聚合酶鏈反應允許快速生產短DN段，即使已知的引物序列不超過兩個。聚合酶鏈反應的這種能力增強了許多方法，例如生成雜交 探針用于 Southern 或northern blot 雜交。聚合酶鏈反應為這些技術提供了大量的純DNA，有時是單鏈的，甚至可以從非常少量的起始材料中進行分析。脫氧核糖核酸測序的任務也可以通過聚合酶鏈反應來輔助完成。已知的DN段可以很容易地從患有遺傳疾病突變的患者體內產生。對擴增技術的修飾可以從完全未知的基因組中提取片段，或者可以產生感興趣區域的單鏈。聚合酶鏈反應有許多應用于傳統的 DNA克隆。它可以從更大的基因組中提取片段以插入載體，這可能只有少量可用。使用一組“載體引物”，它還可以分析或提取已經插入載體的片段。聚合酶鏈反應方案的一些改變可以產生突變(通用的或定點的)插入片段。PCR的很大特點是能將微量的DNA大幅增加。鹽城微量Real-time PCR

聚合酶鏈反應同時擴增單個精子中幾個基因座的能力]增強了極大地增強了通過研究減數分裂后染色體交叉來進行基因定位的傳統任務。通過分析數千個單個精子，已經直接觀察到非常緊密基因座之間罕見的交叉事件。類似地，可以分析異常的缺失、插入、易位或倒位，所有這些都無需等待(或支付)漫長而艱苦的受精、胚胎發生等過程。定點突變：聚合酶鏈反應可用于產生突變基因，突變由科學家隨意選擇。可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的，并改變或改善蛋白質功能。鹽城微量Real-time PCR在嵌套聚合酶鏈反應中，除了預期的靶之外，該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。

聚合酶鏈反應：熱啟動聚合酶鏈式反應:一種在PCR的初始建立階段減少非特異性擴增的技術。它可以通過將反應組分加熱到變性溫度(例如95 c)在加入聚合酶。[36]已經開發了特殊的酶系統，通過結合抗體來抑制聚合酶在環境溫度下的活性[37][37]或者通過共價鍵結合的抑制劑的存在，該抑制劑在高溫活化步驟后解離。熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現的，這些酶在環境溫度下不活躍，在伸長溫度下立即。序列間特異性聚合酶鏈反應(ISSR):一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法，它放大簡單重復序列之間的區域，以產生擴增片段長度的獨特指紋。電子聚合酶鏈反應(數字聚合酶鏈反應、虛擬聚合酶鏈反應、電子聚合酶鏈反應、電子聚合酶鏈反應)是指計算工具使用給定的一組引物 ( 探針)來擴增來自測序的基因組或轉錄組的DNA 序列，用于計算理論聚合酶鏈反應結果。電子PCR被提出作為分子生物學的教育工具。

聚合酶鏈反應：嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景，提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續的PCR。在個反應中，一對引物用于產生DNA產物，除了預期的靶之外，該產物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產物用于第二次聚合酶鏈反應，所述引物的結合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物，并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統PCR更成功，但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術。它用于連接含有基因、調節序列或突變的DN段；這項技術可以創造特定的長DNA構建體。它還可以將缺失、插入或點突變引入DNA序列。聚合酶鏈反應五要素：參加PCR反應的物質主要有五種即：引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。

聚合酶鏈式反應是80年代中期發展起來的體外核酸擴增技術。工具/原料：擴增緩沖液，四種dNTP，引物，模板DNA，Taq DNA聚合酶， Mg離子，蒸餾水。模板DNA的變性：模板DNA經加熱至93℃左右一定時間后，使模板DNA雙鏈或經PCR擴增形成的雙鏈DNA解離，使之成為單鏈，以便它與引物結合，為下輪反應作準備；模板DNA與引物的退火(復性)：模板DNA經加熱變性成單鏈后，溫度降至55℃左右，引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結合；引物的延伸：DNA模板--引物結合物在TaqDNA聚合酶的作用下，以dNTP為反應原料，靶序列為模板，按堿基配對與半保留復制原理，合成一條新的與模板DNA 鏈互補的半保留復制鏈。重復循環變性--退火--延伸三過程，就可獲得更多的“半保留復制鏈”，而且這種新鏈又可成為下次循環的模板。聚合酶鏈式反應準備：引物內部不應出現互補序列。鹽城微量Real-time PCR

嵌套聚合酶鏈反應的兩組引物用于兩個連續的PCR。鹽城微量Real-time PCR

聚合酶鏈式反應：定量PCR允許實時定量和檢測特定的DNA序列，因為它在合成過程中測量濃度。有兩種方法可以同時檢測和定量。種方法是使用在DNA雙鏈之間非特異性保留的熒光染料。第二種方法涉及編碼特定序列并被熒光標記的探針。只有在探針與其互補DNA雜交后，才能使用這些方法檢測DNA。一種有趣的技術組合是實時PCR和逆轉錄。這種復雜的技術被稱為RT-qPCR，允許定量少量RNA。通過這種組合技術，mRNA被轉化為cDNA，并用qPCR進一步定量。這種技術降低了聚合酶鏈反應終點出錯的可能性，增加了檢測與遺傳疾病如病癥相關的基因的機會。實驗室使用RT-qPCR來靈敏地測量基因調控。鹽城微量Real-time PCR

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