1999年底，安徽省轄2地區、14省轄市，8市、56縣、42市轄區，903鎮、937鄉。

合肥市　　4區　　3縣
　東市區　　　　　　　西市區　　　　　　　南市區　　　　　　　郊　區
　長豐縣（水湖鎮）　　肥東縣（店埠鎮）　　肥西縣（上派鎮）
蕪湖市　　4區　　3縣
　鏡湖區　　　　　　　馬塘區　　　　　　　新蕪區　　　　　　　鳩江區
　蕪湖縣（灣沚鎮）　　南陵縣（城關鎮）　　繁昌縣（城關鎮）
蚌埠市　　4區　　3縣
　東市區　　　　　　　西市區　　　　　　　中市區　　　　　　　郊　區
　懷遠縣（城關鎮）　　固鎮縣（城關鎮）　　五河縣（城關鎮）
淮南市　　5區　　1縣
　田家庵區　　　　　　大通區　　　　　　　八公山區　　　　　　謝家集區　　　　　　潘集區
　鳳臺縣（城關鎮）
馬鞍山市　　4區
　金家莊區　　　　　　花山區　　　　　　　雨山區　　　　　　　向山區
　當涂縣（城關鎮）
淮北市　　3區　　1縣
　相山區　　　　　　　杜集區　　　　　　　烈山區
　濉溪縣（濉溪鎮）
銅陵市　　3區　　1縣
　銅官山區　　　　　　獅子山區　　　　　　郊　區
　銅陵縣（城關鎮）
安慶市　　3區　　1市　　7縣
　迎江區　　　　　　　大觀區　　　　　　　郊　區
　桐城市
　宿松縣（孚玉鎮）　　樅陽縣（樅陽鎮）　　太湖縣（晉熙鎮）　　懷寧縣（高河鎮）　　岳西縣（天堂鎮）　　望江縣（雷陽鎮）
　潛山縣（梅城鎮）
黃山市　　3區　　4縣
　屯溪區　　　　　　　徽州區　　　　　　　黃山區
　休寧縣（海陽鎮）　　歙　縣（徽城鎮）　　祁門縣（祁山鎮）　　黟　縣（碧陽鎮）
滁州市　　2區　　2市　　4縣
　瑯琊區　　　　　　　南譙區
　天長市　　　　　　　明光市
　來安縣（新安鎮）　　定遠縣（定城鎮）　　全椒縣（襄河鎮）　　鳳陽縣（府城鎮）
阜陽市　　3區　　1市　　7縣
　潁州區　　　　　　　潁東區　　　　　　　潁泉區
　界首市
　利辛縣（城關鎮）　　臨泉縣（城關鎮）　　渦陽縣（城關鎮）　　潁上縣（城關鎮）　　蒙城縣（城關鎮）　　阜南縣（城關鎮）
　太和縣（城關鎮）
宿州市　　1區　　4縣
　埇橋區
　蕭　縣（龍城鎮）　　泗　縣（泗城鎮）　　碭山縣（城關鎮）　　靈壁縣（靈城鎮）
巢湖市　　1區　　4縣
　居巢區
　含山縣（環峰鎮）　　無為縣（無城鎮）　　廬江縣（城關鎮）　　和　縣（歷陽鎮）
六安市　　2區　　5縣
　金安區　　　　　　　裕安區
　壽　縣（壽春鎮）　　霍山縣（城關鎮）　　霍邱縣（城關鎮）　　舒城縣（城關鎮）　　金寨縣（梅山鎮）
省直轄行政單位
　毫州市
宣城地區　　駐宣城市　　2市　　5縣
　宣城市　　　　　　　寧國市
　廣德縣（桃州鎮）　　郎溪縣（建平鎮）　　涇　縣（城關鎮）　　旌德縣（旌陽鎮）　　績溪縣（華陽鎮）
池州地區　　駐貴池市　　1市　　3縣
　貴池市
　東至縣（堯渡鎮）　　石臺縣（七里鎮）　　青陽縣（容城鎮）

★1999年7月9日國務院【國函80號】批復：
　1．同意撤銷巢湖地區和縣級巢湖市，設立地級巢湖市。市人民政府駐新設立的居巢區青年路。
　2．巢湖市設立居巢區，以原縣級巢湖市的行政區域為居巢區的行政區域。區人民政府駐東風路。
　3．巢湖市轄原巢湖地區的無為縣、廬江縣、和縣、含山縣和新設立的居巢區。
★1999年9月2日國務院【國函109號】批復：
　1．撤銷六安地區和縣級六安市，設立地級六安市。市人民政府駐新設立的金安區人民路。
　2．六安市設立金安區、裕安區。
　　金安區轄原縣級六安市的東市、中市、三里橋3個街道辦事處和九里溝、望城崗、翁墩、淠東、城北、先生店、中店、橫塘崗8個鄉及馬頭、東橋、木廠、雙河、孫崗、椿樹、三十鋪、張店、毛坦廠、東河口、施橋11個鎮。區人民政府駐人民路。
　　裕安區轄原縣級六安市的鼓樓、西市、北市、南市4個街道辦事處和平橋、羅集、獅子崗、單王、青山、西河口、石板沖7個鄉及新安、順河、丁集、固鎮、徐集、江家店、獨山、蘇埠、城南、分路口、石婆店、韓擺渡12個鎮。區人民政府駐云露街。
　3．六安市轄原六安地區的舒城縣、霍山縣、金寨縣、霍邱縣、壽縣和新設立的金安區、裕安區。