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湖南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

來源: 發布時間:2024年11月12日

用于水解β1-3,4-連接半乳糖的固定化酶在離心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯的GalactEXO酶,用于糖蛋白上β1-3,4-連接半乳糖的水解,而不會用酶污染z終制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. z終樣品中不含酶。GalactEXO 酶來源于 Akkermansia muciniphila 并重組表達,可有效水解 β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖。GalactEXO微離心柱經過格式化,可在30-60分鐘內水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。GalactEXO中的酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達。湖南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

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G0F 抗體在 30 分鐘內:半乳糖的存在會影響zhiliao性抗體引發的效應功能,為了研究抗體的作用方式,可能需要徹底去除半乳糖殘留物。Genovis的GalactEXO Immobilized 的 β1-4 半乳糖苷酶活性在曲妥珠單抗上使用 30 分鐘孵育證明。genovis的GalactEXO Immobilized 由強大的 GalactEXO 酶組成,該酶固定在瓊脂糖珠上,并以易于使用的微離心柱形式格式化。GalactEXO是β-半乳糖苷酶的混合物,可有效去除N-和O-糖基化蛋白上的半乳糖殘基。使用FabRICATOR?將抗體消化成亞基,并使用LC-MS進行分析。使用 GalactEXO 凍干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的轉變,但后者在z終制劑中沒有留下酶。沒有任何半乳糖基化結構表明半乳糖殘基完全水解,因此LC-MS數據中任何剩余的次要峰都可以注釋為亞基的糖化。沒有任何半乳糖基化結構表明半乳糖殘基完全水解,因此LC-MS數據中任何剩余的次要峰都可以注釋為亞基的糖化。云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶融合蛋白和其他糖基化蛋白上的 N 和簡單的粘蛋白型 O-聚糖。

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與PNGase F類似,Genvois的OmniGLYZOR 水解 N-和粘蛋白型 O-聚糖:糖基化往往是異質的,這使得對高度糖基化的生物zhiliao藥物的分析具有挑戰性。完整質量數的確認以及其他產品質量屬性的表征受到不同糖型復雜性的阻礙,這就是為什么有效的聚糖去除工具簡化了此類分析的原因。 雖然 N-聚糖包含一個共同的結構,并且可以通過 PNGase F 整體去除,但粘蛋白型 O-聚糖在結構上更加多樣化,具有多個不同的he心。OmniGLYZOR含有固定化酶的混合物,能夠依次分解O-聚糖,以完全去除最常見的O-聚糖結構(二唾液酸和單唾液酸基he心1和Tn抗原)。

為了證明Genovis的PNGase F凍干和PNGase F固定在各種底物上的去糖基化能力,用PNGase F凍干或PNGase F固定化處理了一系列糖蛋白。使用天然反應條件在一小時內有效去除曲妥珠單抗和依那西普上的所有N-糖,以及西妥昔單抗上的Fc-糖。當加入RapiGest?并在變性條件下進行反應時,西妥昔單抗的所有N-聚糖(包括Fab-聚糖)在PNGase F固定化10分鐘內完全去除,PNGase F固定化15分鐘內完全去除。在變性反應條件下,PNGase F 在 30 分鐘內成功將更復雜的 F 融合蛋白阿巴西普和阿柏西普去糖基化。使用變性和還原反應條件,將常用的糖蛋白標準品RNase B在10或15分鐘內完全去糖基化,分別使用PNGase F凍干或PNGase F固定化。在天然和變性條件下生成的去糖基化樣品與LC-MS分析兼容。SialEXO和GalactEXO截斷O-聚糖后,應用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc殘基。

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當在完整狀態下進行分析時,EPO的聚糖異質性導致了非常復雜的質譜圖。通過在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時,可以有效地去除 N 糖(含有PNGase F酶)和 O-糖,如對應于未修飾蛋白質的單個峰所示。EPO上殘留了少量用乙酰化唾液酸修飾的O-聚糖,因為OmniGLYZOR對這種結構的水解效率低下。根據制造商Genvois的建議(在37°C下進行O/N孵育),兩種底物蛋白也用另一種市售的去糖基化產物處理,并顯示數據以供比較。另一方面,N-聚糖在內質網中翻譯地連接到未折疊的蛋白質上。這導致某些 N-糖基化位點難以被 Genovis的PNGase F 接近,或者一旦底物蛋白折疊成其天然狀態,就根本無法接近。因此,這種N-聚糖的水解需要底物蛋白以與酶活性相容的方式變性。親和純化微離心柱,SialEXO 凍干 200 單位,OpeRATOR 凍干 200 單位。云南凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶

使用 GalactEXO 凍干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的轉變。湖南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

蛋白質的N-糖基化特征是一個關鍵的質量屬性。它會影響生物制藥的安全性和有效性,因此需要在開發和生產過程中進行表征和監測。常見的聚糖分析工作流程是用PNGase F釋放N-聚糖,然后用熒光標記物(如2-AB、2-AA、普魯卡因胺或RapiFluor-MS?(沃特世公司))標記生成的聚糖。然后使用HILIC-HPLC或毛細管電泳分離標記的聚糖,以表征和定量不同的聚糖結構。 在這里,使用游離聚糖方法分析zhiliao性抗體曲妥珠單抗、Fc-融合蛋白依那西普和糖蛋白RNase B的N-聚糖。曲妥珠單抗和依那西普在天然條件下在37°C下用Genvois的PNGase F去糖基化1小時,而RNase B需要變性和還原才能完全去糖基化。因此,在50°C下用PNGase F去糖基化10分鐘之前,用RapiGest? SF表面活性劑(沃特世公司)和TCEP處理RNase B。 用RapiFluor-MS標記所得游離的聚糖,并通過HILIC UPLC-FLD-MS進行分析。湖南N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶蛋白質組學研究

標簽: 中鹽核酸酶
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