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來源: 發布時間:2023年01月09日

冷凍電鏡技術解析結構主要風險在:A.樣品很不穩定,樣品寄送過來的時候,已經降解或者聚集,無法進行后續處理;B.樣品在冷凍制樣的過程中,可能會被凍碎,從而無法進行后續處理;C.樣品純度可能很好,但是均一度很差,從而難以獲得樣品的高分辨結構;D.我們關心的區域可能在整個復合體中有很強的柔性,從而經過二維或者三維平均后,我們關心區域的分辨率會比較差甚至看不見,達不到我們的預期;E.一些配體,比如藥物前體分子,分子量太小,不一定能在電鏡的密度圖中觀測到;F.對于合適的樣品,我們冷凍制樣需要優化的參數有很多,包括樣品濃度的優化,blottime的優化,溫度的優化,grid規格(銅網或者金網)的優化等一系列條件的優化。因此冷凍電鏡制樣需要豐富的經驗和充足的機時支持,不同的實驗者,成功率可能差別很大。冷凍電鏡技術測定結構的幾種方法:X射線晶體學、NMR、和冷凍電鏡技術。無錫TEM技術平臺

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單顆粒冷凍電鏡技術的圖像處理技術:經過多年的發展,目前冷凍電鏡的數據處理部分主要包含了以下的流程:(1)襯度傳遞函數的修正(CTFcorrection);(2)樣品分子投影數據的篩選(particleselection);(3)二維投影數據的分類和降噪(2Danalysis);(4)三維模型的重構和優化(3Dreconstructionandrefinement);(5)多重構象的結構分析(heterogeneityanalysis);(6)對重建結構分辨率的分析(structureresolutionassessment);(7)結合生物化學原理和實驗數據對三維結構的解讀(modelinterpretationandvalidation)。無錫TEM技術平臺冷凍電子顯微鏡技術之樣品成像:低劑量輻照成像,普通樣品材料在進行表征時,電子劑量越高成像質量越好。

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什么是冷凍電鏡技術?冷凍電鏡技術,全稱是冷凍電子顯微鏡技術,是在低溫下使用透射電子顯微鏡觀察樣品的顯微技術。冷凍電鏡技術,是一種重要的結構生物學研究方法,它與X射線晶體學、核磁共振一起構成了高分辨率結構生物學研究的基礎。冷凍電鏡技術的研究,主要是冷凍成像和蛋白快速冷凍技術。根據諾貝爾獎評委會的說法,冷凍電鏡技術使生物分子成像,變得更加簡單,把生物化學帶入了一個新紀元。這項技術可以用來確定,溶液中生物分子的高清晰度結構。冷凍電鏡技術其實比較抽象,一直以來它主要的問題是其圖像噪音極高、信號極低,研究的目標是從中提取近原子分辨率的結構信息。可以形象的比喻為在一個機器轟鳴的工廠,監測一只螞蟻爬行的聲音。冷凍電鏡的目標,就是要完成這項艱巨的任務。因此,可見這項技術成果的科學價值。

冷凍電鏡技術,是用于掃描電鏡的很低溫冷凍制樣及傳輸技術(Cryo-SEM),可實現直接觀察液體、半液體及對電子束敏感的樣品,如生物、高分子材料等。電鏡觀察:樣品經過很低溫冷凍、斷裂、鍍膜制樣(噴金/噴碳)等處理后,通過冷凍傳輸系統放入電鏡內的冷臺(溫度可至-185℃)即可進行觀察。其中,快速冷凍技術可使水在低溫狀態下呈玻璃態,減少冰晶的產生,從而不影響樣品本身結構,冷凍傳輸系統保證在低溫狀態下對樣品進行電鏡觀察。冷凍電鏡技術中單顆粒分析法優點:樣品受總輻射值小;對稱顆粒的解析分辨率更高。

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冷凍電子顯微技術學解析生物大分子及細胞結構的中心是透射電子顯微鏡成像,包括樣品制備、圖像采集、圖像處理及三維重構等幾個基本步驟。三維重構:數據處理的較終目的是為了獲得生物樣品的三維質量密度圖,由二維圖像推知三維結構的方法即三維重構。其理論原理是在1968年由DeRosier和Klug提出的中心截面定理:一個函數沿某方向投影函數的傅里葉變換等于此函數的傅里葉變換通過原點且垂直于此投影方向的截面函數。由于樣品性質的不同,圖像分析的方法也有差異。冷凍電鏡技術的獨特優勢:它與X射線晶體學、核磁共振一起構成了結構生物學研究的基礎。無錫TEM技術平臺

冷凍電鏡技術中的單顆粒分析法理論成像分辨率更高。無錫TEM技術平臺

冷凍電子顯微鏡技術之樣品成像:低劑量輻照成像,普通的樣品材料在進行TEM表征時,電子劑量越高,成像質量越好。但生物樣品受到的輻照損傷卻是和累積的輻照總劑量相關的。更詳細一點說,隨著輻照劑量的增加,輻照損傷對高分辨細節的破壞更嚴重。因此,為了盡可能地獲得更多的細節,就必須要對樣品采用用低劑量輻照成像。在冷凍電鏡技術中,常用的低劑量輻照成像法有兩種:冷凍電子斷層掃描法,單顆粒分析成像法。冷凍電鏡技術中的電子斷層掃描技術(cryogeniccomputedtomography):進行斷層掃描時,樣品被連續不停地旋轉,并在每個旋轉角度上都進行一次成像。每一幅電子顯微像是物體在不同投影方向的二維投影像,經傅立葉變換會得到一系列不同取向的截面,當截面足夠多時,會得到傅立葉空間的三維信息,再經傅立葉反變換便能得到物體的三維結構。無錫TEM技術平臺

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