不同于IdeS,Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶,可在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1,在兩小時(shí)內(nèi)產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段,無需還原條件。該酶對(duì)具有突變鉸鏈區(qū)域的抗體(如 LALA 突變)具有活性,并啟用中級(jí) LC-MS 來表征具有突變鉸鏈的抗體的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人 IgG1 (...KSCDK / THTCPPCP...),生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個(gè)消化位點(diǎn)是人 IgG1 的三維結(jié)構(gòu)的結(jié)果,使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,則Fc上暴露的賴氨酸處可能會(huì)出現(xiàn)額外的消化位點(diǎn)。FabDELLO在天然條件下具有活性,需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細(xì)菌克隆而來的,并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽,分子量為 32 kDa。Genovis提供FabRICATOR (IdeS)驗(yàn)證包。三種不同批次的凍干酶,用于驗(yàn)證基于FabRICATOR的分析方法。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶
與IdeS不同。Genovis的IgASAPSub1是一種IgA1特異性酶,可在鉸鏈上方的一個(gè)特定位點(diǎn)消化人IgA1,產(chǎn)生完整且均質(zhì)的Fab和Fc片段。IgASAPSub1可水解分泌物和血清IgA1。消化在1小時(shí)內(nèi)完成,并且由于酶的特異性,如果孵育時(shí)間延長,則不存在過度消化的風(fēng)險(xiǎn)。該酶在pH值6.5至8.0下具有活性,不需要還原條件或輔助因子即可發(fā)揮活性。活性是在37°C下,但也可以在室溫下使用增加孵育時(shí)間進(jìn)行消化。IgASAPSub1是從口腔鏈球菌克隆而來的,并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有His標(biāo)簽,分子量為148kDa。IgASAPSub1凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在1000個(gè)單位的小瓶中,用于消化1mgIgA1。GingisKHANIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)如Thermo Scientific? KingFisher? ;在振動(dòng)臺(tái)上也能同樣出色地工作。
蛋白酶用于生成肽,用于質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)。這些應(yīng)用包括蛋白質(zhì)組學(xué)和生物制藥的深度表征。由于遺漏了切割和樣品制備誘導(dǎo)的偽影,傳統(tǒng)的蛋白酶并不總是理想的,因此需要具有不同特異性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一種精氨酸特異性蛋白酶,可將蛋白質(zhì) C 末端消化為精氨酸殘基。與胰蛋白酶肽相比,所得肽更長,并可能導(dǎo)致序列覆蓋率增加。質(zhì)譜分析中蛋白酶的特異性對(duì)于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集和避免復(fù)雜的數(shù)據(jù)解釋至關(guān)重要。作為模型底物,使用胰島素氧化β鏈來比較 GingisREX 和 ArgC 的酶特異性。胰島素氧化β鏈含有一個(gè)精氨酸和一個(gè)賴氨酸殘基。在RP-HPLC和質(zhì)譜法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在賴氨酸殘基上沒有酶活性或其他額外活性,即使在長時(shí)間孵育過夜后,酶與底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸殘基上顯示出主要活性,但在賴氨酸殘基上也可以看到酶消化。在酶與底物的比例為 1:20 和過夜孵育下,證明了 ArgC 的額外非特異性活性。在相同條件下,GingisREX未檢測(cè)到這種情況。數(shù)據(jù)證實(shí)了GingisREX精氨酸殘基的特異性活性,并顯示使用Arg-C在賴氨酸和其他殘基處的非特異性消化。
大多數(shù)zhiliao性抗體都攜帶人IgG1骨架,雙特異性和多特異性形式的開發(fā)正在迅速增加。此類抗體的分析需要特異性酶來表征特性,例如單價(jià)結(jié)合、二硫鍵擾亂和配對(duì)Fc糖基化。傳統(tǒng)方案包括使用木瓜蛋白酶和Lys-C的酶消化,這需要優(yōu)化以極大限度地減少過度消化并獲得足夠的產(chǎn)量。Genovis的FabDELLO與IdeS酶具有不同的特異性,它在鉸鏈上方的單個(gè)位點(diǎn)消化人IgG1,并產(chǎn)生完整的Fab和Fc片段。為了證明FabDELLO的特異性活性,通過非還原SDS-PAGE消化和分析了IgG1和Fc融合蛋白的選擇。所有底物均實(shí)現(xiàn)了完全消化,包括具有其他困難的LALA和LFLE突變的IgG1。FabDELLO酶在底物上的精確和有效性能驗(yàn)證了其在生物制藥開發(fā)中的用途。Genovis的FabRICATOR(IdeS)酶將ADC(基于 IgG)消化成其亞基,用于表征這類復(fù)雜的藥物。
與IdeS不同,為了獲得更均勻的度拉糖肽融合蛋白的消化產(chǎn)物,用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白質(zhì)消化該蛋白質(zhì),該蛋白由與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的GlySERIAS酶組成。通過將酶偶聯(lián)到樹脂上,可以增加酶與蛋白質(zhì)的比率,從而可以進(jìn)一步加速反應(yīng),以獲得更完整的連接子消化。此外,該酶不會(huì)存在于樣品制備中,可能會(huì)干擾樣品分析。為了進(jìn)行比較,度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化過夜,或用GlySERIAS凍干1小時(shí)并在37°C下過夜消化。 為了降低樣品復(fù)雜性,使用內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR凍干去除Fc聚糖,并減少鏈間二硫鍵。通過反相LC-MS對(duì)樣品的分析表明,GlySERIAS Immobilized幾乎完全消化了Fc結(jié)構(gòu)域中的連接子,留下了接近均質(zhì)的Fc/2產(chǎn)物,其中含有來自連接子的一個(gè)絲氨酸殘基。用 GlySERIAS 凍干 1 小時(shí)或過夜消化,兩者都會(huì)產(chǎn)生幾種 Fc 產(chǎn)物,并附著不同數(shù)量的絲氨酸和甘氨酸殘基。GLP-1肽在所有三個(gè)樣品中以兩種變體存在。使用GlySERIAS固定化消化的均質(zhì)Fc/2能夠詳細(xì)研究特定于Fc區(qū)域的質(zhì)量屬性。此外,在樣品中未觀察到干擾分析的酶峰。作為補(bǔ)充,F(xiàn)c/2 產(chǎn)物在用 GlySERIAS 凍干消化后殘留部分連接子,有助于研究位于 GS 連接子的修飾。可精確定位特定的修飾。而無需肽圖分析,可以較少的手動(dòng)操作時(shí)間快速完成。黑龍江FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切
Genovis的FabULOUS來源于化膿性鏈球菌,在大腸桿菌中表達(dá),分子量為 29 kDa,該酶含有 His 標(biāo)簽。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶
為了讓所有實(shí)驗(yàn)室都能同時(shí)快速自動(dòng)消化多種抗體,Genovis的FabRICATORMagIC的設(shè)計(jì)具有靈活性,適用于一系列自動(dòng)化平臺(tái)。我們?cè)赥hermoScientific?KingFisher?純化系統(tǒng)上優(yōu)化了FabRICATORMagIC的工作流程,但它可以轉(zhuǎn)移到其他自動(dòng)化平臺(tái),如果沒有自動(dòng)化,在振動(dòng)臺(tái)上也能同樣出色地工作。消解后,將含有處理樣品的深孔板直接轉(zhuǎn)移到LC-MS的自動(dòng)進(jìn)樣器中進(jìn)行快速色譜分析,或轉(zhuǎn)移到其他分析方法進(jìn)行分析。FabRICATORMagIC與在消解緩沖液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容,以極大限度地減少自動(dòng)化系統(tǒng)中可能發(fā)生的純粹壓力。使用KingFisher儀器處理樣品時(shí),樣品制備非常簡單。將樣品、樹脂和緩沖液移液到指定的孔或板中,然后將板放入儀器中。設(shè)計(jì)用于FabRICATORMagIC的BindIt?協(xié)議將控制每個(gè)步驟的孵育溫度和時(shí)間。湖北FabULOUSIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶