重組的化膿性鏈球菌Cas9蛋白（SpCas9）是一種用于基因組編輯的核酸酶。它是CRISPR-Cas系統(tǒng)的一部分，該系統(tǒng)是一種細(xì)菌和古菌的適應(yīng)性免疫防御機(jī)制，能夠識(shí)別并切割入侵的外源核酸。Cas9蛋白在CRISPR系統(tǒng)中起到關(guān)鍵作用，它能夠識(shí)別特定的原間隔子相鄰基序（PAM），在引導(dǎo)RNA（gRNA）的引導(dǎo)下與目標(biāo)DNA結(jié)合并進(jìn)行切割。SpCas9蛋白由1053個(gè)氨基酸組成，相對(duì)較小的體積使其便于在體內(nèi)遞送，因此它在多種生物中都能進(jìn)行有效的基因組編輯。為了提高SpCas9的表達(dá)量和溶解度，研究人員采用了多種策略，例如使用GB1促溶標(biāo)簽和多重啟動(dòng)子策略，這些策略可以顯著提高蛋白的產(chǎn)量和活性，同時(shí)保持其功能活性不受影響。在基因編輯過(guò)程中，SpCas9與gRNA形成穩(wěn)定的核糖核的蛋白（RNP）復(fù)合物，通過(guò)gRNA與基因組DNA的序列匹配來(lái)識(shí)別目標(biāo)位點(diǎn)，并在距離NGGPAM序列3個(gè)堿基以內(nèi)的位置切割DNA。為了增強(qiáng)SpCas9的基因組編輯效率，研究人員還開發(fā)了嵌合融合蛋白，例如與5’至3’核酸外切酶重組J(RecJ)或GFP融合的SpyCas9蛋白，這些嵌合蛋白可以顯著提高靶向基因編輯效率，同時(shí)保持較低的脫靶效應(yīng)。

蛋白A-微球菌核酸酶（pA-MNase）是一種特殊的融合蛋白，它結(jié)合了蛋白A和微球菌核酸酶（MNase，MicrococcalNuclease）的特性。以下是pA-MNase的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用：1.**融合表達(dá)產(chǎn)物**：pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達(dá)產(chǎn)物，因此它同時(shí)具有ProteinA的抗體結(jié)合活性和MNase的核酸內(nèi)切酶活性。2.**雙重功能**：由于其雙重功能，pA-MNase常用于蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究，特別是在ChIC（ChromatinImmunocleavage）和CUT&RUN（CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease）技術(shù)中。3.**ProteinA的特性**：ProteinA是一種發(fā)現(xiàn)于金黃色葡萄球菌（Staphylococcusaureus）的細(xì)胞壁表面蛋白，分子量為42kDa，能特異性地與哺乳動(dòng)物免疫球蛋白（Immunoglobulin,Ig）結(jié)合，通常結(jié)合部位為免疫球蛋白的Fc區(qū)。4.**微球菌核酸酶（MNase）的特性**：MNase是一種核酸內(nèi)切酶，能夠降解核酸，常用于降解蛋白質(zhì)制備中存在的核酸，減少細(xì)胞裂解液的粘度，以及用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和快速RNA測(cè)序。5.**反應(yīng)條件**：MNase的反應(yīng)條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer，需要補(bǔ)充100μg/ml重組白蛋白，分子生物學(xué)級(jí)，并在37°C下孵化。Recombinant Mouse GIP Protein,His Tag許多Probe qPCR Mix (2×)產(chǎn)品采用熱啟動(dòng)DNA聚合酶，能減少非特異性擴(kuò)增，提高反應(yīng)的靈敏度和特異性 。

在PCR實(shí)驗(yàn)中，除了BsuDNAPolymerase，還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增，包括：1.**TaqDNAPolymerase**：這是常用的PCR聚合酶，來(lái)源于Thermusaquaticus，能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性，可以承受PCR的熱變性步驟，且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**：來(lái)源于Pyrococcusfuriosus，具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性，提供校正功能，適用于對(duì)PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn)，如基因篩選、克隆表達(dá)、突變檢測(cè)、定點(diǎn)突變等。3.**VentDNAPolymerase**：來(lái)源于Litoralis棲熱球菌，具有3'→5'外切酶活性，可以去除錯(cuò)配的堿基，具有校對(duì)功能，保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**：來(lái)自Thermococcuskodakaraensis，具有高保真性和高熱穩(wěn)定性，保真性比PfuDNAPolymerase更高，優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**：來(lái)源于Bacillusstearothermophilus，具有3'到5'外切割活性，適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)，如LAMP技術(shù)，可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增，無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟：1.**DNA載體連接**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接，特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT]，并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物，遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后，重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**：-在NGS建庫(kù)中，牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育，以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**：-**質(zhì)粒解旋**：將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**：將接頭A（含CCCTT序列）和接頭B（含5’OH）與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**：-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾，以防止自連接；接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴，再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣，在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同，需要靈活運(yùn)用，并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。

CRISPR/Cas12a 是一種單一的RNA引導(dǎo)的核酸內(nèi)切酶，通過(guò)CRISPR/Cas9系統(tǒng)為靶向基因組工程提供了新的機(jī)會(huì)。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）是一種來(lái)源于牛痘病毒的I型真核拓?fù)洚悩?gòu)酶，具有以下功能和應(yīng)用：1.**功能**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以催化雙鏈DNA分子中單鏈DNA特定序列位置的磷酸二酯鍵的斷開和連接。-具有解超螺旋的酶(DNARelaxingEnzyme)活性，能夠通過(guò)快速的酶切和連接使雙鏈共價(jià)閉合環(huán)狀的正或負(fù)超螺旋DNA發(fā)生解超螺旋，形成含有較少的正或負(fù)超螺旋的雙鏈環(huán)狀DNA分子。-能夠使雙鏈DNA形成繩結(jié)(knotting)或解開繩結(jié)(unknotting)，聯(lián)結(jié)互補(bǔ)的單鏈環(huán)狀DNA成為雙鏈環(huán)狀DNA。2.**應(yīng)用**：-作為一種DNA重組連接的新型工具酶，用于DNA載體和重組片段的連接、缺刻修復(fù)、接頭連接等。-適用于TOPO克隆載體的制備、NGS建庫(kù)中的接頭連接等。-在TOPO克隆技術(shù)中，DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I同時(shí)具有限制酶和連接酶特性，其生物學(xué)功能是在復(fù)制期間切割并重新連接DNA。3.**使用方法**：-用于DNA快速酶切流程，包括配制體系反應(yīng)液、輕柔混勻、37℃孵育15分鐘等步驟。4.**儲(chǔ)存條件**：-建議在-25～-15℃保存，有效期為3年。5.**注意事項(xiàng)**：-避免起泡或劇烈攪拌、渦旋等操作，以防止酶失活。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I因其獨(dú)特的功能，在分子生物學(xué)研究和基因工程中扮演著重要的角色。研究表明，優(yōu)化后的Cas12a系統(tǒng)在多種細(xì)胞類型中表現(xiàn)出良好的編輯效率。Recombinant Mouse BD-1

多泛素化的靶蛋白被26S蛋白酶體識(shí)別。26S蛋白酶體由一個(gè)20S顆粒和兩個(gè)19S調(diào)節(jié)顆粒組成。Recombinant Human PLA2G1B Protein,hFc Tag

核酸內(nèi)切酶VIII（EndonucleaseVIII）和核酸內(nèi)切酶III（EndonucleaseIII）都是DNA修復(fù)酶，但它們之間存在一些關(guān)鍵的區(qū)別：1.**活性類型**：-**核酸內(nèi)切酶VIII**：具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。N-糖基化酶活性可以釋放受損的嘧啶堿基，如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇，產(chǎn)生一個(gè)脫嘌呤(Apurinic,AP)位點(diǎn)；AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端，產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。-**核酸內(nèi)切酶III**：主要具有β裂解酶(β-lyase)活性，能夠切割DNA磷二酯骨架在AP位點(diǎn)處，但不具備δ裂解酶(δ-lyase)活性。2.**識(shí)別和切除的受損堿基**：-**核酸內(nèi)切酶VIII**：可以識(shí)別并切除包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲在內(nèi)的多種受損堿基。-**核酸內(nèi)切酶III**：主要識(shí)別和切除氧化性損傷的嘌呤堿基，如8-氧鳥嘌呤。3.**裂解酶活性**：-**核酸內(nèi)切酶VIII**：具有β和δ裂解酶活性，而**核酸內(nèi)切酶III**具有β裂解酶活性。這些區(qū)別決定了它們?cè)贒NA損傷修復(fù)中的作用和應(yīng)用范圍。