pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過(guò)特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶組成,具有以下主要應(yīng)用:1.**高通量測(cè)序建庫(kù)**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶可以用于快速構(gòu)建用于高通量測(cè)序的DNA文庫(kù),通過(guò)其轉(zhuǎn)座酶活性實(shí)現(xiàn)DNA片段化,同時(shí)加上測(cè)序接頭,簡(jiǎn)化了傳統(tǒng)DNA測(cè)序建庫(kù)的多步過(guò)程。2.**CUT&Tag技術(shù)**:這是一種新興的蛋白質(zhì)與DNA相互作用研究方法,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶利用ProteinA與特定抗體結(jié)合,將轉(zhuǎn)座酶帶到目標(biāo)蛋白附近進(jìn)行DNA切割和標(biāo)簽添加,實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)的高通量測(cè)序分析。CUT&Tag技術(shù)具有高特異性、低背景噪音、高靈敏度、良好重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn),適用于表觀遺傳學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶也可用于ATAC-seq實(shí)驗(yàn),這是一種研究染色質(zhì)可及性的方法,通過(guò)轉(zhuǎn)座酶在沒(méi)有核酸酶消化的情況下切割染色質(zhì)DNA,然后在切割位點(diǎn)加上測(cè)序接頭,進(jìn)行后續(xù)的測(cè)序分析。4.**轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)**:有研究開(kāi)發(fā)了基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5轉(zhuǎn)座酶直接作用于RNA/DNA雜交鏈,簡(jiǎn)化了建庫(kù)過(guò)程,適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,提高了樣本的利用率和測(cè)序速度。
PCR抑制劑是指那些在PCR反應(yīng)中能夠干擾或阻礙DNA擴(kuò)增的物質(zhì)。這些物質(zhì)通常來(lái)源于生物樣本本身或者樣本的收集和處理過(guò)程。以下是一些PCR抑制劑的特點(diǎn):1.**多樣性**:PCR抑制劑可以是多種不同的化合物,包括膽酸鹽、尿素、血紅素、酚類(lèi)化合物、蛋白質(zhì)、多糖、植物或血液成分等。2.**來(lái)源**:它們可能來(lái)自血液(如血紅素)、尿液(如尿素)、糞便(如膽酸鹽)、植物(如多酚和多糖)、土壤(如腐殖酸)或化學(xué)物質(zhì)(如酚類(lèi)化合物)。3.**影響**:抑制劑可以影響DNA聚合酶的活性,干擾引物的退火,或與DNA模板發(fā)生非特異性結(jié)合,導(dǎo)致PCR擴(kuò)增效率降低或特異性下降。4.**復(fù)雜性**:由于樣本來(lái)源的復(fù)雜性,不同的抑制劑可能需要不同的策略來(lái)克服。某些抑制劑可能通過(guò)物理方法(如離心、過(guò)濾)去除,而其他抑制劑可能需要化學(xué)處理或使用特定的PCR增強(qiáng)劑。5.**濃度依賴(lài)性**:抑制效果通常與抑制劑的濃度有關(guān)。在較低濃度下,某些抑制劑可能不會(huì)影響PCR,但隨著濃度增加,抑制效果會(huì)變得更加明顯。6.**特異性**:某些抑制劑可能對(duì)特定的DNA聚合酶或PCR體系有特定的影響。例如,一些抑制劑可能特別影響高GC含量的模板擴(kuò)增。Recombinant Rat IGF-1在基因編輯中,Pfu DNA Polymerase 可用于目的基因或編輯工具的克隆,減少克隆過(guò)程中的非目標(biāo)突變。
磁珠法質(zhì)粒小量抽提試劑盒中的磁珠分離通常涉及以下步驟:1.**裂解細(xì)胞**:-首先,使用裂解液(含有SDS等成分)裂解細(xì)菌細(xì)胞,釋放出質(zhì)粒DNA。2.**結(jié)合磁珠**:-將磁珠加入到裂解后的混合物中,磁珠表面通常修飾有能夠特異性結(jié)合核酸的配體,使得質(zhì)粒DNA吸附于磁珠表面。3.**磁分離**:-將含有磁珠和質(zhì)粒DNA的混合物置于磁分離架上。磁分離架產(chǎn)生磁場(chǎng),使得磁珠迅速聚集在管壁或管底。4.**未結(jié)合物質(zhì)**:-在磁珠固定后,小心移除上清液,避免擾動(dòng)磁珠。上清液中含有未吸附的蛋白質(zhì)、RNA和其他細(xì)胞碎片。5.**洗滌磁珠**:-向磁珠中加入洗滌液,輕輕混勻以去除殘留的雜質(zhì),然后再次使用磁分離架分離磁珠和洗滌液。6.**重復(fù)洗滌**:-根據(jù)試劑盒的說(shuō)明,可能需要進(jìn)行多次洗滌以確保高度純化。每次洗滌后都需洗滌液。7.**干燥磁珠**(如果需要):-在某些情況下,可能需要去除洗滌后的殘留液體,讓磁珠在磁場(chǎng)作用下干燥,但要注意不要使磁珠完全干燥,以免影響DNA的洗脫。8.**洗脫質(zhì)粒DNA**:-使用洗脫液(通常是低鹽或高pH的緩沖液)將質(zhì)粒DNA從磁珠上洗脫。洗脫液可以破壞磁珠與DNA之間的結(jié)合力,釋放DNA。。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶的高活性是其重要特性之一,這種高活性主要來(lái)源于以下幾個(gè)方面:1.**轉(zhuǎn)座酶突變體**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是由Tn5轉(zhuǎn)座酶的高活性突變體構(gòu)成的。這種突變體相比野生型Tn5轉(zhuǎn)座酶,在體外的轉(zhuǎn)座效率顯著提高,通常提升1000倍以上。2.**ProteinA融合**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶將ProteinA與高活性Tn5轉(zhuǎn)座酶融合,這種融合不僅保留了Tn5轉(zhuǎn)座酶的高效DNA切割能力,還通過(guò)ProteinA的抗體結(jié)合特性,提高了對(duì)特定DNA序列的靶向能力。3.**轉(zhuǎn)座隨機(jī)性**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶能夠在整個(gè)基因組上實(shí)現(xiàn)隨機(jī)的DNA切割,這為高通量測(cè)序提供了廣的覆蓋度。4.**穩(wěn)定性**:高活性的pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶在各種實(shí)驗(yàn)條件下都能保持穩(wěn)定,包括在不同的溫度和pH值條件下。5.**插入位點(diǎn)易測(cè)序**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶產(chǎn)生的DNA片段具有明確的插入位點(diǎn),這些位點(diǎn)容易被高通量測(cè)序技術(shù)識(shí)別和分析。6.**高效片段化**:在CUT&Tag等實(shí)驗(yàn)中,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶能夠高效地實(shí)現(xiàn)目標(biāo)蛋白結(jié)合DNA的片段化,為后續(xù)的測(cè)序和分析打下基礎(chǔ)。7.**低細(xì)胞投入量**:由于其高活性,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶允許從極少量的細(xì)胞中進(jìn)行實(shí)驗(yàn),如單細(xì)胞水平的研究。
在5'DNA腺苷酰化試劑盒中,"5'"表示DNA分子的5'端,即DNA鏈的起始端。DNA和RNA分子由核苷酸單元組成,每個(gè)核苷酸由一個(gè)糖分子、一個(gè)磷酸基團(tuán)和一個(gè)含氮堿基組成。在DNA中,糖分子是脫氧核糖。這些核苷酸通過(guò)磷酸二酯鍵連接在一起形成多核苷酸鏈。DNA鏈有兩個(gè)端點(diǎn),分別是5'端和3'端,這兩個(gè)端點(diǎn)是根據(jù)糖分子上碳原子的編號(hào)來(lái)命名的:-**5'端**(5'-phosphategroup):這個(gè)端點(diǎn)的磷酸基團(tuán)連接在脫氧核糖的第五個(gè)碳原子上。-**3'端**(3'-hydroxylgroup):這個(gè)端點(diǎn)的脫氧核糖上第三碳原子上有一個(gè)自由的羥基(-OH)。5'DNA腺苷酰化試劑盒的目的是將腺苷酸(AMP)加到DNA分子的5'端,形成5'-磷酸腺苷鍵。這種修飾對(duì)于某些分子生物學(xué)應(yīng)用非常重要,例如在RNA干擾(RNAi)、高通量測(cè)序、連接反應(yīng)或PCR檢測(cè)中制備特定的接頭或適配體。在5'DNA腺苷酰化試劑盒中,通常包含一種酶(如腺苷酸化酶或某些RNA連接酶),它可以催化將ATP中的AMP部分轉(zhuǎn)移到DNA的5'端磷酸基團(tuán)上,從而完成腺苷酰化過(guò)程。通過(guò)測(cè)序或基于PCR的方法(如T7E1酶切和測(cè)序)來(lái)驗(yàn)證gRNA的編輯效率,篩選出效率高的gRNA序列 。Recombinant Human LatexinProtein,His Tag
由于Cas9 NLS系統(tǒng)不涉及DNA的整合,因此降低了外源DNA整合至細(xì)胞基因組的風(fēng)險(xiǎn) 。Recombinant Cynomolgus LAMP5 Protein,His Tag
T4UvsX重組酶是一種來(lái)源于T4噬菌體的酶,它是RecA/Rad51家族的同源體。這種重組酶在雙鏈DNA斷裂的修復(fù)和復(fù)制叉重新啟動(dòng)的過(guò)程中起到重要作用。T4UvsX重組酶可以通過(guò)與其他DNA結(jié)合蛋白或輔助因子一起與單鏈DNA形成核酸蛋白復(fù)合物,并通過(guò)尋找與靶標(biāo)DNA的互補(bǔ)區(qū)域進(jìn)行雜交,以完成鏈置換反應(yīng)。此外,T4UvsX重組酶在生產(chǎn)時(shí)由大腸桿菌表達(dá)和純化。T4UvsX重組酶的產(chǎn)生過(guò)程涉及到基因工程和蛋白質(zhì)表達(dá)的常規(guī)技術(shù)。首先,T4噬菌體的基因序列被識(shí)別并克隆到適合的表達(dá)載體中,然后這個(gè)載體被轉(zhuǎn)化到大腸桿菌宿主細(xì)胞中。在宿主細(xì)胞內(nèi),T4UvsX基因被轉(zhuǎn)錄和翻譯,產(chǎn)生重組酶蛋白。隨后,通過(guò)一系列步驟包括細(xì)胞培養(yǎng)、蛋白質(zhì)表達(dá)、細(xì)胞裂解、蛋白質(zhì)純化等,獲得所需的T4UvsX重組酶。這一過(guò)程通常在生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行,并且需要精確的分子生物學(xué)操作和蛋白質(zhì)工程知識(shí)。
Recombinant Human CTGF/CCN2 Protein
Rat Eotaxin/CCL11
PAR-1 agonist peptide
Recombinant Mouse MXRA8 Protein
Recombinant Human PKC iota Protein
Recombinant Mouse CD21 Protein
Recombinant Mouse G-CSF
Recombinant Human NKG2C/CD159c Protein
Recombinant Cynomolgus Siglec-3/CD33 Protein
Recombinant Human GM-CSF R alpha Protein