約在原始社會末期,至遲在夏朝初,“鄞”已成為確定的地名。鄞由“堇”和“邑”(阝)兩字合成。顧祖禹《讀史方輿論紀要》稱:“夏時有堇子國,以赤堇山為名……加邑為鄞”。夏、商時代屬“東夷”地。春秋時屬越國。戰國中期屬楚國。秦始皇二十五年(公元前222年)置鄞、鄮、句章(句讀音為勾)三縣,均屬會稽郡轄。鄞縣的區域包括今寧波的海曙區和今鄞縣西南境及奉化、象山一帶,縣治設在今奉化白杜。鄮縣的區域包括今寧波江東區和今鄞縣東鄉、北侖區及舟山群島,縣治設在寶幢附近的鄮山同谷,即今五鄉鎮同岙村,舊稱鄮廓。句章縣包括今市區江北和今鄞縣北鄉及西鄉、舊時慈溪、余姚一帶地方,縣治設在今慈城附近的乍山城山渡。
西漢初期,鄞、鄮、句章等縣先屬劉賈的荊國,后屬劉濞的吳國。公元前154年,吳地削藩,鄞縣復屬會稽郡。新莽天鳳元年(公元14年),王莽把鄮縣改為海治縣,把鄞縣改為謹縣,仍屬會稽郡。東漢建武(25-56年)初年,廢謹縣名,復改為鄞縣。秦漢兩代,鄞縣歸會稽郡所轄,縣治在白杜,其縣境兼有今寧波城區、鄞縣、奉化及寧海象山部分之地,重心在今奉化。東晉時浙東孫恩起義,起義軍攻破句章縣城城山渡(今慈城南郊)。隆安五年(401年),劉裕在鄞江橋修筑句章新縣城,叫小溪鎮(今鄞江鎮)。隋開皇九年(589年)改會稽郡為吳州,設吳州總管府。廢鄞縣、鄮縣、余姚縣,而把鄞、鄮、余姚、句章之地總稱為句章縣。這個句章縣區域極大,相當于如今寧波、舟山兩大市,地方志上稱為“大句章”。縣治仍在小溪鎮。
唐武德四年(621年),句章縣被分析,以原鄮縣地、鄞縣地、句章地設鄞州,以原余姚縣地設姚州。武德八年(625年),廢鄞州,恢復鄮縣名稱,縣治仍設在小溪鎮,隸屬于越州。這時的鄮縣包括秦漢時鄞、鄮、句章三縣,地方志上稱為“大鄮縣”。開元二十六年(738年),將鄮縣分為慈溪、翁山(今舟山定海)、奉化、鄮縣四個縣,增設明州以統轄之。縣治、州治均設在小溪鄞江橋。這是明州建州的開始。明州屬江南東道。鄮縣境內有大山,山心有石,石中四穴,可通光亮,號四窗,又名四明,故山名叫四明山,州名也稱為明州。大歷六年(771年),鄮縣縣治移到三江口(今寧波城區),州治仍在小溪鎮,州、縣分為兩城。長慶元年(821年),明州州治遷到了三江口,而鄮縣縣治又遷回到小溪鎮。
后梁開平三年(909年),改鄮縣為鄞縣,縣治從小溪鎮遷到三江口,屬吳越國明州望海郡。北宋至南宋中葉屬明州,南宋慶元元年(1195年),升明州為慶元府,府治設在鄞縣(三江口)。鄞縣屬慶元府轄。元改府為“路”,慶元府變成了慶元路,鄞縣屬慶元路轄。1367年,朱元璋厭惡“慶元”兩字,認為有“慶賀元朝”之意,改慶元路為明州府。洪武十四年(1381年),改明州為寧波,這是寧波定名之始。從明朝初年直至清朝結束,鄞縣始終屬于寧波府轄。民國初年廢府置道,原寧波、紹興、臺州三個府合并成會稽道(俗稱寧紹臺道),道治設在鄞縣(寧波城),鄞縣為會稽道所轄。民國十六年(1927年),劃出鄞縣縣城及城郊六七里地設立寧波市。寧波市直屬于省,鄞縣也屬省轄,互不管轄。民國二十年(1931年)1月,撤銷寧波市建制,并市入縣,歸屬于鄞縣,寧波重新成為鄞縣縣城。
1949年5月25日,寧波解放。6月,從鄞縣析出城區及近郊設寧波市。同時設立浙江省第二專區,鄞縣屬第二專區轄(同年11月,第二專區改稱寧波專區),縣委、縣政府辦公地址設在寧波市開明街月宮旅社內。7月17日,鄞縣縣委、縣政府辦公地址搬遷到涇東鄉(福明鄉)松下漕村辦公;9月下旬縣委搬遷到石碶辦公,縣政府搬遷到姜山鎮辦公。1951年3月1日,縣委辦公地設在寧波市江東里潛龍路6號(現潛龍路30號),縣政府設在劃船巷。1958年12月29日,鄞縣建制撤銷,所屬地域均劃歸寧波市。1961年12月15日,鄞縣又恢復建制,從寧波市劃出,歸寧波專區管轄。1970年,寧波專區改為寧波地區。1983年,寧波地區與寧波市合并,實行以市領縣制,鄞縣屬寧波市轄。2002年2月1日,國務院(國函[2002]8號)批準撤銷鄞縣,設立寧波市鄞州區;4月19日鄞州區正式掛牌成立。
1962年3月,鄞縣恢復工作就緒,中共鄞縣縣委、縣人民委員會辦公地設在寧波市海曙區和義路戰船街女子中學內。1968年8月,縣委辦公地搬遷到江東區里潛龍路6號,縣人民委員會搬遷到劃船巷。1985年5月,縣委搬遷到潛龍路6號,縣人民委員會搬遷到潛龍路25號。1995年1月3日成立鄞縣新區管理委員會。3月10日,鄞縣第十三屆人民代表大會第三次會議通過了《關于動員全縣人民齊心協力建設鄞縣中心區的決議》,規劃中的鄞縣中心區位于寧波市西南部,橫跨奉化江兩岸,東至沿海大通道,西至寧波櫟社機場、寧波西外環路,南接鐘公廟茶亭、陳婆渡,北以蕭甬鐵路北侖線為界,總面積33平方千米。5月,鄞縣縣委、縣政府、人大、政協等13個機關單位,遷移到江東區百丈東路251號綜合大樓集中辦公。2003年,將中心區改名為新城區,功能定位調整到鄞州區政治、商貿、居住、科技和教育中心。10月,區政府遷駐鄞州新城區惠風東路568號(至2005年各職能部門相繼搬入新城區辦公)。