宋時南安分為八個鄉(xiāng)，下轄三十一個里。八鄉(xiāng)即唐安、從政、德教、懷德、金雞、歸墓、唐興、太平。元朝改"鄉(xiāng)里"為"都"，全縣設(shè)46都；明洪武年間，城內(nèi)設(shè)三坊，城外縮為44都（即六、七都合一，九、十二都合一）；明萬歷年間又恢復46都。清朝沿用明制。民國初期，沿用清朝的鄉(xiāng)、里、都的區(qū)劃。民國17年，實行區(qū)鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）制，劃為4區(qū)45鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）。民國23年劃為10區(qū)、336保、3379甲。民國25年劃為4區(qū)53聯(lián)保。民國31年實行區(qū)鄉(xiāng)鎮(zhèn)制（設(shè)四區(qū)）。民國35年，實行縣轄鄉(xiāng)鎮(zhèn)制，設(shè)30個鄉(xiāng)鎮(zhèn)（其中9個鎮(zhèn)）。
1949年9月，全縣劃分11區(qū)，轄30鄉(xiāng)鎮(zhèn)。1950年4月，撤銷金門縣工委，所屬大嶝區(qū)劃歸南安縣，增至12區(qū)。1951年10月，鄉(xiāng)鎮(zhèn)細劃，增至191個鄉(xiāng)鎮(zhèn)。1952年8月，調(diào)整為19區(qū)、207鄉(xiāng)鎮(zhèn)。1955年10月，全縣重劃為16區(qū)、213鄉(xiāng)、6鎮(zhèn)。其后尚有多次變動，如撤區(qū)并鄉(xiāng)；成立公社；恢復（后又撤銷）區(qū)公所。1958年，豐州招賢點的糖房、潘山、西埔、燒厝、京墉，岐山點的新浦、延陵、坂頭、岐山、東邊、黃石頭、金浦、大錦田、華巖，浮橋街頭等地劃歸泉州市（今鯉城區(qū)及豐澤區(qū)）管轄。1960年，組建晉江縣國營紫帽山農(nóng)場，又將官橋鎮(zhèn)的紫星和霞茂等大隊劃歸農(nóng)場。1971年1月，將大、小嶝及蓮河劃歸同安縣。
1981年劃22個公社、1個鎮(zhèn)。1985年轄11鎮(zhèn)11鄉(xiāng)。1988年轄15鎮(zhèn)7鄉(xiāng)，7個國營農(nóng)、林、茶場。1992年轄20鎮(zhèn)2鄉(xiāng)。1996年，南安市轄溪美、侖蒼、英都、詩山、碼頭、梅山、洪瀨、豐州、官橋、水頭、石井、美林、金陶、羅東、康美、東田、翔云、蓬華、九都、洪梅20鎮(zhèn)及眉山、向陽2鄉(xiāng)，市政府駐溪美鎮(zhèn)。
1998年，省民政廳批復同意撤銷溪美鎮(zhèn)和美林鎮(zhèn)，設(shè)立溪美街道、柳城街道和美林街道；增設(shè)省新鎮(zhèn)，轄原美林鎮(zhèn)的滿山紅、丹青、南金、新廳、垵后、園內(nèi)、省身、省東、西埔、檀林、油園11個村委會。1999年，省民政廳批復同意從豐州鎮(zhèn)劃出霞美、山美、溫山、四黃、邱鐘、埔當、沃柄、張坑、長福、四甲、西山、金山、玉田、杏埔、仙河15個村委會設(shè)立霞美鎮(zhèn)，鎮(zhèn)政府駐霞美村；從羅東鎮(zhèn)劃出爐山、爐中、飛云、爐星、福山、湖內(nèi)、潭邊、厚陽8個村委會設(shè)立樂峰鎮(zhèn)，鎮(zhèn)政府駐爐山村。
1999年，全市轄3個街道、21個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)：溪美街道、柳城街道、美林街道、侖蒼鎮(zhèn)、英都鎮(zhèn)、金淘鎮(zhèn)、詩山鎮(zhèn)、碼頭鎮(zhèn)、羅東鎮(zhèn)、梅山鎮(zhèn)、洪瀨鎮(zhèn)、康美鎮(zhèn)、豐州鎮(zhèn)、官橋鎮(zhèn)、水頭鎮(zhèn)、石井鎮(zhèn)、東田鎮(zhèn)、翔云鎮(zhèn)、蓬華鎮(zhèn)、九都鎮(zhèn)、洪梅鎮(zhèn)、省新鎮(zhèn)、霞美鎮(zhèn)、樂峰鎮(zhèn)、眉山鄉(xiāng)、向陽鄉(xiāng)，33個居委會、380個村委會。
2000年第五次人口普查，南安市常住總?cè)丝?385276人，其中：溪美街道83588人，柳城街道68083人，美林街道69249人，省新鎮(zhèn)46860人，侖倉鎮(zhèn)37624人，東田鎮(zhèn)38772人，英都鎮(zhèn)42355人，翔云鎮(zhèn)20937人，金淘鎮(zhèn)64796人，詩山鎮(zhèn)72340人，蓬華鎮(zhèn)16844人，碼頭鎮(zhèn)55737人，九都鎮(zhèn)12972人，樂峰鎮(zhèn)29953人，羅東鎮(zhèn)48652人，梅山鎮(zhèn)59030人，洪瀨鎮(zhèn)83130人，洪梅鎮(zhèn)36569人，康美鎮(zhèn)49482人，豐州鎮(zhèn)47203人，霞美鎮(zhèn)62918人，官橋鎮(zhèn)100185人，水頭鎮(zhèn)121620人，石井鎮(zhèn)86902人，眉山鄉(xiāng)16483人，向陽鄉(xiāng)12992人。
2003年末，南安市全市總戶數(shù)375768戶，總?cè)丝?481135人，其中非農(nóng)業(yè)人口387339人。各街鎮(zhèn)鄉(xiāng)人口：溪美街道80178人，柳城街道62963人，美林街道70922人，省新鎮(zhèn)49919人，侖蒼鎮(zhèn)49187人，東田鎮(zhèn)49192人，英都鎮(zhèn)58766人，翔云鎮(zhèn)26664人，金淘鎮(zhèn)78885人，詩山鎮(zhèn)87217人，蓬華鎮(zhèn)23470人，碼頭鎮(zhèn)70994人，九都鎮(zhèn)16655人，樂峰鎮(zhèn)45935人，羅東鎮(zhèn)58858人，梅山鎮(zhèn)67477人，洪瀨鎮(zhèn)85927人，洪梅鎮(zhèn)50120人，康美鎮(zhèn)55243人，豐州鎮(zhèn)48079人，霞美鎮(zhèn)67019人，官橋鎮(zhèn)115275人，水頭鎮(zhèn)139704人，石井鎮(zhèn)86426人，眉山鄉(xiāng)24791人，向陽鄉(xiāng)13815人。
2001年，向陽鄉(xiāng)林坑村劃歸九都鎮(zhèn)管轄。
2005年，南安市轄溪美、柳城、美林3個街道，侖蒼、英都、金淘、詩山、碼頭、羅東、梅山、洪瀨、康美、豐州、官橋、水頭、石井、東田、翔云、蓬華、九都、洪梅、省新、霞美、樂峰21個鎮(zhèn)，眉山、向陽2個鄉(xiāng)，共有32個社區(qū)、384個行政村。
2010年第六次人口普查，南安市常住總?cè)丝?418451人，其中：溪美街道84231人，柳城街道68548人，美林街道75050人，省新鎮(zhèn)48710人，侖蒼鎮(zhèn)77820人，東田鎮(zhèn)33825人，英都鎮(zhèn)35042人，翔云鎮(zhèn)15181人，金淘鎮(zhèn)58429人，詩山鎮(zhèn)59825人，蓬華鎮(zhèn)10929人，碼頭鎮(zhèn)49759人，九都鎮(zhèn)14625人，樂峰鎮(zhèn)26717人，羅東鎮(zhèn)43168人，梅山鎮(zhèn)65073人，洪瀨鎮(zhèn)86351人，洪梅鎮(zhèn)31122人，康美鎮(zhèn)52130人，豐州鎮(zhèn)44650人，霞美鎮(zhèn)68494人，官橋鎮(zhèn)108452人，水頭鎮(zhèn)147337人，石井鎮(zhèn)92806人，眉山鄉(xiāng)10680人，向陽鄉(xiāng)7901人，雪峰管委會1596人。