2003年10日8日起，區政府駐地由江東區百丈東路251號遷至鄞州區惠風東路568號。2003年末，鄞州區面積1527平方千米，總人口75.58萬人，其中非農業人口19.90萬人。轄4個街道、17個鎮、1個鄉，46個居委會、659個行政村。

2004年，全區原有607個行政村中有323個行政村進行了調整，并建立新行政村131個，其中未作調整的行政村共計274個，合并后現有行政村共計415個。其中調整幅度最大的是章水鎮，撤并前原有行政村50個，撤并后現有行政村20個，有46個行政村進行了調整，建立新村16個。其中：下應街道由36個村調整為30個村；鐘公廟街道由29個村調整為28個村；石碶街道由20個村調整為16個村；瞻岐鎮由21個村調整為17個村；咸祥鎮由25個村調整為17個村；塘溪鎮由32個村調整為17個村；東吳鎮由21個村調整為12個村；五鄉鎮由28個村調整為19個村；邱隘鎮由20個村調整為16個村；云龍鎮由20個村調整為17個村；橫溪鎮由31個村調整為15個村；姜山鎮由74個村調整為55個村；高橋鎮由33個村調整為20個村；橫街鎮由46個村調整為28個村；集士港鎮由27個村調整為19個村；古林鎮由33個村調整為24個村；洞橋鎮由27個村調整為20個村；鄞江鎮由19個村調整為12個村；章水鎮由50個村調整為20個村；龍觀鄉由15個村調整為10個村。

2004年末，鄞州區面積1381平方千米，總人口76.78萬人，共有48個社區、465個行政村（寧波年鑒數據）；面積1527平方千米，總人口767762人，其中農業人口553769人，共有54個社區、470個行政村（鄞州年鑒數）；面積1406平方千米，人口82.22萬人，共有4個社區、44個居民區、465個行政村（寧波地名網數據）。

2005年末，鄞州區戶籍人口77.66萬人。轄3個街道、16個鎮、1個鄉：鐘公廟街道、下應街道、石碶街道；咸祥鎮、邱隘鎮、五鄉鎮、云龍鎮、橫溪鎮、姜山鎮、古林鎮、橫街鎮、鄞江鎮、章水鎮、瞻岐鎮、東吳鎮、高橋鎮、塘溪鎮、洞橋鎮、集士港鎮；龍觀鄉，共有48個居民區、407個行政村。（不含東錢湖鎮數據）

2006年末，鄞州區面積1406平方千米，人口77.66萬人。轄4個街道、17個鎮、1個鄉，31個社區、27個居民區、452個行政村。區政府駐惠風東路568號。

2007年末，鄞州區面積1406平方千米，戶籍人口79萬人，其中非農業人口24.37萬人，農業人口54.62萬人。轄4個街道、17個鎮、1個鄉，61個居民區、451個行政村。區政府駐惠風東路568號。

2008年3月下旬，經寧波市政府第24次常務會議討論通過，同意對鄞州區部分街道行政區域進行調整。調整鐘公廟街道和下應街道的區域范圍，并在此區域內重新組建鐘公廟和下應街道，新建首南、中河2個街道。具體方案為：劃出原鐘公廟街道鄞縣大道以南的傅家、桃江等15個村和南裕、陳婆渡2個社區地域范圍，組建新的首南街道；將原鐘公廟街道天童北路以東劃出的宋詔橋、黃泥橋2個村及宋詔橋、飛虹等9個社區與原下應街道同三線（甬臺溫高速）以西劃出的蔡家漕、孫馬等3個村和東裕、東城2個社區地域范圍，合并組建新的中河街道。4月10日，首南、中河2個街道正式掛牌成立。2008年末，鄞州區戶籍人口79.6萬人，轄6個街道、17個鎮、1個鄉，61個居委會、394個行政村。

2012年7月16日，《寧波市人民政府關于鄞州區下應街道行政區劃調整的批復》（甬政發[2012]72號）：同意將現在的下應街道以鄞縣大道為界拆分為兩個街道，鄞縣大道以北潘火管委會托管區域成立潘火街道，鄞縣大道以南區域仍由下應街道管轄。（一）下應街道。轄區范圍東至東錢湖鎮邊界，南至首南街道、云龍鎮、姜山鎮邊界，西至甬臺溫高速，北至鄞縣大道，面積9平方公里，戶籍人口1.3萬人，流動人口2.8萬人，下轄黎明、史家碼、江六、河東、河西、勝利、東升、姜村、灣底等9個行政村，東興、天宮2個社區，1個下應居委會。街道辦事處暫駐灣底村。（二）潘火街道。轄區范圍東至邱隘鎮、東錢湖鎮邊界，南至鄞縣大道，西至甬臺溫高速及中河街道邊界，北至江東區邊界，面積14.25平方公里，戶籍人口1.9萬人，流動人口5.2萬，下轄殷家坑、小花園、潘火橋、妙勝、曹隘、王家弄、土橋等7個行政村，東南、雅苑、東鶯、世紀、紫郡、同欣、尚誠、星苑等8個社區。街道辦事處駐誠信路668號。調整后鄞州區的行政區劃為7個街道、17鎮、1個鄉。

2013年，設立大嵩新區。規劃覆蓋瞻岐鎮、咸祥鎮、塘溪鎮和鄞州經濟開發區等區域，涉及51個行政村，面積253平方千米（含海域面積），規劃人口規模30萬人（本站注：現有約8萬人）。大嵩新區管委會與鄞州經濟開發區管委會合署辦公，實行“兩塊牌子，一套班子”。