度過高,退火溫度過低,循環(huán)次數(shù)過多引起。其對...
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)生物學(xué)研究的歷史中占據(jù)了重要的地位。以此為基礎(chǔ)發(fā)展出包括Real-time PCR在內(nèi)的多項(xiàng)應(yīng)用技術(shù)。自誕生后Real-time PCR技術(shù)持續(xù)發(fā)展,從簡單的增擴(kuò)到整個(gè)PCR過程,Real-time PCR表現(xiàn)出比PCR更敏感、更明確的定量分析特性和對識別等位基因的能力。不少人以為real-time就是意味著可以在顯示器上看到每個(gè)循環(huán)增擴(kuò)曲線的增長。事實(shí)并非如此,早期的軟件不能在運(yùn)行期間提供可視化的增擴(kuò)曲線。主要是因?yàn)镾DS軟件采用整個(gè)平臺較終的數(shù)據(jù)執(zhí)行數(shù)據(jù)分析工作,而不是分析每個(gè)單獨(dú)的反應(yīng)循環(huán)。對某些設(shè)備來說,必須向分析軟件提供實(shí)時(shí)的數(shù)據(jù),有些設(shè)備則不需要。前一種設(shè)備允許軟件實(shí)...
Real-time PCR的染料法和探針法的選擇:進(jìn)行mRNA表達(dá)量的測定,采用染料法是比較經(jīng)濟(jì)實(shí)惠的;染料法可以通過比較熔解曲線的熔解峰位置得到產(chǎn)物特異性的情況;目的基因和內(nèi)參基因分管檢測,染料法可以選用Realtime染料PCRPreMIX,探針法主要應(yīng)用于病毒RNA的檢測;以及單位點(diǎn)突變(SNP);多基因的合并檢測,探針法還可用于同一個(gè)反應(yīng)中同時(shí)檢測目的基因和內(nèi)參基因的情況;而染料法則必須分管檢測。Real-time PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-timequantitativePolymeraseChainReaction簡稱Real-time PCR)是在定性PCR技術(shù)基...
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時(shí)退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應(yīng)是通過新的雜合聚合酶實(shí)現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下...
Real-time PCR操作流程:1、收集樣品。2相關(guān)試劑總RNA提取試劑TREzolReagent(RNA提取試劑),M-MLV(cDNA逆轉(zhuǎn)錄酶),RNA純化試劑,RealqPCRMasterMix(螢光定量PCR預(yù)混試劑)。3實(shí)驗(yàn)儀器螢光定量PCR儀;PCR儀;低溫離心機(jī)。4總RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的離心管中加入1µl模板總RNA(1µg/µl);Real-time PCR操作流程:2µl隨機(jī)引物(T18,10pmol/ul);2µl10mMdNTPmix;加水至15µl體系。混勻后70℃變性RNA...
Real-time PCR-傳統(tǒng)定量PCR:1)內(nèi)參照法:在不同的PCR反應(yīng)管中加入已定量的內(nèi)標(biāo)和引物,內(nèi)標(biāo)用基因工程方法合成。上游引物用熒光標(biāo)記,下游引物不標(biāo)記。在模板擴(kuò)增的同時(shí),內(nèi)標(biāo)也被擴(kuò)增。在PCR產(chǎn)物中,由于內(nèi)標(biāo)與靶模板的長度不同,二者的擴(kuò)增產(chǎn)物可用電泳或高效液相分離開來,分別測定其熒光強(qiáng)度,以內(nèi)標(biāo)為對照定量待檢測模板。2)競爭法:選擇由突變克隆產(chǎn)生的含有一個(gè)新內(nèi)切位點(diǎn)的外源競爭性模板。在同一反應(yīng)管中,待測樣品與競爭模板用同一對引物同時(shí)擴(kuò)增(其中一個(gè)引物為熒光標(biāo)記)。實(shí)時(shí)熒光定量PCR通過內(nèi)參或者外參法對待測樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。常州特殊樣本定量PCR原理Real-...
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng),是一項(xiàng)利用DNA雙鏈復(fù)制的原理,在生物體外復(fù)制特定DN段的核酸合成技術(shù)。透過這項(xiàng)技術(shù),可在短時(shí)間內(nèi)大量擴(kuò)增目的基因,而不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。聚合酶鏈反應(yīng)是是一種簡單,廉價(jià)和可靠的方法復(fù)制DN段,這個(gè)概念適用于現(xiàn)物學(xué)和相關(guān)科學(xué)的許多領(lǐng)域。PCR可能是分子生物學(xué)中使用很較廣的技術(shù)。這種技術(shù)被用于生物醫(yī)學(xué)研究,犯罪取證和分子考古學(xué)。通常,PCR由一系列20-40次重復(fù)的溫度變化組成,稱為熱循環(huán),每個(gè)循環(huán)通常由兩個(gè)或三個(gè)離散的溫度步驟組成。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)有效地解決了傳統(tǒng)定量只能終點(diǎn)檢測的局限。上海血液R...
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性的產(chǎn)生。污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,或標(biāo)本放置時(shí),由于密封不嚴(yán)溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染;標(biāo)本核酸模板在提取過程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,導(dǎo)致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來繪制基因中外顯子和內(nèi)...
PCR的反應(yīng)條件:dNTP濃度過高會加快反應(yīng)速度,但同時(shí)還可以增加堿基的錯(cuò)誤摻入率。引物濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增。TaqDNA聚合酶濃度過高會引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,低則合成產(chǎn)物量減少。TaqDNA聚合酶無校正功能,摻入錯(cuò)誤率達(dá)2*E-4個(gè)核苷酸,一個(gè)30個(gè)循環(huán)的擴(kuò)增反應(yīng)0.1%-0.25%總錯(cuò)誤率。在90~95度下可使整個(gè)基因組的DNA變性為單鏈。一般94~95度30~60s。時(shí)間過長使TaqDNA聚合酶失活和dNTP破壞增多。DNA很快冷卻到40~60度使引物和模板結(jié)合。引物長度在15~25時(shí)退火溫度。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應(yīng)是通過新的雜合聚合酶實(shí)現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下...
引物的設(shè)計(jì)對于這個(gè)實(shí)驗(yàn)至關(guān)重要,因?yàn)镽eal-time PCR的檢測靈敏度比較高,所以相應(yīng)的對引物設(shè)計(jì)的要求就很高。普通的要求規(guī)則大家都知道,還有幾點(diǎn)必須注意:1,引物的錯(cuò)配率(引物錯(cuò)配形成引物二聚體,但是SYBR照樣能嵌入進(jìn)去,結(jié)果導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的誤差很大,重復(fù)性也不好)。2,引物的特異性一定要高(不像常規(guī)PCR,引物同源性不高,只要兩條產(chǎn)物的片段長度相差足夠大,在電泳的時(shí)候能夠區(qū)分開就可以。Real-time PCR只有在熔解曲線的時(shí)候能分開,所以這就造成整個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果誤差很大,不可信)。Real-time PCR探針法具有高適應(yīng)性和可靠性。連云港組織熒光PCRReal-timePCR的反應(yīng)條...
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:陽性對照,在建立PCR反應(yīng)實(shí)驗(yàn)室及一般的檢驗(yàn)單位都應(yīng)設(shè)有PCR陽性對照,它是PCR反應(yīng)是否成功、產(chǎn)物條帶位置及大小是否合乎理論要求的一個(gè)重要的參考標(biāo)志。陽性對照要選擇擴(kuò)增度中等、重復(fù)性好,經(jīng)各種鑒定是該產(chǎn)物的標(biāo)本,如以重組質(zhì)粒為陽性對照,其含量宜低不宜高(100個(gè)拷貝以下)。但陽性對照尤其是重組質(zhì)粒及高濃度陽性標(biāo)本,其對檢測或擴(kuò)增樣品污染的可能性很大。因而當(dāng)某一PCR試劑經(jīng)自己使用穩(wěn)定。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略。深圳血液熒光定量PCR原理Real-time PCR實(shí)驗(yàn)常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEP...
Real-time PCR:1.DNA或RNA的定量分析:Real-time PCR包括病原微生物或病毒含量的檢測,轉(zhuǎn)基因動植物轉(zhuǎn)基因拷貝數(shù)的檢測,RNAi基因失活率的檢測等;2.基因表達(dá)差異分析:例如比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達(dá)差異(如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等),特定基因在不同時(shí)相的表達(dá)差異以及cDNA晶片或差顯結(jié)果的確證;3.基因分型:例如SNP檢測,甲基化檢測等。Real-time PCR常用的兩種方法分別為Sybrgreen(螢光染料摻入法)和Taqmanprobe(探針法)。實(shí)時(shí)設(shè)備的軟件能使收集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行正常化處理來彌補(bǔ)背景熒光的差異。莆田組織熒光定量PCR技術(shù)服...
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):因?yàn)镻CR擴(kuò)增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對于法醫(yī)檢定法,當(dāng)時(shí)只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應(yīng)也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應(yīng)的技術(shù)已經(jīng)成功地應(yīng)用于動物身上,例如四萬年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)方法混淆)允許估計(jì)樣品中存在的給定序列的量——這種技術(shù)通常用于定量確定基因表達(dá)的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測量每輪PCR擴(kuò)增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。實(shí)時(shí)熒光定量PCR是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以...