EndoH糖苷內(nèi)切酶H(EndoH)在實驗中通常用于分析以下類型的糖鏈:1.**高甘露糖型糖鏈**:EndoH能夠特異性地識別并切割高甘露糖型N-連接糖鏈,這些糖鏈通常存在于未成熟的糖蛋白中。2.**某些雜合型糖鏈**:EndoH也能對某些雜合型寡聚糖的殼二糖結(jié)構(gòu)進行切割,去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖。3.**N-連接糖鏈**:EndoH主要用于去除糖蛋白中的N-連接高甘露糖,這有助于研究糖鏈結(jié)構(gòu)和糖基化模式。4.**抗體糖型分析**:在IgG中,F(xiàn)c區(qū)Asn297處的保守N-連接糖對其活性至關重要,EndoH可用于分析這些糖鏈。5.**糖蛋白的糖基化模式**:EndoH有助于分析糖蛋白的糖基化位點、糖基化程度以及糖鏈的具體結(jié)構(gòu)。6.**糖鏈分析和結(jié)構(gòu)表征**:在糖鏈分析的主要策略中,EndoH作為高效、準確、穩(wěn)定的去糖基化方法,有助于從糖蛋白上游離糖鏈,然后進行詳細的分析表征。EndoH的使用可以為研究者提供關于糖蛋白糖基化模式的重要信息,尤其是在抗體藥物研究和開發(fā)中,對于理解糖鏈如何影響藥物的活性、穩(wěn)定性和免疫原性具有重要意義。
EndoS糖苷內(nèi)切酶在ADCs制備中的具體應用步驟,根據(jù)上海藥物研究所的研究,可以概括為以下幾個關鍵環(huán)節(jié):1.**篩選糖底物和糖苷內(nèi)切酶**:研究人員篩選了一系列糖底物和糖苷內(nèi)切酶,發(fā)現(xiàn)Endo-S2酶能夠?qū)⒍堑孜風acNAc轉(zhuǎn)移至去糖抗體N297位糖基化位點,且LacNAc半乳糖6號位唾液酸化修飾不影響Endo-S2的轉(zhuǎn)糖基化活性。2.**抗體糖基化改造**:利用Endo-S2和LacNAc的組合,直接實現(xiàn)野生型抗體的糖基化改造。Endo-S2對多樣化LacNAc修飾的兼容性,可以高效獲得功能修飾的糖工程抗體。3.**設計合成藥物-連接子復合物**:研究人員設計并合成了LacNAc-linker-drug復合物結(jié)構(gòu),這是實現(xiàn)定點ADC化合物“一步”組裝的關鍵。4.**“一步”定點偶聯(lián)**:通過Endo-S2的催化作用,將小分子細胞毒藥物通過特定的糖鏈結(jié)構(gòu)直接定點連接到抗體的糖基化位點,簡化了ADCs的制備流程。5.**評價和測試**:對獲得的糖鏈定點ADC化合物進行結(jié)構(gòu)均一性、親水性、體外穩(wěn)定性及體外活性的測試。測試結(jié)果顯示,這些化合物具有非常好的結(jié)構(gòu)均一性(DAR=2)、親水性和體外穩(wěn)定性,并且在體外具有強大的瘤抑制活性。
大腸桿菌表達的重組抑肽酶(Aprotinin)是一種通過基因工程技術(shù)在大腸桿菌中生產(chǎn)的蛋白酶抑制劑,具有以下特性和應用:1.**來源**:重組抑肽酶是通過大腸桿菌(E.coli)表達系統(tǒng)生產(chǎn)的,確保了無動物源性成分,減少了病毒污染的風險。2.**結(jié)構(gòu)**:它是一種單體球狀蛋白,由58個氨基酸組成,具有三個交聯(lián)二硫鍵的單個多肽鏈。3.**功能**:作為一種競爭性、可逆的絲氨酸蛋白酶抑制劑,重組抑肽酶能夠抑制胰蛋白酶、糜蛋白酶、激肽釋放酶和血纖維蛋白溶酶等的活性。4.**應用**:在生物技術(shù)過程中,重組抑肽酶可以替代動物源性抑肽酶,用于重組蛋白生產(chǎn)中抑制絲氨酸蛋白酶的活性,以及在細胞培養(yǎng)等過程中。5.**產(chǎn)品信息**:通常以粉末形式提供,具有明確的貨號和規(guī)格,如1mg或10mg的包裝。6.**產(chǎn)品性質(zhì)**:包括外觀、溶解度、純度、蛋白含量、酶濃度和活性定義等詳細參數(shù)。7.**儲存條件**:凍干粉在2~8℃保存,有效期為2年。8.**使用方法**:推薦的結(jié)合pH>6.0,在pH<3.0的條件下不結(jié)合,可直接使用0.9%NaCl溶解,溶解后可-20℃儲存。9.**注意事項**:產(chǎn)品作科研用途,操作時需穿著實驗服并佩戴一次性手套。
確保N末端His標簽的泛素蛋白在實驗中的活性和穩(wěn)定性,需要考慮以下幾個關鍵因素:1.**儲存條件**:按照生產(chǎn)商的建議,將重組泛素蛋白凍干粉儲存在-25~-15℃的條件下,以保持其穩(wěn)定性和活性。2.**避免反復凍融**:多次凍融會降低蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性和活性。建議在使用后將剩余的蛋白質(zhì)分裝并儲存在推薦的條件下。3.**復溶條件**:按照產(chǎn)品說明,使用無菌蒸餾水或推薦的緩沖液將蛋白質(zhì)復溶至適當?shù)臐舛取Mǔ=ㄗh添加0.1%BSA以增加蛋白質(zhì)的溶解度和穩(wěn)定性。4.**使用前離心**:在使用前,將蛋白質(zhì)溶液短暫離心,以確保所有組分都沉積在底部,避免取樣時的不均勻性。5.**工作濃度和體積**:根據(jù)實驗設計,將蛋白質(zhì)稀釋至工作濃度,并盡量使用小體積以減少蛋白質(zhì)的降解。6.**避免蛋白降解**:在實驗過程中,使用蛋白酶抑制劑以防止蛋白降解酶對重組泛素蛋白的降解。7.**避免氧化**:在蛋白質(zhì)的儲存和使用過程中,避免氧化,可以通過添加抗氧化劑如DTT或TCEP。8.**避免污染**:使用無菌技術(shù)操作,確保實驗器材和環(huán)境的清潔,避免微生物污染。9.**操作環(huán)境**:在4℃或冰上進行操作,以減少蛋白質(zhì)降解和非特異性相互作用。Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,這使得Cas9與gRNA形成的復合物。
在進行IdeSProtease的分子改造時,平衡酶的活性和穩(wěn)定性是一個關鍵的挑戰(zhàn)。以下是一些策略,這些策略可以幫助研究者在提高酶穩(wěn)定性的同時保持或甚至提高其催化活性:1.**定向進化**:使用定向進化技術(shù)進行多輪的突變和篩選,以獲得在所需條件下具有改進穩(wěn)定性的酶變體,同時監(jiān)測其催化活性,確保改造后的酶保持高效催化能力。2.**結(jié)構(gòu)基礎的理性設計**:基于IdeSProtease的三維結(jié)構(gòu)信息,識別可能影響穩(wěn)定性和活性的關鍵氨基酸殘基,通過點突變或小肽插入來優(yōu)化這些區(qū)域。3.**計算模擬**:利用分子動力學模擬和計算化學方法預測突變對酶穩(wěn)定性和活性的影響,以指導理性設計。4.**糖基化修飾**:通過糖基化可以增加酶的溶解性和穩(wěn)定性,但需注意不要干擾酶的活性位點或底物結(jié)合位點。5.**活性位點附近的柔性區(qū)域改造**:通過剛化柔性區(qū)域的策略提高酶的熱穩(wěn)定性,同時保持活性位點的柔性以維持催化活性。6.**長距離相互作用分析**:研究蛋白質(zhì)內(nèi)部的長距離相互作用,識別影響穩(wěn)定性和活性的遠程突變,通過這些突變優(yōu)化酶的性能。7.**酶活性和穩(wěn)定性的權(quán)衡分析**:通過實驗數(shù)據(jù),分析酶活性和穩(wěn)定性之間的關系,找到比較好平衡點。CRISPR-Cas12a(以前稱為Cpf1)是一種類II型V型內(nèi)切酶,偏好富含胸腺嘧啶的原間隔短回文重復序列鄰近基序。Recombinant Human GBA/glucocerebrosidase Protein,His Tag
通過工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴大FnCas12a可以靶向的范圍 。Recombinant Mouse PILRA Protein,hFc Tag
SpCas9蛋白(來自化膿性鏈球菌的Cas9蛋白)在基因編輯中的主要作用是作為核酸酶,能夠精確地切割目標DNA序列。以下是SpCas9在基因編輯中的幾個關鍵步驟和作用:1.**識別和結(jié)合**:SpCas9蛋白與一個單導向RNA(sgRNA)結(jié)合,形成RNP復合物。這個復合物能夠識別并結(jié)合到基因組中與sgRNA互補的特定DNA序列。2.**PAM序列識別**:SpCas9需要一個稱為原間隔子相鄰基序(PAM)的特定序列作為識別目標DNA的先決條件。對于SpCas9,這個PAM序列通常是5'-NGG-3'。3.**DNA切割**:一旦RNP復合物與目標DNA結(jié)合,SpCas9就會在PAM序列的3個堿基對的上游位置切割DNA雙鏈,產(chǎn)生一個雙鏈斷裂(DSB)。4.**引發(fā)DNA修復**:DNA雙鏈斷裂觸發(fā)細胞的DNA修復機制,包括同源定向修復(HDR)和非同源末端連接(NHEJ)。研究人員可以利用這些修復機制來插入、刪除或替換特定的DNA序列。5.**基因修改**:通過HDR,可以在斷裂的DNA兩端引入特定的DNA模板,從而實現(xiàn)精確的基因編輯。而NHEJ通常會導致小的插入或缺失(indel),這可以用來產(chǎn)生基因的敲除或敲入。6.**提高編輯效率**:為了提高SpCas9的編輯效率,研究人員可能會使用優(yōu)化的sgRNA設計、蛋白質(zhì)工程或嵌合融合蛋白等策略。
Recombinant Mouse EPHA3 Protein
DNA Marker I plus
Recombinant Human sFasR/TNFRSF6
Recombinant Human CD34 (His Tag)
Recombinant Mouse LOX1 Protein
Recombinant Cynomolgus IFN alpha/beta R1 Protein
Recombinant Mouse Leptin Protein
Recombinant Human ACE2/ACEH (His Tag)
Recombinant Human IL-17 Protein
Recombinant Cynomolgus NKG2D/CD314 Protein