截至2009年末，全區總面積23.63萬平方千米，共有14個地級行政區劃單位（其中：14個地級市），109個縣級行政區劃單位（其中：34個市轄區、7個縣級市、56個縣、12個自治縣）。首府南寧市，自治區政府駐民樂路1號。

南寧市　　轄6個市轄區、6個縣。市政府駐青秀區。
　興寧區（民生街道）　　　青秀區（長塘鎮）　　　　江南區（沙井街道）　　　西鄉塘區（衡陽街道）
　良慶區（良慶鎮）　　　　邕寧區（蒲廟鎮）
　武鳴縣（城廂鎮）　　　　隆安縣（城廂鎮）　　　　馬山縣（白山鎮）　　　　上林縣（大豐鎮）
　賓陽縣（賓州鎮）　　　　橫　縣（橫州鎮）
柳州市　　轄4個市轄區、4個縣、2個自治縣。市政府駐柳北區。
　城中區（城中街道）　　　魚峰區（麒麟街道）　　　柳南區（潭西街道）　　　柳北區（勝利街道）
　柳江縣（拉堡鎮）　　　　柳城縣（大埔鎮）　　　　鹿寨縣（鹿寨鎮）　　　　融安縣（長安鎮）
　融水苗族自治縣（融水鎮）　　　　　　　　　　　　三江侗族自治縣（古宜鎮）
桂林市　　轄5個市轄區、10個縣、2個自治縣。市政府駐象山區。
　秀峰區（麗君街道）　　　疊彩區（北門街道）　　　象山區（象山街道）　　　七星區（七星街道）
　雁山區（平山街道）
　陽朔縣（陽朔鎮）　　　　臨桂縣（臨桂鎮）　　　　靈川縣（靈川鎮）　　　　全州縣（全州鎮）
　興安縣（興安鎮）　　　　永福縣（永福鎮）　　　　灌陽縣（灌陽鎮）　　　　龍勝各族自治縣（龍勝鎮）
　資源縣（資源鎮）　　　　平樂縣（平樂鎮）　　　　荔浦縣（荔城鎮）　　　　恭城瑤族自治縣（恭城鎮）
梧州市　　轄3個市轄區、3個縣，代管1個縣級市。市政府駐長洲區。
　萬秀區（城東街道）　　　蝶山區（魚嘴街道）　　　長洲區（大塘街道）
　岑溪市（岑城鎮）
　蒼梧縣（龍圩鎮）　　　　藤　縣（藤州鎮）　　　　蒙山縣（蒙山鎮）
北海市　　轄3個市轄區、1個縣。市政府駐海城區。
　海城區（中街街道）　　　銀海區（銀灘鎮）　　　　鐵山港區（南康鎮）
　合浦縣（廉州鎮）
防城港市　　轄2個市轄區、1個縣，代管1個縣級市。市政府駐港口區。
　港口區（漁洲坪街道）　　防城區（防城鎮）
　東興市（東興鎮）
　上思縣（思陽鎮）
欽州市　　轄2個市轄區、2個縣。市政府駐欽南區。
　欽南區（水東街道）　　　欽北區（向陽街道）
　靈山縣（靈城鎮）　　　　浦北縣（小江鎮）
貴港市　　轄3個市轄區、1個縣，代管1個縣級市。市政府駐港北區。
　港北區（貴城街道）　　　港南區（江南街道）　　　覃塘區（覃塘鎮）
　桂平市（西山鎮）
　平南縣（平南鎮）
玉林市　　轄1個市轄區、4個縣，代管1個縣級市。市政府駐玉州區東門路。
　玉州區（玉城街道）
　北流市（陵城街道）
　容　縣（容州鎮）　　　　陸川縣（溫泉鎮）　　　　博白縣（博白鎮）　　　　興業縣（石南鎮）
百色市　　轄1個市轄區、10個縣、1個自治縣。市政府駐右江區向陽路13號。
　右江區（百城街道）
　田陽縣（田州鎮）　　　　田東縣（平馬鎮）　　　　平果縣（馬頭鎮）　　　　德�？h（城關鎮）
　靖西縣（新靖鎮）　　　　那坡縣（城廂鎮）　　　　凌云縣（泗城鎮）　　　　樂業縣（同樂鎮）
　田林縣（樂里鎮）　　　　西林縣（八達鎮）　　　　隆林各族自治縣（新州鎮）
賀州市　　轄1個市轄區、2個縣、1個自治縣。市政府駐八步區賀州大道。
　八步區（八步街道）
　昭平縣（昭平鎮）　　　　鐘山縣（鐘山鎮）　　　　富川瑤族自治縣（富陽鎮）
河池市　　轄1個市轄區、4個縣、5個自治縣，代管1個縣級市。市政府駐金城江區新建路。
　金城江區（金城江街道）
　宜州市（慶遠鎮）
　南丹縣（城關鎮）　　　　天峨縣（六排鎮）　　　　鳳山縣（鳳城鎮）　　　　東蘭縣（東蘭鎮）
　羅城仫佬族自治縣（東門鎮）　　　　　　　　　　　環江毛南族自治縣（思恩鎮）
　巴馬瑤族自治縣（巴馬鎮）　　　　　　　　　　　　都安瑤族自治縣（安陽鎮）
　大化瑤族自治縣（大化鎮）
來賓市　　轄1個市轄區、3個縣、1個自治縣，代管1個縣級市。市政府駐興賓區建設大道。
　興賓區（城東街道）
　合山市（嶺南鎮）
　忻城縣（城關鎮）　　　　象州縣（象州鎮）　　　　武宣縣（武宣鎮）
　金秀瑤族自治縣（金秀鎮）
崇左市　　轄1個市轄區、5個縣，代管1個縣級市。市政府駐江州區石林大道。
　江州區（太平鎮）
　憑祥市（憑祥鎮）
　扶綏縣（新寧鎮）　　　　寧明縣（城中鎮）　　　　龍州縣（龍州鎮）　　　　大新縣（桃城鎮）
　天等縣（天等鎮）

本年度沒有縣級以上行政區劃變更

鄉級行政區劃調整情況（部分）
2009年10月13日，賓陽縣蘆圩鎮更名為賓州鎮。