全區轄2個街道、6個鎮：秀英街道、海秀街道、長流鎮、西秀鎮、海秀鎮、石山鎮、永興鎮、東山鎮。
　　秀英街道　代碼460105001。轄5個社區、1個村：秀華社區（代碼～001）、秀海社區（～002）、秀中社區（～003）、秀新社區（～004）、書場社區（～005）、向榮村（～200）。
　　海秀街道　代碼460105002。轄5個社區：海港社區（代碼～001）、東方洋社區（～002）、長秀社區（～003）、金鼎社區（～004）、十一支隊家屬（～005）。
　　長流鎮　代碼460105100。轄1個社區、12個村：長流墟社區（代碼～001）、長東村（～200）、康安村（～201）、會南村（～202）、長豐村（～203）、美德村（～204）、博新村（～205）、長南村（～206）、堂善村（～207）、長流村（～208）、堂昌村（～209）、長北村（～210）、美李村（～211）。
　　西秀鎮　代碼460105101。轄11個村：博養村（代碼～200）、長德村（～201）、龍頭村（～202）、祥堂村（～203）、榮山村（～204）、新和村（～205）、豐盈村（～206）、撥南村（～207）、新海村（～208）、榮山寮村（～209）、鎮海村（～210）。
　　海秀鎮　代碼460105102。轄1個社區、6個村：海榆社區（代碼～001）、新村村（～200）、水頭村（～201）、業里村（～202）、儒益村（～203）、周仁村（～204）、永莊村（～205）。
　　石山鎮　代碼460105103。轄1個社區、11個村：石山墟社區（代碼～001）、和平村（～200）、揚佳村（～201）、道堂村（～202）、北鋪村（～203）、嶺西村（～204）、施茶村（～205）、安仁村（～206）、福安村（～207）、建新村（～208）、美嶺村（～209）、道育村（～210）。
　　永興鎮　代碼460105104。轄1個社區、8個村：永興社區（代碼～001）、永秀村（～200）、永德村（～201）、美東村（～202）、建中村（～203）、雷虎村（～204）、建群村（～205）、羅經村（～206）、博強村（～207）。
　　東山鎮　代碼460105105。轄2個社區、21個村：鎮南社區（代碼～001）、鎮北社區（～002）、東星村（～200）、儒萬村（～201）、永華村（～202）、東山村（～203）、東溪村（～204）、光明村（～205）、溪頭村（～206）、馬坡村（～207）、東蒼村（～208）、玉下村（～209）、雅德村（～210）、建豐村（～211）、文壙村（～212）、紫羅村（～213）、前進村（～214）、環湖村（～215）、東升村（～216）、溪南村（～217）、射釵村（～218）、東城村（～219）、城西村（～220）。另：東山熱作場虛擬村委會（～500）
根據《海南省行政區劃代碼（2006年4月）》整理