Genovis的FabRICATOR MagIC自動樣品制備可用于分析和監測不同的CQA。mAb在生產或儲存過程中的氧化就是這樣一種CQA,可能會影響zhiliao產品的質量。為了展示FabRICATOR MagIC如何解決這個問題,對6種mAb的混合物進行強制降解(室溫下3個月),并通過反相LC-MS進行分析。當在完整水平上分析mAb時,可以檢測到mAb5豐度的顯著差異,同時出現許多新的峰。然而,無法獲得可靠的質量數據。使用FabRICATOR MagIC,mAb5變化的來源在Fab區域內。隨后還原為 Fc/2、LC 和 Fd' 片段,可以識別差異是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化,通過形成氧代內酯 (+14 Da) 和二氧代內酯 (+30 Da) 以及 mAb5 LC (-18 Da) 的琥珀酰亞胺化來揭示。此外,還可檢測到mAb3輕鏈的異構化。該示例說明了FabRICATOR MagIC在mAb中級分析中的強大功能,它創建的片段足夠小,可以精確定位特定的修飾,而無需耗時耗費資源的肽圖分析,所有這些都以相對較少的手動操作時間快速完成。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。山西FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白組學
與IdeS不同,融合蛋白是通過將兩種或多種蛋白質或肽的功能組合成一個量身定制的分子來創造的,以專門應對挑戰。連接此類蛋白質或肽結構域的常見方法是包含柔性連接子。這些連接子通常富含甘氨酸,例如甘氨酸殘基(G),或甘氨酸殘基散布絲氨酸殘基(GS)以形成重復序列。這為連接子提供了足夠的靈活性,不會干擾連接蛋白質結構域的功能。然而,這些新模式帶來了新的分析挑戰,需要新的工具來促進表征和產品質量監測。中級分析已成為分析單克隆抗體療法的標準方法,涉及將分子消化成幾個定義的亞基。它們足夠小,可以獲得高質量的質譜圖,并為產品質量屬性提供特定領域的信息。由于G和GS連接子對常見蛋白酶的降解具有抗性,因此很難分離結構域以進行深入分析。因此,Genovis開發了GlySERIAS,不同于IdeS酶,一種消化柔性富含甘氨酸的連接子的酶。GlySERIAS可以分離不同的功能域,并實現對融合蛋白、多特異性抗體和含有富含甘氨酸的連接子的各種mAb片段進行詳細表征的中級方法。山西FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白組學可用于抗體高階結構(HOS)結晶和NMR研究、雙抗或多抗的表征、單價結合研究或完整Fc聚糖分析。
為什么客戶想在他們的工作試用Genovis的FabRICATOR(IdeS)。FabRICATOR的高特異性(在鉸鏈下方有單個消化位點)以及它對IgG種和亞類表現出活性的事實使其成為高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大優勢是速度。在大多數IgG上,您可以在短短30分鐘內生成F(ab’)2和Fc/2片段,這一速度簡化了方法開發,并允許快速有效的中層表征,使客戶能夠在不比做完整質量實驗長太多的時間內獲得更多關于分子的信息。Genovis發現更多的緩沖液與溶液中的FabRICATOR消解相容(更多信息)。Genovis已經測試了PBS和150mM醋酸銨,pH7,結果良好。并且應該也適用于FabRICATORHPLC。然而,緩沖液的離子強度會影響抗體片段在FabRICATORHPLC(IdeS)色譜柱上的保留,并且IgG1亞基需要至少100-150mM鹽才能洗脫為單個窄峰。其他IgG亞類或融合蛋白可能需要對緩沖液組成進行一些優化。
與IdeS不同,Genovis的GlySERIAS是一種獨特的酶,可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白連接子,例如Gly4Ser和GlyxSery(GS)以及聚甘氨酸(G)接頭。該酶能夠分離多功能融合蛋白的各個結構域,以促進表征并增加對這些分子的理解。融合蛋白的中級分析既可以降低整體樣品的復雜性,又可以對翻譯后修飾進行結構域特異性鑒定和監測。為了改善連接子的去除,Genovis建議使用GlySERIASImmobilized。對于連接子表征,我們推薦GlySERIAS凍干。具有柔性接頭的獨特酶消化融合蛋白;中級方法可降低融合蛋白表征的復雜性;復雜融合蛋白的可靠且可重復的消化。Genovis的GlySERIAS酶切由甘氨酸或甘氨酸和絲氨酸殘基的重復序列組成的柔性連接子。該酶在天然反應條件下具有活性,能夠對復雜的融合蛋白進行中級表征。連接子區域同時在多個位點被消化,導致先前連接的組分分離。活性發生在pH7.6下,孵育時間可以根據所需的產物而變化。GlySERIAS是從噬菌體K克隆而來的,在大腸桿菌中表達。該酶含有His標簽,分子量為18kDa。Genovis的 IgG 特異性蛋白酶也以固定化酶提供。
與IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一種精氨酸特異性蛋白酶,可消化精氨酸殘基的C末端蛋白質,包括難以與其他酶消化的Arg-Pro鍵。該酶可用于肽圖分析、從頭肽測序和翻譯后修飾分析。精氨酸殘基的特異性C-末端消化;在其他困難的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;產生更長的肽-提高序列覆蓋率。GingisREX是一種半胱氨酸蛋白酶,可特異性地消化肽鍵C末端到精氨酸殘基,包括與脯氨酸相連的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。與胰蛋白酶消化相比,可生成更長的肽,胰蛋白酶消化可以通過高分辨率質譜進行分離和鑒定。這為自下而上方法的樣品制備提供了更多選擇,以實現替代的酶解曲線和更高的序列覆蓋率。GingisREX在賴氨酸上沒有活性,通常使用Arg-C觀察到。該酶在5.0-9.0的寬pH值范圍內具有活性,它需要半胱氨酸并被鹽酸胍抑制。該酶是從牙齦卟啉單胞菌中純化的。Genovis的GlySERIAS 是一種獨特的酶。山西FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白組學
Genovis將半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR(IdeS)固定在磁性瓊脂糖珠上,現在稱為FabRICATOR MagIC。山西FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白組學
在Genovis,我們的策略是幫助客戶進行中級(或亞基)分析,這是我們的工作,特別是我們的蛋白質酶切產品。完整質量和肽圖譜是蛋白質表征的常用方法,我們發現,與簡單但信息有限的完整質量和高度復雜但信息豐富的肽圖譜相比,中級方法具有優勢。通過執行中級描述,您可以生成從完整的質量實驗中獲得的所有信息,具有額外的優勢。在對抗體進行完整質量分析時,很難明確地識別某些修飾。質譜儀器正在改進,可以更有效地分析更大的分子,但通過使用我們的SmartEnzymes,如IdeS,可以將抗體分解成更小的片段,這提高了這些實驗可以執行的分辨率,因此,增加了鑒定修飾的信心。此外,你不僅能夠更好地識別修改,而且你能夠將它們定位到蛋白質上的單個結構域,這是你在完整水平上無法做到的。山西FabALACTICAIdeS蛋白酶蛋白組學