1959年底，安徽省轄5專區、5省轄市，3專轄市、68縣、21市轄區。

合肥市　　5區　　3縣
　東市區　　　　　　　西市區　　　　　　　南市區　　　　　　　郊　區　　　　　　　巢湖區
　肥東縣（店埠鎮）　　肥西縣（上派河）　　巢　縣（巢城鎮）
蚌埠市　　4區
　東市區　　　　　　　西市區　　　　　　　中市區　　　　　　　郊　區
淮南市　　3區
　田家庵區　　　　　　大通區　　　　　　　八公山區
蕪湖市　　4區
　環城區　　　　　　　長街區　　　　　　　新蕪區　　　　　　　郊　區
安慶市　　2區
　東市區　　　　　　　西市區
馬鞍山市　　4區
　馬鞍山區　　　　　　向山區　　　　　　　采石區　　　　　　　郊　區
阜陽專區　　專署駐阜陽縣　　10縣
　阜陽縣（城關鎮）　　太和縣（城關鎮）　　毫　縣（城關鎮）　　渦陽縣（城關鎮）　　蒙城縣（城關鎮）　　鳳臺縣（城關鎮）
　潁上縣（城關鎮）　　臨泉縣（城關鎮）　　阜南縣（薛集）　　　界首縣（界首鎮）
蚌埠專區　　專署駐蚌埠市　　15縣
　宿　縣（城關鎮）　　靈壁縣（靈城鎮）　　泗　縣（城關鎮）　　五河縣（城關鎮）　　懷遠縣（城關鎮）　　濉溪縣（濉溪鎮）
　碭山縣（城關鎮）　　蕭　縣（龍城鎮）　　滁　縣（城關鎮）　　來安縣（新安鎮）　　全椒縣（襄河鎮）　　定遠縣（定城鎮）
　鳳陽縣（府城鎮）　　嘉山縣（明光鎮）　　天長縣（天長鎮）
六安專區　　專署駐六安縣　　7縣
　六安縣（城關鎮）　　舒城縣（城關鎮）　　霍山縣（城關鎮）　　金寨縣（梅山鎮）　　壽　縣（城關鎮）　　霍邱縣（城關鎮）
　廬江縣（城關鎮）
安慶專區　　專署駐安慶市　　1市　　11縣
　銅陵市
　懷寧縣（石牌鎮）　　望江縣（城關鎮）　　宿松縣（城關鎮）　　太湖縣（晉熙鎮）　　岳西縣（天堂鎮）　　潛山縣（梅城鎮）
　桐城縣（城關鎮）　　樅陽縣（城關鎮）　　東至縣（堯渡鎮）　　青陽縣（容城鎮）　　貴池縣（池州鎮）
蕪湖專區　　專署駐蕪湖市　　1市　　19縣
　屯溪市
　無為縣（無城鎮）　　含山縣（環峰鎮）　　和　縣（歷陽鎮）　　蕪湖縣（蕪湖市）　　宣城縣（城關鎮）　　當涂縣（城關鎮）
　南陵縣（城關鎮）　　郎溪縣（城關鎮）　　廣德縣（桃州鎮）　　涇　縣（城關鎮）　　繁昌縣（城關鎮）　　歙　縣（徽城鎮）
　旌德縣（旌陽鎮）　　績溪縣（華陽鎮）　　休寧縣（海陽鎮）　　黟　縣（碧陽鎮）　　祁門縣（城關鎮）　　太平縣（仙源鎮）
　寧國縣（河瀝溪鎮）

◎石埭縣與太平縣合署辦公（改駐仙源鎮）。（1959年1月1日）
◎蕪湖市郊區與蕪湖縣合并成立蕪湖市郊區人民公社聯社，對外保留蕪湖縣稱號（1959年1月8日）直至1960年1月撤銷。
◎屯溪市原由蕪湖專署直接領導，現交由蕪湖專區的休寧縣領導。（安徽省人民委員會1959年1月13日批準）2月，休寧縣黨政機關遷駐屯溪，與屯溪市黨政機關合署辦公。5月16日，屯溪市正式劃歸休寧縣。
◎撤銷淮南市郊區，并入田家庵區、大通區、八公山區（安徽省人民委員會1959年3月16日報告備案）
★1959年3月22日國務院全體會議第86次會議決定：
　1．撤銷濉溪縣，將原縣的行政區域全部設立濉溪市。
　2．撤銷肖縣、碭山二縣，將原二縣的行政區域合并設立肖碭縣。
　3．撤銷滁縣、全椒二縣，將原二縣的行政區域合并設立滁全縣。
　4．撤銷和縣、含山二縣，將原二縣的行政區域合并設立和含縣。
　5．撤銷郎溪、廣德二縣，將原二縣的行政區域合并設立郎廣縣。
　6．撤銷黟縣，將原縣的行政區域全部劃歸祁門縣。
　7．撤銷旌德縣，將原縣的行政區域全部劃歸績溪縣。
　8．撤銷石埭縣，將原縣的行政區域分別劃歸太平、祁門二縣。
　9．撤銷蕪湖縣，將原縣的行政區域全部劃歸蕪湖市。
　10．撤銷青陽縣，將原縣的行政區域全部劃歸貴池縣。
　11．撤銷東流、至德二縣，將原二縣的行政區域合并設立東至縣。
　12．撤銷懷寧、望江縣，將懷寧縣的廣濟圩劃歸安慶市，其余地區和望江縣的行政區于合并設立懷望縣。
　13．撤銷界首、太和二縣，將原二縣的行政區域合并設立首太縣。
　14．設立安豐縣，以壽縣、霍邱二縣的部分地區為安豐縣的行政區域。
◎撤銷東流、至德縣，并組建東至縣（縣人民委員會改駐原至德縣城堯渡鎮），屬安慶專區。（1959年3月22日）5月15日，2個縣合并就緒。
◎撤銷石埭縣，分別并入太平、祁門2個縣，原屬石埭縣的廣陽、夏村、七都、橫渡4個人民公社并入太平縣。安凌公社187平方公里土地劃入祁門縣。（1959年3月22日國務院批準）4月14日執行
◎將懷寧縣的廣濟圩劃歸安慶市。（1959年3月22日國務院批準）
◎馬鞍山市的當涂、和縣、含山縣復屬蕪湖專區。（1959年3月23日）
◎安慶市升格為地級市，仍安慶專區代管，下設東市區、西市區（安徽省人民委員會1959年3月批準）
◎國務院1959年3月22日批準，撤銷濉溪、蕭縣、碭山、滁縣、全椒、和縣、含山、郎溪、廣德、黟縣、旌德、石埭、蕪湖、青陽、東流、至德、懷寧、望江、界首、太和20個縣并設立蕭碭、滁全、和含、郎廣、東至、懷望、首太、安豐8個縣和濉溪市。同年四、五月間安徽省人民委員會前后兩次報經國務院同意，除撤銷石埭縣將其并入太平縣外，其余均暫不變動。（1959年4月3日中共安徽省委決定）
◎撤銷安豐縣，并入壽縣。（1959年4月）
◎為統一管理巢湖水域，在原巢縣中廟鎮增設合肥市巢湖（水上）區，時領5個區3個縣。（1959年5月）
◎將原屬懷寧縣涼亭公社新民大隊和金雞大隊的馬石、光嶺、學堂、竹園、馬莊、路嘴、大學、三園、石山、石壁、龍嶺、金龍、萬湖13個生產隊劃歸月山礦區。（1955年5月）
◎蕪湖市與蕪湖專區分開。（1959年7月3日中共安徽省委員會批準）
★將炳輝縣改名為天長縣。（1959年12月15日國務院批復）（1960年1月5日，正式改名）
◎將鳳臺縣的高皇公社全部及古溝公社的薛集、劉龍、太平、伏龍、田集、淤湖、古溝、許黃、祁集、王圩10個大隊，潘集公社的永生、陶王、楊柳、李興、草廟、潘集、楊圩、謝街8個大隊劃入淮南市，設郊區，管轄淮南以北的高皇、古溝、潘集、祁集、尹家溝、夾溝、陶王、耿集、朱町9個公社。將鳳臺縣孔集公社另劃出鳳淮、淮峻兩個大隊及淮豐大隊的孔集、東邊冢、四合村3個自然村9個小隊劃入淮南市八公山區。（1959年12月）
◎將懷遠縣秦集公社15個大隊，6375畝耕地劃歸蚌埠市；11個大隊，53個村莊，134846畝耕地劃歸淮南市。（1959年12月）
◎合肥市車站區更名為南市區
◎將和縣六聯大隊及方橋大隊部分村莊劃入含山縣張公鄉。