商、周時稱取慮國，秦時設取慮縣，自漢代起先后稱睢陵縣、陵縣、北陵縣、晉陵縣等。金興定二年（1218年）以宿遷縣古城置睢寧縣，取“睢水安寧”之意。1949年后先后隸屬淮陰專區、徐州專區，1983年改屬徐州市至今。

2000年4月1日，徐州市人民政府批準調整睢寧縣鄉鎮行政區劃：（1）撤銷蘇塘鄉，將其原轄區域并人王集鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐王西村。區劃調整后王集鎮行政區域131.5平方千米，人口7.31萬，轄44個村委會、1個場圃。（2）撤銷張圩鄉、姚集鄉，將這兩個鄉的原轄區域合并設立姚集鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐郭盧村。區劃調整后姚集鎮行政區域167.7平方千米，人口9.32萬，轄58個村委會、1個場圃。（3）撤銷龍集鄉、慶安鄉，將這兩個鄉的原轄區域合并設立慶安鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐匡橋村。區劃調整后慶安鎮行政區域127.2平方千米，人口6.81萬，轄50個村委會。（4）撤銷劉圩鄉、梁集鄉，將這兩個鄉的原轄區域合并設立梁集鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐梁北村。區劃調整后梁集鎮行政區域98.9平方千米，人口7.24萬，轄40個村委會。（5）撤銷睢河鎮，將其原轄區域并入睢城鎮，鎮政府駐睢城。區劃調整后睢城鎮行政區域109.6平方千米，人口17.4萬，轄10個居委會、40個村委會。（6）撤銷高集鄉，將其原轄區域并入嵐山鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐嵐山村。區劃調整后嵐山鎮行政區域128.2平方千米，人口7.44萬，轄46個村委會。（7）撤銷朱集鄉，將其原轄區域并入桃園鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐桃園村。區劃調整后桃園鎮行政區域119.2平方千米，人口8.02萬，轄49個村委會。（8）撤銷官山鄉、黃圩鎮，將這兩個鄉鎮的原轄區域合并設立官山鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐官北村。區劃調整后官山鎮行政區域125.2平方千米，人口7.46萬，轄40個村委會。（9）撤銷王林鎮，將其原轄區域并入邱集鎮，鎮政府駐邱集村。區劃調整后邱集鎮行政區域143平方千米，人口10.1萬，轄50個村委會、1個場圃。（10）撤銷浦棠鄉，將其原轄區域并入魏集鎮，實行鎮管村體制，鎮政府駐集北村。區劃調整后魏集鎮行政區域130平方千米，人口7.41萬，轄43個村委會、1個場圃。（11）保留李集鎮、凌城鎮、沙集鎮、高作鎮、古邳鎮、溝鎮，其行政區域和鎮政府駐地不變。（12）行政區劃調整后，全縣轄16個鎮：睢城鎮、王集鎮、姚集鎮、慶安鎮、梁集鎮、嵐山鎮、桃園鎮、官山鎮、邱集鎮、魏集鎮、李集鎮、凌城鎮、沙集鎮、高作鎮、古邳鎮、雙溝鎮。

2000年第五次人口普查，睢寧縣總人口1217820人，其中：睢城鎮175615人，王集鎮73472人，雙溝鎮56104人，嵐山鎮72109人，李集鎮50026人，桃園鎮76389人，官山鎮73662人，高作鎮55698人，沙集鎮55794人，凌城鎮71930人，邱集鎮95506人，古邳鎮63920人，姚集鎮90368人，魏集鎮70075人，粱集鎮70840人，慶安鎮66312人。

2005年1月，睢寧縣面積1767平方千米，人口131.8萬人。轄16個鎮，15個居委會、386個村委會。

2009年末，睢寧縣總面積1767平方千米、總人口34.49萬戶、132.91萬人，其中：睢城鎮面積107.6平方千米、人口192570人，王集鎮面積131.52平方千米、人口77160人，雙溝鎮面積95.27平方千米、人口57332人，嵐山鎮面積128.37平方千米、人口74945人，李集鎮面積63.68平方千米、人口52282人，桃園鎮面積109平方千米、人口74523人，官山鎮面積125.28平方千米、人口77428人，高作鎮面積62.27平方千米、人口53725人，沙集鎮面積40平方千米、人口55007人，凌城鎮面積93.65平方千米、人口76434人，邱集鎮面積140.79平方千米、人口104008人，古邳鎮面積112平方千米、人口73002人，姚集鎮面積167平方千米、人口92046人，魏集鎮面積129.38平方千米、人口72397人，梁集鎮面積98.89平方千米、人口76380人，慶安鎮面積115.71平方千米、人口72337人。（數據來源于《江蘇省統計年鑒》）