與IdeS不同，Romiplostim 由四個相同的血小板生成素 （TPO） 受體結合肽和一個 Fc 片段組成，通過柔性聚甘氨酸序列連接在一起。與度拉糖肽類似，用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 在 37°C 下過夜，或用 GlySERIAS 凍干 1 小時并在 37°C 下過夜消化該蛋白質。 鏈間二硫鍵被還原，以便于通過反相LC-MS進行以下分析。與度拉糖肽的觀察結果類似，用固定化酶消化產生均質的 Fc/2，剩下一個連接子殘基，此處為甘氨酸殘基。這有助于識別專門位于Fc區域的修改。用凍干酶消化 1 小時得到 Fc/2，剩余 4 個甘氨酸殘基和少量的 Fc/2 仍與一個 TPO 肽連接。另一方面，這使得研究 Fc/2 和第yi個肽之間的連接區域成為可能，而不會受到第二個肽的干擾。用 GlySERIAS 凍干液過夜消化產生 2 個 Fc/2 變體，分別剩下 4 個和 1 個甘氨酸殘基。根據消化時間的不同，使用凍干產物釋放的肽以五或七種變體存在，接頭中殘留的甘氨酸殘基數量不同，而使用固定化產物釋放的肽以四種變體存在。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。IgASAP Sub1 是一種 IgA1 特異性酶。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學

Blinatumomab（一種對 CD19 和 T 細胞標志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對消解樣品的直接分析表明，所有三個連接子區域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結構域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對短連接子的活性較低。與完整的蛋白質分析相比，四個結構域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質量光譜。可以觀察到每個結構域的幾個不同變體，剩余的連接子殘基數量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結構域無法從α-CD19 VH結構域完全基線分離，導致在相關質譜中觀察到一些共洗脫。四個結構域的分離產生了有關在完整蛋白質水平上鑒定的蛋白質修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結構域。后者還含有一個帶有五六個組氨酸殘基的 His 標簽。這些數據證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對包含多個柔性連接子蛋白進行質量控制的中級工作流程的強大功能。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學Genovis的FabULOUS來源于化膿性鏈球菌，在大腸桿菌中表達，分子量為 29 kDa，該酶含有 His 標簽。

對于攜帶突變鉸鏈的 Fc 融合蛋白或抗體來說，Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑戰性。Genovis的GingisKHAN酶在鉸鏈上方一個可觸及的賴氨酸位點消化人IgG1，在足夠溫和的還原條件下保留鏈內和鏈間二硫鍵，從而產生完整的Fab和Fc片段。對于融合蛋白，消化通常在鉸鏈上方獲得，但融合伴侶的結構和氨基酸序列可能導致其他暴露的消化位點。如果去除保守的 Fc N-聚糖，Fc 中的第二個切割位點也可能被GingisKHAN酶切。將精選的單克隆人 IgG1 抗體和 Fc 融合蛋白與 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小時，并通過 HPLC 進行分析。

與IdeS不同，在蛋白質zhiliao藥物的質量控制過程中，詳細分析和識別質量屬性非常重要。對于具有柔性連接子的融合蛋白療法，這包括確認連接蛋白的質量以及蛋白質接頭的質量。使用 Genovis的GlySERIAS 的連接子酶切可以通過分離連接的蛋白質結構域來幫助這種質量控制。然而，連接子中的大量甘氨酸殘基提供了酶的許多潛在消化位點，導致連接子內多個位點同時水解。消化的產物通常由連接蛋白的幾種變體組成，并保留不同程度的連接子。雖然觀察到的異質性通常不會對蛋白質亞基的詳細表征產生負面影響，但有助于直接表征連接子，但有時需要更均勻的消化產物來詳細分析單個蛋白質結構域。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等傳統酶可用于生成 Fab 片段，但非特異性酶活性需要仔細優化，降低多個消化位點的風險。

與肽圖譜相比，根據Genovis科學家的經驗，尤其是對于像抗體這樣的分子，許多人在常規實驗中做了太多的肽圖譜，而中級水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺方法，同樣的方法適用于絕大多數的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優化整個樣品制備，LC分離，質譜設置和數據分析的每個不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數據分析的簡單性，中級方法非常適合自動化和高通量的工作流程。肽圖當然可以自動用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數據，仍然需要徹底分析。事實上，肽圖譜是一個多步驟的過程，每一個步驟都可能破壞方法，并可能導致破壞蛋白質的人工制品，很難交叉訓練給非專業人員。中級水平的方法很容易交叉訓練，我們的方法在質量控制實驗室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產生均質的 F（ab'）2 和 Fc 片段。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學

三個柔性 GS 連接子均被切開，這有助于識別Fc區域的修飾。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學

Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶 可用于 IgG 的所有人類亞類以及人源化和嵌合 IgG。該酶對其他物種的 IgG 也有活性，包括來自大鼠、猴子、兔子和綿羊的某些類別的 IgG。因此，FabRICATOR的高特異性在某些情況下會使其對鉸鏈區域的突變敏感，并損害酶活性。來自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成，與 FabRICATOR 相比，FabRICATOR Z 在消化這些 IgG 方面具有更高的效率。然而，小鼠 IgG1 在鉸鏈下方具有不同的序列，并且不被 FabRICATOR Z 消化。對于這種抗體種類，FabULOUS 和 FabULOUS Fab 試劑盒可用于制備 Fab 片段。黑龍江IdeS蛋白酶蛋白組學