1955年，新疆維吾爾自治區轄1行政區、8專區、5自治州、1省轄市，2市、74縣、6自治縣。
縣級以上行政區劃一覽
烏魯木齊市
烏魯木齊專區 專署駐烏魯木齊市 8縣、1自治縣
阜康縣（城區） 鄯善縣（城區） 奇臺縣（城區） 呼圖壁縣（城區） 吐魯番縣（城區）
吉木薩爾縣（城區） 瑪納斯縣（城區） 托克遜縣（城區） 木壘河哈薩克自治縣（城區）
哈密專區 專署駐哈密縣 2縣、1自治縣
哈密縣（城區） 伊吾縣（城區） 巴里坤哈薩克族自治縣（城區）
庫爾勒專區 專署駐庫爾勒縣 5縣
庫爾勒縣（城區） 尉犁縣（城區） 輪臺縣（城區） 婼羌縣（城區） 且末縣（城區）
南疆行政公署 駐喀什市
★行政公署直轄單位 1市、6縣、1自治縣
喀什市
疏附縣（城區） 疏勒縣（城區） 巴楚縣（城區） 英吉沙縣（城區） 岳普湖縣（城區）
伽師縣（城區） 塔什庫爾干塔吉克自治縣（城區）
★莎車專區 專署駐莎車縣 4縣
莎車縣（城區） 澤普縣（城區） 葉城縣（城區） 麥蓋提縣（城區）
★和闐專區 專署駐和闐縣 7縣
和闐縣（城區） 策勤縣（城區） 皮山縣（城區） 民豐縣（城區） 洛浦縣（城區）
于闐縣（城區） 墨玉縣（城區）
★阿克蘇專區 專署駐阿克蘇縣 9縣
阿克蘇縣（城區） 庫車縣（城區） 沙雅縣（城區） 烏什縣（城區） 新和縣（城區）
阿瓦提縣（城區） 溫宿縣（城區） 柯坪縣（城區） 拜城縣（城區）
★克孜勒蘇柯爾克孜自治州 駐阿圖什縣 4縣
阿圖什縣（城區） 烏恰縣（城區） 阿合奇縣（城區） 阿克陶縣（城區）
昌吉回族自治州 駐昌吉縣 3縣
昌吉縣（城區） 米泉縣（城區） 烏魯木齊縣（城區）
巴音郭楞蒙古自治州 駐焉耆回族自治縣 2縣、1自治縣
和靖縣（城區） 和碩縣（城區）
焉耆回族自治縣（城區）
伊犁哈薩克自治州 駐伊寧市
★自治州直轄單位 1市、8縣、1自治縣
伊寧市
伊寧縣（吉里圩） 特克斯縣（城區） 綏定縣（城區） 昭蘇縣（城區） 新源縣（城區）
鞏留縣（城區） 霍城縣（城區） 尼勒克縣（城區） 察布查爾錫伯族自治縣（城區）
★塔城專區 專署駐塔城縣 6縣、1自治縣
塔城縣（城區） 沙灣縣（三道灣子）額敏縣（城區） 烏蘇縣（城區） 裕民縣（城區）
托里縣（城區） 和布克賽爾蒙古自治縣（城區）
★阿勒泰專區 專署駐阿勒泰縣 7縣
阿勒泰縣（城區） 福海縣（城區） 吉木乃縣（城區） 青河縣（城區） 哈巴河縣（城區）
富蘊縣（城區） 布爾津縣（城區）
★博爾塔拉蒙古自治州 駐博樂縣 3縣
博樂縣（城區） 精河縣（城區） 溫泉縣（城區）
縣級以上行政區劃變更情況
★設立新疆維吾爾自治區，撤銷新疆省，并以原新疆省的行政區域為新疆維吾爾自治區的行政區域。 (1955年9月13日全國人民代表大會常務委員會第21次會議決定) ，10月1日成立。
★1955年4月14日國務院批復：
關于蒲犁縣于1954年9月17日改為相當于縣的塔什庫爾干塔吉克族自治區，自治區人民政府駐原蒲犁縣城；巴里坤縣于1954年9月30日改為相當于縣的巴里坤哈薩克族自治區，自治區人民政府駐原巴里坤縣縣城；伊犁哈薩克族自治州人民委員會于1954年11月26日正式成立；均同意備案。但有以下兩點希考慮修正：
1. 所報伊犁哈薩克族自治州的行政地位“相當于行署一級”。根據憲法規定，自治州是一級地方行政區域，因此不能解釋為“相當于行署一級”。
2. 所報伊犁哈薩克族自治州“轄伊寧市、伊犁、塔城、阿勒泰3個專區及相當于專署級的博爾塔拉蒙古族自治區”。 博爾塔拉蒙古族自治區按照憲法規定應改為自治州，因此它應當是省的直轄單位；如目前由省直接領導有困難，可由省人民委員會委托伊犁哈薩克族自治州代管。
★伊寧市劃為伊犁哈薩克自治州轄市；喀什市仍為省轄市，改交劃歸南疆行署代為領導。（1955年5月28日國務院批準）
◎沙灣縣駐地由沙灣鎮遷至三道河子（國務院1955年7月1日批準）
◎伊寧縣駐地由伊寧市市區遷至吉里圩孜（國務院1955年7月1日批準）
★1955年11月21日國務院批準：
1. 同意成立阿克陶縣。將原屬塔什庫爾干塔吉克族自治縣第二、第四兩個區計7個鄉，英吉沙縣的第六、第七、第八3個區計19個鄉，疏勒縣塔什米里克區的第八鄉、沙依瓦克區的第五鄉、烏帕爾區的第十鄉，以及烏恰縣第三區的第六、第七兩個鄉，合計31個鄉，劃歸阿克陶縣領導。阿克陶縣人民委員會設在由英吉沙縣劃來的阿克陶。
2. 撤銷喀什專區，將疏附、疏勒、伽師、岳普湖、巴楚、英吉沙6個縣和塔什庫爾干塔吉克自治縣改南疆行政公署直接領導。
★同意在1955年12月底撤銷伊犁專員公署，并將所屬各縣劃歸伊犁哈薩克自治州直接領導。（1955年12月31日批國務院準）
◎疏附縣駐地由喀什市市區遷至疏附縣托庫札克巴鎮。