據The Loadstar 報道，為了減少碳排放量，MSC已經開始在停靠鹿特丹港的船舶中使用生物燃料。但MSC并未說明推行生物燃料的具體船舶數量與費用。

總部位于布魯塞爾的NGO運輸與環境（T＆E）聲稱，MSC在2018年造成了約1,100萬噸的二氧化碳排放。T＆E引用一項新研究表示，認為如果將航運列入歐盟碳排放系統中，MSC將成為歐盟排名第八的碳排放組織。

目前的生物燃料試驗中，MSC使用的是10%的混合燃料。MSC集團海事政策和政府事務執行副總裁Bud Darr表示，這將使船舶的二氧化碳絕對排放量減少15-20％。同時他認為，“這些燃料的生物成分中潛在的二氧化碳減少量可達80-90%，我們將隨著時間的推移進行監測和確認。”

MSC表示，負責任地采購使用生物燃料可以為航運業實現IMO2030年降低二氧化碳排放強度的目標提供另一種解決方案，并朝著2050年的目標水平邁進。

盡管進行了生物燃料試驗，但MSC表示仍在嘗試進行其他替代燃料的研究，以符合將于1月1日生效的限硫令規定。

與其他班輪競爭者相比，MSC擁有數量最多的裝有洗滌器的船舶，其564艘集裝箱船中約有一半配備了廢氣凈化技術。

Darr表示：“本世紀集裝箱運輸仍然面臨的最大挑戰是如何脫碳并達到IMO在2030年以后的未來排放目標。”根據其內部能效運營指標，MSC的船隊改進計劃使碳排放在2015年至2018年期間減少了13％。此外，MSC稱其新建的23,000 teu MSC Gulsun級船舶具有“設計上最低的碳排放量”，每噸貨物移動一海里僅排放7.49克二氧化碳。

MSC表示，該公司“致力于減少全球供應鏈的環境足跡”，但“如果沒有燃料和推進技術的重大突破，就不可能實現低碳目標”。