牡丹江市總面積40435平方千米，總人口270萬人。轄東安、陽明、愛民、西安4個市轄區和東寧、林口2個縣，代管綏芬河、海林、寧安、穆棱4個縣級市。市政府駐愛民區。（面積數據根據《中華人民共和國行政區劃簡冊2012》，人口為2010年戶籍人口）

東安區面積566平方千米，人口19萬人。轄5個街道：新安街道、長安街道、七星街道、五星街道、興隆街道。區政府駐新安街道。

陽明區面積358平方千米，人口23萬人。轄4個街道、4個鎮：陽明街道、前進街道、新興街道、樺林橡膠廠街道、鐵嶺鎮、樺林鎮、磨刀石鎮、五林鎮。區政府駐陽明街道。

愛民區面積359平方千米，人口23萬人。轄7個（一說8個）街道、1個鄉：向陽街道、黃花街道、鐵北街道、新華街道、大慶街道、興平街道、北山街道、北安鄉（街道）。區政府駐向陽街道。

西安區面積430平方千米，人口24萬人。轄6個街道、1個鎮、1個民族鄉：先鋒街道、火炬街道、立新街道、牡丹街道、江濱街道、沿江街道、溫春鎮、海南朝鮮族鄉（一說有7個街道，另一個是水泥街道）。區政府駐先鋒街道。

東寧縣面積7368平方千米，人口21萬人。轄6個鎮：東寧鎮、三岔口鎮、大肚川鎮、老黑山鎮、道河鎮、綏陽鎮。綏陽林業局在境內。縣政府駐東寧鎮。

林口縣面積7191平方千米，人口38萬人。轄9個鎮、2個鄉：林口鎮、古城鎮、刁翎鎮、朱家鎮、柳樹鎮、三道通鎮、龍爪鎮、蓮花鎮、青山鎮、奎山鄉、建堂鄉。縣政府駐林口鎮。

綏芬河市面積427平方千米，人口7萬人。轄2個鎮：綏芬河鎮、阜寧鎮。市政府駐綏芬河鎮長江路1號。

海林市面積9772平方千米，人口41萬人。轄8個鎮：海林鎮、長汀鎮、橫道鎮、山市鎮、柴河鎮、二道鎮、新安朝鮮族鎮、三道鎮。市政府駐海林鎮。

寧安市總面積7870平方千米，人口44萬人。轄7個鎮、5個鄉（其中3個民族鄉）：寧安鎮、東京城鎮、渤海鎮、石巖鎮、沙蘭鎮、海浪鎮、蘭崗鎮、江南朝鮮族滿族鄉、臥龍朝鮮族鄉、馬河鄉、鏡泊鄉、三陵鄉。市政府駐寧安鎮。

穆棱市面積6094平方千米，人口33萬人。轄6個鎮、2個鄉：八面通鎮、穆棱鎮、下城子鎮、馬橋河鎮、興源鎮、河西鎮、福錄鄉、共和鄉。市政府駐八面通鎮。