與IdeS不同，為了獲得更均勻的度拉糖肽融合蛋白的消化產物，用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白質消化該蛋白質，該蛋白由與瓊脂糖珠共價偶聯的GlySERIAS酶組成。通過將酶偶聯到樹脂上，可以增加酶與蛋白質的比率，從而可以進一步加速反應，以獲得更完整的連接子消化。此外，該酶不會存在于樣品制備中，可能會干擾樣品分析。為了進行比較，度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化過夜，或用GlySERIAS凍干1小時并在37°C下過夜消化。 為了降低樣品復雜性，使用內切糖苷酶GlycINATOR凍干去除Fc聚糖，并減少鏈間二硫鍵。通過反相LC-MS對樣品的分析表明，GlySERIAS Immobilized幾乎完全消化了Fc結構域中的連接子，留下了接近均質的Fc/2產物，其中含有來自連接子的一個絲氨酸殘基。用 GlySERIAS 凍干 1 小時或過夜消化，兩者都會產生幾種 Fc 產物，并附著不同數量的絲氨酸和甘氨酸殘基。GLP-1肽在所有三個樣品中以兩種變體存在。使用GlySERIAS固定化消化的均質Fc/2能夠詳細研究特定于Fc區域的質量屬性。此外，在樣品中未觀察到干擾分析的酶峰。作為補充，Fc/2 產物在用 GlySERIAS 凍干消化后殘留部分連接子，有助于研究位于 GS 連接子的修飾。為Fc聚糖分析提供了一種快速、直接的、自動化，高通量的替代方法。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶，可在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1，在兩小時內產生完整的 Fab 和 Fc 片段，無需還原條件。該酶對具有突變鉸鏈區域的抗體（如 LALA 突變）具有活性，并啟用中級 LC-MS 來表征具有突變鉸鏈的抗體的關鍵質量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個消化位點是人 IgG1 的三維結構的結果，使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，則Fc上暴露的賴氨酸處可能會出現額外的消化位點。FabDELLO在天然條件下具有活性，需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達。該酶含有 His 標簽，分子量為 32 kDa。陜西GlySERIASIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶通過將酶偶聯到樹脂上，可以增加酶與蛋白質的比率，從而可以進一步加速反應，以獲得更完整的蛋白質的消化。

與IdeS不同，Genovis的GlySERIAS是一種獨特的酶，可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白連接子，例如Gly4Ser和GlyxSery（GS）以及聚甘氨酸（G）接頭。該酶能夠分離多功能融合蛋白的各個結構域，以促進表征并增加對這些分子的理解。融合蛋白的中級分析既可以降低整體樣品的復雜性，又可以對翻譯后修飾進行結構域特異性鑒定和監測。為了改善連接子的去除，Genovis建議使用GlySERIASImmobilized。對于連接子表征，我們推薦GlySERIAS凍干。具有柔性接頭的獨特酶消化融合蛋白；中級方法可降低融合蛋白表征的復雜性；復雜融合蛋白的可靠且可重復的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和絲氨酸殘基的重復序列組成的柔性連接子。該酶在天然反應條件下具有活性，能夠對復雜的融合蛋白進行中級表征。連接子區域同時在多個位點被消化，導致先前連接的組分分離。活性發生在pH7.6下，孵育時間可以根據所需的產物而變化。GlySERIAS是從噬菌體K克隆而來的，在大腸桿菌中表達。該酶含有His標簽，分子量為18kDa。

為什么客戶想在他們的工作試用Genovis的FabRICATOR（IdeS）。FabRICATOR的高特異性(在鉸鏈下方有單個消化位點)以及它對IgG種和亞類表現出活性的事實使其成為高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大優勢是速度。在大多數IgG上，您可以在短短30分鐘內生成F(ab’)2和Fc/2片段，這一速度簡化了方法開發，并允許快速有效的中層表征，使客戶能夠在不比做完整質量實驗長太多的時間內獲得更多關于分子的信息。Genovis發現更多的緩沖液與溶液中的FabRICATOR消解相容（更多信息）。Genovis已經測試了PBS和150mM醋酸銨，pH7，結果良好。并且應該也適用于FabRICATORHPLC。然而，緩沖液的離子強度會影響抗體片段在FabRICATORHPLC（IdeS）色譜柱上的保留，并且IgG1亞基需要至少100-150mM鹽才能洗脫為單個窄峰。其他IgG亞類或融合蛋白可能需要對緩沖液組成進行一些優化。可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產生均質的 F（ab'）2 和 Fc 片段。

與肽圖譜相比，根據Genovis科學家的經驗，尤其是對于像抗體這樣的分子，許多人在常規實驗中做了太多的肽圖譜，而中級水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺方法，同樣的方法適用于絕大多數的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優化整個樣品制備，LC分離，質譜設置和數據分析的每個不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數據分析的簡單性，中級方法非常適合自動化和高通量的工作流程。肽圖當然可以自動用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數據，仍然需要徹底分析。事實上，肽圖譜是一個多步驟的過程，每一個步驟都可能破壞方法，并可能導致破壞蛋白質的人工制品，很難交叉訓練給非專業人員。中級水平的方法很容易交叉訓練，我們的方法在質量控制實驗室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。工藝開發和潛在生物制藥穩定性研究相關的大量樣品。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學

使用GlySERIAS固定化酶和內切糖苷酶GlycINATOR消化度拉糖肽。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學

Genovis將固定化酶固定在磁珠上，用于在鉸鏈下方自動消化IgG。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產生均質的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。這些微球能夠在中級表征工作流程中并行快速自動酶解多種抗體。它們專為自動化平臺而設計，但在無法實現自動化的情況下，在振動臺上的表現同樣出色。酶切消解后，樣品可直接轉移到LC-MS的自動進樣器進行快速色譜分析，或轉移到其他分析方法進行分析。自動平行抗體酶切和亞基生成允許處理與克隆選擇、工藝開發和潛在生物制藥穩定性研究相關的大量樣品。自動抗體亞基分析可減少操作人員的時間和樣品處理錯誤的風險，并提高通量。北京GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學