1999年底，青海省轄1地區、6自治州、1市，30縣、7自治縣、2市、4市轄區、4行政委員會。

縣級以上行政區劃一覽
西寧市　4區、2縣、1自治縣
　城東區　　　　　　　城西區　　　　　　　城中區　　　　　　　城北區
　湟中縣（魯沙爾鎮）　湟源縣（城關鎮）　　大通回族土家族縣（橋頭鎮）
海東地區　駐平安縣　2縣、4自治縣
　平安縣（平安鎮）　　樂都縣（碾伯鎮）　　互助土族自治縣（威遠鎮）
　化隆回族自治縣（巴燕鎮）　　　　　　　　循化撒拉族自治縣（積石鎮）
　民和回族土族自治縣（上川口鎮）
海北藏族自治州　駐海晏縣西海鎮　3縣、1自治縣
　海晏縣（三角城）　　祁連縣（八寶）　　　岡察縣（沙柳河）
　門源回族自治縣（浩門鎮）
黃南藏族自治州　駐同仁縣　3縣、1自治縣
　同仁縣（隆務鎮）　　澤庫縣（鎖乃亥）　　尖扎縣（馬克唐）
　河南蒙古族自治縣（優干寧）
海南藏族自治州　駐共和縣　5縣、1行政委員會
　共和縣（恰卜恰鎮）　興海縣（子科灘）　　貴德縣（河陰鎮）　　貴南縣（茫拉）
　同德縣（尕巴松多）　龍羊峽行政委員會
果洛藏族自治州　駐瑪沁縣　6縣
　瑪沁縣（大武鎮）　　甘德縣（吾勤）　　　達日縣（吉邁）　　　久治縣（智清松多）
　班瑪縣（塞來唐）　　瑪多縣（瑪查里）
玉樹藏族自治州　駐玉樹縣　6縣
　玉樹縣（結吉鎮）　　稱多縣（周筠）　　　囊謙縣（香達）　　　治多縣（加吉博洛格）
　雜多縣（薩呼騰）　　曲麻萊縣（約改灘）
海西蒙古族藏族自治州　駐德令哈市　2市、3縣、3行政委員會
　格爾木市　　　　　　德令哈市
　都蘭縣(察汗烏蘇鎮)　天峻縣（新源）　　　烏蘭縣（希里溝鎮）
　茫崖行政委員會（花土溝）　　　　　　　　大柴旦行政委員會（大柴旦鎮）
　冷湖行政委員會（冷湖鎮）

縣級以上行政區劃變更情況
★1999年12月5日國務院【國函142號】批復同意將海東地區的湟中縣、湟源縣劃歸西寧市管轄。