春秋為越國地，越王曾先后在境內(nèi)埤中、大部、勾乘建都，是越國古都。秦王政二十五年（公元前222年）置諸暨縣，據(jù)《元和郡縣志》：“縣有暨浦，諸山，因以為名。”

王莽和唐時曾改疏虜縣、暨陽縣，不久仍復(fù)原名，南宋時境內(nèi)析義安縣，旋復(fù)歸諸暨，元時升為諸暨州，后改諸全州，明降為諸暨縣。1989年撤縣設(shè)市。

1996年，諸暨市面積2311.3平方千米，人口約104.4萬人。轄29個鎮(zhèn)、6個鄉(xiāng)：城關(guān)鎮(zhèn)、大唐鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、湄池鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、全堂鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、三都鎮(zhèn)、五一鎮(zhèn)、雙橋鎮(zhèn)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、草塔鎮(zhèn)、王家井鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、璜山鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、浬浦鎮(zhèn)、陳蔡鎮(zhèn)、東一鄉(xiāng)、東和鄉(xiāng)、青山鄉(xiāng)、化泉鄉(xiāng)、西巖鄉(xiāng)、斯宅鄉(xiāng)。市政府駐城關(guān)鎮(zhèn)。

1999年末，全市總面積2317.94平方千米，總?cè)丝?061267人。轄29個鎮(zhèn)、6個鄉(xiāng)：城關(guān)鎮(zhèn)、大唐鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、湄池鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、東一鄉(xiāng)、全堂鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、東和鄉(xiāng)、三都鎮(zhèn)、五一鎮(zhèn)、雙橋鎮(zhèn)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、青山鄉(xiāng)、草塔鎮(zhèn)、王家井鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、化泉鄉(xiāng)、璜山鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、浬浦鎮(zhèn)、陳蔡鎮(zhèn)、西巖鄉(xiāng)、斯宅鄉(xiāng)。共有1302個行政村、48個居委會（一說合計為1341個）。

2000年第五次人口普查，全市總?cè)丝?070675人，其中：城關(guān)鎮(zhèn)209848人、大唐鎮(zhèn)50900人、應(yīng)店街鎮(zhèn)48418人、次塢鎮(zhèn)39282人、湄池鎮(zhèn)34134人、店口鎮(zhèn)35541人、阮市鎮(zhèn)34671人、直埠鎮(zhèn)25971人、江藻鎮(zhèn)25290人、山下湖鎮(zhèn)26862人、楓橋鎮(zhèn)49789人、全堂鎮(zhèn)13532人、趙家鎮(zhèn)30059人、三都鎮(zhèn)37375人、五一鎮(zhèn)11299人、雙橋鎮(zhèn)21246人、馬劍鎮(zhèn)15927人、五泄鎮(zhèn)13423人、草塔鎮(zhèn)39304人、王家井鎮(zhèn)34813人、牌頭鎮(zhèn)47156人、同山鎮(zhèn)18650人、安華鎮(zhèn)31784人、街亭鎮(zhèn)20759人、璜山鎮(zhèn)25256人、陳宅鎮(zhèn)17005人、嶺北鎮(zhèn)11219人、里浦鎮(zhèn)18930人、陳蔡鎮(zhèn)10635人、東一鄉(xiāng)13822人、東和鄉(xiāng)19323人、青山鄉(xiāng)8400人、化泉鄉(xiāng)10884人、西巖鄉(xiāng)6834人、斯宅鄉(xiāng)12334人。

2000年末，諸暨市總面積2317.94平方千米，總?cè)丝?061829萬人。轄28個鎮(zhèn)、6個鄉(xiāng)：城關(guān)鎮(zhèn)、大唐鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)（店口湄池2鎮(zhèn)合并設(shè)立新的店口鎮(zhèn)，次年1月省政府正式批準(zhǔn)）、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、東一鄉(xiāng)、全堂鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、東和鄉(xiāng)、三都鎮(zhèn)、五一鎮(zhèn)、雙橋鎮(zhèn)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、青山鄉(xiāng)、草塔鎮(zhèn)、王家井鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、化泉鄉(xiāng)、璜山鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、涅浦鎮(zhèn)、陳蔡鎮(zhèn)、西巖鄉(xiāng)、斯宅鄉(xiāng)。共有1301個行政村、50個居委會。

2001年1月9日，浙政函[2001]1號批復(fù)同意諸暨市撤銷店口鎮(zhèn)湄池鎮(zhèn)設(shè)立新的店口鎮(zhèn)：撤銷店口鎮(zhèn)、湄池鎮(zhèn)建制，合并設(shè)立新的店口鎮(zhèn)，轄69個村、2個居委會，駐勝利村。11月16日，浙政函[2001]237號批復(fù)同意諸暨市部分行政區(qū)劃調(diào)整：一、撤銷全堂鎮(zhèn)、東一鄉(xiāng)建制，與楓橋鎮(zhèn)合并。楓橋鎮(zhèn)轄84村、5居，駐海魄大道（原址）。二、撤銷青山鄉(xiāng)建制，并入草塔鎮(zhèn)。草塔鎮(zhèn)轄60村、1居，駐天元路（原址）。三、撤銷化泉鄉(xiāng)建制，并入璜山鎮(zhèn)。璜山鎮(zhèn)轄55村，駐為民路2號（原址）。四、撤銷西巖鄉(xiāng)建制，并入陳蔡鎮(zhèn)。陳蔡鎮(zhèn)轄29村，駐下蔡村（原址）。五、部分行政區(qū)域改由諸暨市政府直轄：（1）撤銷城關(guān)鎮(zhèn)、三都鎮(zhèn)、雙橋鎮(zhèn)、五一鎮(zhèn)建制。（2）大唐鎮(zhèn)部分（望泄等5村）劃歸諸暨市政府直轄。大唐鎮(zhèn)轄38村、3居，駐開元東路18號（原址）。（3）王家井鎮(zhèn)部分（紅橋等9村）劃歸諸暨市政府直轄。王家井鎮(zhèn)轄57村、1居，駐王家井村（原址）。六、在直轄區(qū)域內(nèi)設(shè)置暨陽、浣東、陶朱等3個街道辦事處，作為諸暨市政府的派出機(jī)構(gòu)：（1）暨陽街道辦事處：管理原城關(guān)鎮(zhèn)中部的茅渚埠等71村、大橋路等35居和原屬王家井鎮(zhèn)的紅橋等9村，共80村、35居，駐浣紗北路48號（原城關(guān)鎮(zhèn)址）。（2）浣東街道辦事處：管理原城關(guān)鎮(zhèn)東部的東阮等16村和原雙橋鎮(zhèn)、五一鎮(zhèn)的行政區(qū)域，共67村，定址暨東路。（3）陶朱街道辦事處：管理原城關(guān)鎮(zhèn)西部其余部分、原三都鎮(zhèn)行政區(qū)域和原屬大唐鎮(zhèn)的望泄等5村，共68村、1居，定址環(huán)城北路。這次調(diào)整由原來的34個鎮(zhèn)鄉(xiāng)改設(shè)23個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)、3個街道辦事處，其中涉及調(diào)整的鎮(zhèn)鄉(xiāng)15個。

2001年末，諸暨市總面積2311.33平方千米，總?cè)丝?060404人。轄3個街道、23個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)：暨陽街道、浣東街道、陶朱街道、大唐鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、東和鄉(xiāng)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、草塔鎮(zhèn)、王家并鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、璜山鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、浬浦鎮(zhèn)、陳蔡鎮(zhèn)、斯宅鄉(xiāng)。共有1356個村（居）委會。

2002年末，諸暨市總面積2311平方千米，總?cè)丝?05.85萬人，轄3個街道、23個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)，16個社區(qū)、22個居民區(qū)、1301個行政村。2003年末，諸暨市總面積2311.33平方千米，總?cè)丝?05.49萬人，轄3個街道、23個鎮(zhèn)、2個鄉(xiāng)，1301個行政村、？個居委會。

2005年1月26日，浙政發(fā)函[2005]8號批復(fù)同意諸暨市撤銷陳蔡鎮(zhèn)、斯宅鄉(xiāng)建制，合并設(shè)立東白湖鎮(zhèn)，鎮(zhèn)政府駐下蔡村（原陳蔡鎮(zhèn)政府駐地）。調(diào)整后，諸暨市轄3個街道、23個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：暨陽街道、浣東街道、陶朱街道、大唐鎮(zhèn)、王家井鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、草塔鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、璜山鎮(zhèn)、浬浦鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、東白湖鎮(zhèn)、東和鄉(xiāng)。總面積2311平方千米，總?cè)丝?05.49萬人（2005年末）。市政府駐暨陽街道紅旗路26號。

2006年8月中旬，諸暨市啟動行政村規(guī)模調(diào)整。通過調(diào)整，將1301個行政村調(diào)整為468個行政村和33個社區(qū)，加上原有36個社區(qū)，全市共有村（居）537個。調(diào)整后，行政村平均人口由699人增加到1813人（純農(nóng)業(yè)人口），平均區(qū)域面積由1.73平方千米擴(kuò)大到4.26平方千米。人口在4000以上的村有10個，人口在3000至4000的村有37個，人口在2000至3000的村有126個，人口在1000至2000的村有259個，人口在1000以下的村有36個。

2012年末，全市總面積2311平方千米。總?cè)丝?07.35萬人。轄3個街道、23個鎮(zhèn)、1個鄉(xiāng)：暨陽街道、浣東街道、陶朱街道、大唐鎮(zhèn)、應(yīng)店街鎮(zhèn)、次塢鎮(zhèn)、店口鎮(zhèn)、阮市鎮(zhèn)、直埠鎮(zhèn)、江藻鎮(zhèn)、山下湖鎮(zhèn)、楓橋鎮(zhèn)、趙家鎮(zhèn)、馬劍鎮(zhèn)、五泄鎮(zhèn)、草塔鎮(zhèn)、王家井鎮(zhèn)、牌頭鎮(zhèn)、同山鎮(zhèn)、安華鎮(zhèn)、街亭鎮(zhèn)、璜山鎮(zhèn)、陳宅鎮(zhèn)、嶺北鎮(zhèn)、浬浦鎮(zhèn)、東白湖鎮(zhèn)、東和鄉(xiāng)。市政府駐暨陽街道東一路19號。