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Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein

來源: 發(fā)布時(shí)間:2025年01月26日

5'-3'外切核酸酶活性是指DNA聚合酶能夠從DNA鏈的5'端向3'端切除核苷酸的能力。這種活性通常用于修復(fù)受損的DNA或去除錯(cuò)誤配對(duì)的核苷酸。具體來說,5'-3'外切核酸酶活性可以在DNA合成過程中切除前方的核苷酸,幫助錯(cuò)誤或不需要的序列,從而確保DNA的正確復(fù)制和修復(fù)。在DNA聚合酶中,5'-3'外切核酸酶活性與聚合酶活性相輔相成。聚合酶在合成新鏈時(shí),5'-3'外切酶活性可以在發(fā)現(xiàn)錯(cuò)誤時(shí)進(jìn)行修正,確保合成的DNA鏈的準(zhǔn)確性。例如,E.coliDNA聚合酶I具有這種外切酶活性,可以在合成過程中去除錯(cuò)誤的核苷酸,從而提高DNA的保真度。需要注意的是,BstDNAPolymerase,LargeFragment不具有5'-3'外切核酸酶活性,這使得它在某些應(yīng)用中更為穩(wěn)定,特別是在等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)中,如LAMP(環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增)和RCA(滾環(huán)擴(kuò)增)等。FnCas12a在完成特異性切割后,還能非特異性地切割其他單鏈DNA,這一特性被用于開發(fā)了多種核酸檢測技術(shù)。Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein,hFc Tag

Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein,hFc Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過程中可以校正一些錯(cuò)誤,但保真性相對(duì)較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。

Gly-Arg-Gly-Asp-Ser盡管Ultra-Long Master Mix設(shè)計(jì)用于長片段擴(kuò)增,但在某些情況下,可能出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,需要通過優(yōu)化引物。

Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein,hFc Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對(duì)超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個(gè)重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲(chǔ)存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項(xiàng)**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應(yīng)用價(jià)值。

pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實(shí)驗(yàn)中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在免疫沉淀后切割染色質(zhì)DNA,以分析特定蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合位點(diǎn)。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質(zhì)-基因組互作研究技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在目標(biāo)蛋白質(zhì)被抗體識(shí)別后,通過核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標(biāo)蛋白質(zhì)相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術(shù)相比傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有實(shí)驗(yàn)周期短、信噪比高、可重復(fù)性好以及細(xì)胞投入量低的優(yōu)勢(shì),尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、**以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。3.**染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)**:pA-MNase在染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中用于染色質(zhì)片段化,它在核小體間DNAlinker上進(jìn)行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過程中染色質(zhì)乳化所帶來的負(fù)面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細(xì)胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對(duì)于后續(xù)的蛋白質(zhì)分析實(shí)驗(yàn)尤為重要。

將Cas9/sgRNA復(fù)合物轉(zhuǎn)染到目標(biāo)細(xì)胞中。可以使用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染、電穿孔或其他轉(zhuǎn)染技術(shù) 。

Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein,hFc Tag,標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)

T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢(shì):1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對(duì)顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動(dòng)物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(hào)(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時(shí)。可以利用現(xiàn)有的計(jì)算工具,如CRISPR design tools,預(yù)測gRNA的活性和特異性,以輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 。Recombinant Human I-TAC/CXCL11

Pfu DNA Polymerase在定點(diǎn)突變中的應(yīng)用:Pfu DNA Polymerase是定點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)的酶,因其高保真性和穩(wěn)定性。Recombinant Human Her4/ErbB4 Protein,hFc Tag

DNA片段大小對(duì)磁珠法DNA凝膠回收試劑盒的回收率有影響。根據(jù)搜索結(jié)果,我們可以得出以下結(jié)論:1.**小片段DNA(小于200bp)**:對(duì)于小于200bp的DNA片段,回收率會(huì)下降。這是因?yàn)樾∑蔚腄NA與固相基質(zhì)的結(jié)合力相對(duì)較弱,因此相對(duì)損失較大,導(dǎo)致回收率降低。在某些情況下,小于100bp的DNA片段的回收率可能只有30-60%。2.**中等大小片段DNA(200bp-4kb)**:在這個(gè)范圍內(nèi)的DNA片段,通常回收率較高,可以達(dá)到80-95%。這是因?yàn)檫@些片段大小適中,既不會(huì)因太小而損失,也不會(huì)因太大而難以洗脫。3.**大片段DNA(大于4kb)**:對(duì)于大于4kb的DNA片段,回收率也會(huì)下降,通常在30-50%之間。這是因?yàn)榇笃蔚腄NA與固相基質(zhì)的結(jié)合力更強(qiáng),因此更難洗脫。4.**片段大小與回收率的關(guān)系**:DNA片段越大,和固相基質(zhì)的結(jié)合力越強(qiáng),就越難洗脫,回收率就越低。相反,DNA的量越少,相對(duì)損失越大,回收率也越低。5.**操作技巧**:為了提高回收率,可以采取一些操作技巧,比如減少切膠體積、確保溶膠徹底、使用合適的洗脫液體積和pH值等。

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