肅南裕固族自治縣位于甘肅省西北部。東鄰天祝藏族自治縣，西接肅北蒙古族自治縣，南與青海省門源回族自治縣和祁連縣相鄰，北與武威市、永昌縣接壤。東西長約650千米，南北寬約120－200千米，總面積20456平方千米。總人口4萬人（2010年）。轄2個鎮、6個鄉（其中3個民族鄉）：紅灣寺鎮、皇城鎮、馬蹄藏族鄉、康樂鄉、白銀蒙古族鄉、大河鄉、明花鄉、祁豐藏族鄉。縣政府駐紅灣寺鎮，距省會蘭州606千米。
地處祁連山中部北麓，河西走廊南側，地形成狹長地帶。境內除明花鄉屬沙漠外，其余均系祁連山區。地勢由北向東南傾斜，西高東低，平均海拔3200米。西營河、東大河、西大河、黑河、梨園河、洪水壩河、陶賴河等分別流入走廊平原地區。年均氣溫3.6℃，年均降水量253毫米。名勝古跡有祁連山自然保護區，皇城灘草場，馬蹄寺森林公園，馬蹄寺、文殊山石窟群，漢代榆木山黑石頭溝巖畫，漢代上深溝堡墓群，漢唐古城遺址，元皇城故址及紅石窩革命紀念地等。
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