T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內(nèi)切酶,具有以下特點:1.**識別錯配DNA**:T7EI能夠識別并切割不完全配對的DNA、十字型結(jié)構(gòu)DNA、Holliday結(jié)構(gòu)或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點**:T7EI切割錯配位點5'端的、第二或第三個磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對錯配DNA的識別非常靈敏,能夠檢測并切割單堿基和多堿基的錯配。4.**應(yīng)用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)導(dǎo)致的基因突變的鑒定。它通過識別錯配DNA來幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標(biāo)效應(yīng)。5.**直接電泳檢測**:T7EI的產(chǎn)物可以直接通過電泳進(jìn)行檢測,這使得它在實驗操作中更為方便。6.**來源**:T7EI來源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)和T7核酸內(nèi)切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業(yè)上使用時成本較高,但它在大規(guī)模樣本測試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項**:T7EI能夠識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯配DNA,但不能識別1bp的插入、缺失或突變。這些特點使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的應(yīng)用中。蛋白在表達(dá)過程中形成包涵體,需要通過復(fù)性步驟恢復(fù)其活性。這通常涉及物質(zhì)的存在下進(jìn)行蛋白質(zhì)的重折疊。Recombinant Human BTN1A1/Butyrophilin (His-Avi Tag)
確保Cre重組酶只作用于特定細(xì)胞,主要通過以下幾種方式實現(xiàn):1.**組織特異性啟動子**:-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達(dá),可以確保Cre酶只在特定組織或細(xì)胞中表達(dá)。這種方法通過將Cre基因置于特定細(xì)胞類型特有的啟動子控制之下,實現(xiàn)對Cre酶表達(dá)的精確控制。2.**誘導(dǎo)型Cre重組酶系統(tǒng)**:-通過使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實現(xiàn)對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導(dǎo)時,Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合,定位于細(xì)胞質(zhì)中;當(dāng)他莫昔芬給藥誘導(dǎo)時,Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進(jìn)入細(xì)胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當(dāng)于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關(guān),使得體內(nèi)基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導(dǎo)的Cre系統(tǒng)**:-例如Tet-on系統(tǒng),通過四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來激起基因表達(dá)。在三重轉(zhuǎn)基因動物中,rtTA在特定啟動子的控制下表達(dá),多西環(huán)素與rtTA結(jié)合,Cre的表達(dá),導(dǎo)致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動子的腺相關(guān)病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細(xì)胞。
Recombinant Human Renin ProteinT4 DNA 聚合酶具有 5’→3’聚合酶活性,在模板及引物存在的條件下,能夠在結(jié)合有引物的單鏈 DNA 模板上。
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實驗中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點:1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫擴(kuò)增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯誤,但保真性相對較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫擴(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫擴(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫擴(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
提取的DNA質(zhì)量評估通常涉及以下幾個方面:1.**純度評估**:-**分光光度法**:通過測量DNA樣本在260nm和280nm處的吸光度(OD值)來評估DNA的純度。純度可以通過OD260/OD280的比值來評估,對于純DNA,這個比值通常在1.8左右。如果比值低于1.8,可能表明存在蛋白質(zhì)污染;如果高于1.9,則可能存在RNA污染。此外,OD260/OD230的比值可以用來評估鹽離子等雜質(zhì)的殘留,純DNA的比值應(yīng)在2.0-2.2之間。-**瓊脂糖凝膠電泳法**:通過電泳分離DNA片段,根據(jù)DNA在凝膠上的遷移情況來評估其純度。如果泳道口中存在較亮的條帶,可能表明存在蛋白污染。2.**濃度評估**:-**紫外分光光度計**:使用紫外分光光度計測定DNA在260nm處的吸光度,根據(jù)比爾-朗伯定律(Beer-Lambertlaw)計算DNA的濃度。對于純DNA,OD260的讀數(shù)為1.0時,大約相當(dāng)于50μg/mL的雙鏈DNA。-**熒光定量法**:使用熒光染料結(jié)合DNA,通過測量熒光變化來定量DNA。這種方法比紫外分光光度法更敏感、精確,并且可能對特定的核酸有特異性。
T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應(yīng)用步驟和特點:1.**基因編輯效率評估**:-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導(dǎo)向RNA靶位點上對細(xì)胞群體進(jìn)行基因編輯的效率。-通過PCR擴(kuò)增圍繞CRISPR導(dǎo)向RNA靶位點的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導(dǎo)的非同源末端連接(NHEJ)修復(fù)事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴(kuò)增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點然后進(jìn)行雙鏈切割,通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯配DNA,不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實驗步驟**:-收集細(xì)胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴(kuò)增期望編輯的基因組區(qū)域。擴(kuò)增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴(kuò)增的DNA進(jìn)行變性和退火復(fù)性,以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物,在37℃孵育15分鐘。
Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,這使得Cas9與gRNA形成的復(fù)合物。Recombinant Human BTN1A1/Butyrophilin (His-Avi Tag)
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種經(jīng)過改造的酶,它來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通過重組技術(shù)在大腸桿菌中表達(dá)并純化獲得。這種酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等溫擴(kuò)增反應(yīng)中非常有用,如環(huán)介導(dǎo)的等溫擴(kuò)增(LAMP)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些關(guān)鍵特點和應(yīng)用:1.**等溫擴(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很強(qiáng)的鏈置換能力,適用于多種等溫擴(kuò)增反應(yīng),這些反應(yīng)通常在50-68°C之間進(jìn)行,比較好反應(yīng)溫度為65°C。2.**快速測序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速測序,特別是對于高GC含量的DNA模板或微量(納克量級)DNA模板的測序。3.**全基因組擴(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因組擴(kuò)增(WGA),這是一種在不需要熱循環(huán)儀的情況下擴(kuò)增整個基因組DNA的技術(shù)。4.**高dUTP耐受性**:與BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在進(jìn)行等溫擴(kuò)增時不具有將dUTP摻入合成的DNA鏈的能力,這使得它在某些應(yīng)用中更具優(yōu)勢。Recombinant Human BTN1A1/Butyrophilin (His-Avi Tag)
Recombinant Human CD34 (His Tag)
Recombinant Mouse LOX1 Protein
Recombinant Cynomolgus IFN alpha/beta R1 Protein
Recombinant Mouse Leptin Protein
Recombinant Human ACE2/ACEH (His Tag)
Recombinant Human IL-17 Protein
Recombinant Cynomolgus NKG2D/CD314 Protein
Recombinant Human CD37 Protein
Recombinant Human TPO Protein
Recombinant Mouse LYPD3 Protein