Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**識別與結(jié)合**:-Cre重組酶首先識別并分別結(jié)合兩個(gè)LoxP序列的兩個(gè)反向重復(fù)序列,形成一個(gè)二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個(gè)二聚體互相靠近,形成由四個(gè)Cre分子與兩個(gè)LoxP位點(diǎn)結(jié)合形成的四聚體復(fù)合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個(gè)LoxP位點(diǎn)的間隔序列中引導(dǎo)單鏈切割,產(chǎn)生帶有3’端羥基的斷裂。每個(gè)LoxP位點(diǎn)的兩個(gè)單鏈分別被切割。切割產(chǎn)生的自由3’端與對側(cè)的3’端進(jìn)行交換和重連,形成Holliday交叉結(jié)構(gòu)。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結(jié)構(gòu)通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產(chǎn)物。這個(gè)過程導(dǎo)致兩個(gè)LoxP位點(diǎn)之間的DNA序列被刪除、反轉(zhuǎn)或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動子驅(qū)動,可在特定細(xì)胞或組織或全身表達(dá)Cre重組酶。與帶有Lox位點(diǎn)的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實(shí)現(xiàn)條件性基因打靶(表達(dá)或敲除靶基因)。Pfu DNA Polymerase在定點(diǎn)突變中的應(yīng)用:Pfu DNA Polymerase是定點(diǎn)突變實(shí)驗(yàn)的酶,因其高保真性和穩(wěn)定性。Recombinant Rat PLAU/uPA Protein,His Tag
在質(zhì)粒DNA提取過程中,確保DNA的完整性和活性至關(guān)重要,這通常涉及以下幾個(gè)關(guān)鍵因素:1.**溫和的裂解條件**:選擇適當(dāng)?shù)牧呀夥椒▽τ诒3諨NA的完整性至關(guān)重要。對于大于15kb的質(zhì)粒DNA,應(yīng)采用溫和的裂解方法,如將細(xì)菌懸浮于等滲的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破壞細(xì)胞壁和細(xì)胞膜,以減少對質(zhì)粒DNA的機(jī)械剪切力,從而保護(hù)其完整性。2.**避免過度裂解**:在質(zhì)粒提取過程中,并非裂解時(shí)間越長越好。過長的裂解時(shí)間可能會造成基因組DNA片段的污染,影響質(zhì)粒的純度。3.**適當(dāng)?shù)南礈旌拖疵?*:在純化過程中,適當(dāng)?shù)南礈炜梢匀コ鞍踪|(zhì)和其他雜質(zhì),但過度洗滌可能會導(dǎo)致DNA的損失。洗脫步驟中,確保洗脫液完全浸潤柱膜,以保證結(jié)合在柱膜上的質(zhì)粒得以充分洗脫,避免因洗脫體積過小而影響質(zhì)粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取過程中,添加核酸酶抑制劑可以防止DNA被核酸酶降解。同時(shí),避免長時(shí)間將DNA暴露在室溫下,以及避免多次凍融循環(huán),這些都有助于保護(hù)DNA的完整性。5.**低溫操作**:盡量在低溫條件下進(jìn)行提取操作,以減少核酸酶的活性,從而保護(hù)DNA的完整性。
耐高鹽全能核酸酶與一般核酸酶的主要區(qū)別體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**鹽耐受性**:-**耐高鹽全能核酸酶**:具有較高鹽濃度耐受性,在150-900mM鹽濃度范圍內(nèi)有效,尤其在600-700mM鹽濃度下活性比較好。-**一般核酸酶**:大多數(shù)全能核酸酶在高鹽環(huán)境下會失活,酶切效果降低。2.**活性條件**:-**耐高鹽全能核酸酶**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。-**一般核酸酶**:可能在低鹽或無鹽條件下活性更高,但在高鹽條件下活性受限。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**耐高鹽全能核酸酶**:廣泛應(yīng)用于生產(chǎn)工藝流程中高鹽環(huán)境下核酸污染去除,如病毒純化、疫苗生產(chǎn)、蛋白和多糖類制藥工業(yè)等。-**一般核酸酶**:可能更多用于一般的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如DNA或RNA的降解,但不特別針對高鹽環(huán)境。4.**酶切效果**:-**耐高鹽全能核酸酶**:能夠有效去除核酸殘留,將所有類型的DNA和RNA降解為3~5個(gè)堿基片段。-**一般核酸酶**:酶切效果可能受到高鹽環(huán)境的影響,導(dǎo)致效率降低。5.**pH范圍**:-**耐高鹽全能核酸酶**:具有寬泛的pH范圍(7.0-11.0),在這一范圍內(nèi)保持活性。-**一般核酸酶**:可能具有更窄的pH活性范圍。
BstDNA聚合酶對dUTP的耐受性對實(shí)驗(yàn)結(jié)果有以下影響:1.**防止交叉污染**:BstDNA聚合酶具有較高的dUTP耐受性,這意味著它可以在反應(yīng)體系中添加dUTP/UDG酶防污染系統(tǒng)的情況下工作,有效防止LAMP產(chǎn)物的交叉污染,確保數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。2.**保持靈敏度和擴(kuò)增效率**:即使在引入dUTP/UDG酶防污染系統(tǒng),使用dUTP替換dTTP的情況下,BstDNA聚合酶的靈敏度及擴(kuò)增效率不受影響。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,在反應(yīng)體系中添加dUTP對BstDNA聚合酶的擴(kuò)增靈敏度和效率沒有負(fù)面影響。3.**提高實(shí)驗(yàn)的可靠性**:由于BstDNA聚合酶能夠在高濃度的dUTP存在下保持活性,這使得它在進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增時(shí)更加可靠,尤其是在需要防止DNA污染的實(shí)驗(yàn)中。4.**兼容dUTP/UDG系統(tǒng)**:BstDNA聚合酶對dUTP的耐受性好,高度兼容dUTP/UDG系統(tǒng),這對于避免交叉污染和提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性至關(guān)重要。綜上所述,BstDNA聚合酶的高dUTP耐受性為等溫?cái)U(kuò)增實(shí)驗(yàn)提供了一個(gè)重要的優(yōu)勢,即在保持高靈敏度和擴(kuò)增效率的同時(shí),能夠有效防止交叉污染,從而提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性和準(zhǔn)確性。在50 μL的反應(yīng)體系中,建議使用1.5 μL的5× PCR Enhancer(如果需要)和0.5 μL的Phusion DNA Polymerase。
T5核酸外切酶(T5Exonuclease)具有以下特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用:1.**降解方向**:T5核酸外切酶按照5'→3'方向降解雙鏈或單鏈DNA。2.**起始消化位置**:T5核酸外切酶既能從單鏈或雙鏈DNA的5'末端起始消化,也可以從線性或環(huán)狀雙鏈DNA的缺口(gap)或缺刻(nick)處起始消化。3.**對超螺旋雙鏈DNA的作用**:T5核酸外切酶無法降解超螺旋雙鏈DNA。4.**單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性**:T5核酸外切酶還具有單鏈DNA核酸內(nèi)切酶活性。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-用于Gibson組裝,這是一種在恒溫條件下有效連接帶有多個(gè)重疊序列片段的技術(shù)。-從完全連接的環(huán)狀雙鏈DNA中去除不完全連接產(chǎn)物。-降解堿裂解質(zhì)粒提取方法中產(chǎn)生的變性DNA,增加超螺旋DNA比例,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。-降解質(zhì)粒樣品中污染的線性化和切刻DNA。6.**操作條件**:推薦在37℃溫育30分鐘,之后加入EDTA至終濃度為20mM終止反應(yīng)。7.**儲存條件**:-25~-15℃保存,有效期3年。8.**注意事項(xiàng)**:避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作,以防止本品失活。這些特點(diǎn)和技術(shù)應(yīng)用使得T5核酸外切酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,尤其是在DNA克隆和基因片段組裝中,具有重要的應(yīng)用價(jià)值。可以利用現(xiàn)有的計(jì)算工具,如CRISPR design tools,預(yù)測gRNA的活性和特異性,以輔助實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 。Recombinant Human Osteomodulin Protein,His Tag
利用His標(biāo)簽通過親和層析從細(xì)胞裂解物中純化目標(biāo)蛋白,然后可能通過離子交換層析、等方法進(jìn)一步提純。Recombinant Rat PLAU/uPA Protein,His Tag
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同,需要靈活運(yùn)用,并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。
Recombinant Rat PLAU/uPA Protein,His Tag
Recombinant Human CD34 (His Tag)
Recombinant Mouse LOX1 Protein
Recombinant Cynomolgus IFN alpha/beta R1 Protein
Recombinant Mouse Leptin Protein
Recombinant Human ACE2/ACEH (His Tag)
Recombinant Human IL-17 Protein
Recombinant Cynomolgus NKG2D/CD314 Protein
Recombinant Human CD37 Protein
Recombinant Human TPO Protein
Recombinant Mouse LYPD3 Protein