CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),它們有一些關(guān)鍵的區(qū)別:1.**技術(shù)原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術(shù)利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結(jié)合來進(jìn)行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結(jié)合位點(diǎn)裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術(shù)則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復(fù)合物,留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進(jìn)行簡短的消化反應(yīng),在TF結(jié)合的MNase擴(kuò)散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復(fù)TF-DNA復(fù)合物。2.**操作步驟和簡便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題,如交聯(lián)導(dǎo)致的DNA和蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡化了操作步驟,使用磁珠固定細(xì)胞核,適用于新鮮和冷凍組織樣本,縮短了生成DNA測序文庫的時間(1-2天)。3.**背景信號和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產(chǎn)生的背景信號可能較高,因?yàn)樗赡苌婕暗椒翘禺愋缘腄NA切割。
磁珠法在基因克隆中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在以下幾個方面:1.**質(zhì)粒DNA的提取**:磁珠法可以用于從細(xì)菌細(xì)胞中提取質(zhì)粒DNA,這對于質(zhì)粒的克隆和表達(dá)至關(guān)重要。通過磁珠法提取的質(zhì)粒DNA純度高,適合用于后續(xù)的酶切、連接、轉(zhuǎn)化等分子克隆步驟。2.**基因組DNA的提取**:磁珠法可以用于從各種生物樣本中提取基因組DNA,這對于基因組的克隆和分析非常重要。提取的基因組DNA可以用于PCR擴(kuò)增、基因表達(dá)分析、基因突變檢測等。3.**mRNA的提取和純化**:在mRNA克隆中,磁珠法可以用于提取和純化mRNA,這對于cDNA的合成和基因表達(dá)分析非常關(guān)鍵。磁珠法提取的mRNA純度高,可以用于后續(xù)的cDNA合成和RT-PCR等實(shí)驗(yàn)。4.**PCR產(chǎn)物的純化**:磁珠法可以用于純化PCR產(chǎn)物,去除反應(yīng)中的酶、dNTPs和其他雜質(zhì),為克隆PCR產(chǎn)物提供高純度的DNA模板。5.**DNA片段的篩選和回收**:在基因克隆過程中,可能需要從多個DNA片段中篩選出特定大小或序列的片段。磁珠法可以用于DNA片段的篩選和回收,提高克隆效率。6.**自動化和高通量操作**:磁珠法易于與自動化設(shè)備結(jié)合,適合高通量樣本處理,這對于大規(guī)模基因克隆項(xiàng)目尤為重要。自動化操作減少了人為操作誤差,提高了實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性和可靠性。Recombinant Human LILRB1/CD85j/ILT2 Protein,His TagEndo H 是一種糖蛋白特異性的酶,主要作用于含有 N - 連接寡糖鏈的糖蛋白,對其他類型的生物大分子如核酸。
BstDNA聚合酶對dUTP的耐受性對實(shí)驗(yàn)結(jié)果有以下影響:1.**防止交叉污染**:BstDNA聚合酶具有較高的dUTP耐受性,這意味著它可以在反應(yīng)體系中添加dUTP/UDG酶防污染系統(tǒng)的情況下工作,有效防止LAMP產(chǎn)物的交叉污染,確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。2.**保持靈敏度和擴(kuò)增效率**:即使在引入dUTP/UDG酶防污染系統(tǒng),使用dUTP替換dTTP的情況下,BstDNA聚合酶的靈敏度及擴(kuò)增效率不受影響。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,在反應(yīng)體系中添加dUTP對BstDNA聚合酶的擴(kuò)增靈敏度和效率沒有負(fù)面影響。3.**提高實(shí)驗(yàn)的可靠性**:由于BstDNA聚合酶能夠在高濃度的dUTP存在下保持活性,這使得它在進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增時更加可靠,尤其是在需要防止DNA污染的實(shí)驗(yàn)中。4.**兼容dUTP/UDG系統(tǒng)**:BstDNA聚合酶對dUTP的耐受性好,高度兼容dUTP/UDG系統(tǒng),這對于避免交叉污染和提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性至關(guān)重要。綜上所述,BstDNA聚合酶的高dUTP耐受性為等溫?cái)U(kuò)增實(shí)驗(yàn)提供了一個重要的優(yōu)勢,即在保持高靈敏度和擴(kuò)增效率的同時,能夠有效防止交叉污染,從而提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性。
在DNA提取過程中避免RNA污染的關(guān)鍵在于采取一系列措施來確保RNA被有效去除或降解,同時保護(hù)DNA的完整性和純度。以下是一些確保DNA提取過程中避免RNA污染的策略:1.**使用專門的DNA提取試劑盒**:選擇高質(zhì)量的DNA提取試劑盒,這些試劑盒通常已經(jīng)包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和純化步驟,能夠有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)處理**:在DNA提取過程中加入RNase處理步驟,可以有效地去除殘留的RNA污染。RNase是一種能夠特異性降解RNA的酶,可以在不影響DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**優(yōu)化實(shí)驗(yàn)操作步驟**:在破碎細(xì)胞時,選擇合適的破碎方法和破碎時間,避免過度破碎導(dǎo)致RNA的釋放;在DNA純化階段,控制好離心速度和時間,避免RNA的沉淀。4.**使用無RNase的試劑和耗材**:使用經(jīng)過RNase-free處理的實(shí)驗(yàn)器材和試劑,確保實(shí)驗(yàn)過程中不會引入外源性RNA污染。5.**嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)環(huán)境**:保持實(shí)驗(yàn)室臺面和工作區(qū)域干凈無塵,定期對實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行消殺,避免RNA酶污染。6.**個人防護(hù)和操作規(guī)范**:在處理DNA樣品時,佩戴無菌手套和口罩,以減少呼吸道和皮膚污染的風(fēng)險。使用不同的工具處理不同的樣品,或者在處理前后徹底清洗工具,避免交叉污染。FnCas12a需要一個crRNA,而不需要tracrRNA,簡化了RNA的設(shè)計(jì)和構(gòu)建過程。
BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads是一種利用磁珠技術(shù)從血液中提取基因組DNA的試劑盒。以下是一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**高效提取**:該試劑盒采用特殊的磁珠和緩沖體系,能夠快速且高效地從100μl至1ml的血液中分離和純化高質(zhì)量的基因組DNA。2.**磁珠特性**:獨(dú)特的磁珠具有很強(qiáng)的核酸親和力,在特定條件下可以快速分離和純化核酸。這些磁珠對磁場響應(yīng)迅速,使得提取過程既安全又便捷。3.**提取過程**:血液樣本在裂解液和蛋白酶K的作用下迅速裂解,釋放出的基因組DNA與磁珠特異性結(jié)合。通過磁分離架的作用,磁珠與溶液快速分離,經(jīng)過洗滌去除雜質(zhì),用洗脫液將基因組DNA從磁珠上洗脫下來。4.**應(yīng)用廣**:提取的基因組DNA可用于多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如PCR擴(kuò)增、酶切、基因分型、Southern雜交、高通量測序、基因組DNA文庫構(gòu)建等。5.**操作簡便**:整個抽提過程大約需要50分鐘,操作簡便,無需使用有毒有害的有機(jī)試劑,如酚或氯仿,提高了實(shí)驗(yàn)的安全性。6.**高純度和高回收率**:提取的DNA純度高,A260/A280通常在1.7-1.9之間,表明蛋白和RNA的污染低。回收率通常超過80%。
E2酶接收來自E1的激起泛素,并在E3酶的協(xié)助下將泛素分子轉(zhuǎn)移到靶蛋白上。Recombinant Canine PRLR Protein,hFc Tag
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
Recombinant Human CD34 (His Tag)
Recombinant Mouse LOX1 Protein
Recombinant Cynomolgus IFN alpha/beta R1 Protein
Recombinant Mouse Leptin Protein
Recombinant Human ACE2/ACEH (His Tag)
Recombinant Human IL-17 Protein
Recombinant Cynomolgus NKG2D/CD314 Protein
Recombinant Human CD37 Protein
Recombinant Human TPO Protein
Recombinant Mouse LYPD3 Protein