春秋為百越之地，戰(zhàn)國(guó)先屬越，后屬楚，秦屬九江郡。漢高祖六年（公元前201年）置贛縣。故城屢經(jīng)遷徒，初在溢漿溪（今市區(qū)西南蟠龍圩一帶）。西晉太康末年（約289年）徒葛姥城（今水東鄉(xiāng)虎崗一帶）。東晉永和五年（349年）遷今址，為南康郡治，故名南康。東晉義熙七年（411年）因城毀于兵火而遷貢水東（今水東鄉(xiāng)七里鎮(zhèn)一帶）。南朝梁承圣元年（552年）復(fù)遷今址，為南康郡治。隋開(kāi)皇九年（539年）為虔州治，城隨之名虔州。因虔為“虎”字頭，而別名虎頭州、虎頭城。隋大業(yè)元年（公元605年）為南康郡治。
　　唐武德五年（622年）為虔州治，武德七年（624年）為南康州治，武德九年（626年）為虔州治。天寶元年（724年）為南康郡治，乾元元年（758年）復(fù)為虔州治。因隋唐時(shí)期，虔州、南康郡名屢互易，城名隨之，并有虔南之別稱。五代梁開(kāi)平四年（910年）為百勝軍治所。南唐沿襲。晉高祖二年（937年）為昭信軍治所，北宋開(kāi)寶八年為軍州、虔州治所。因城居章、貢奪水合流處，北宋時(shí)曾名合流鎮(zhèn)、又名章貢。南宋紹興二十三年（1153年）二月，以虔有虔殺之義，非佳名，得旨改虔州為贛州，取章、貢二水合流之義。
　　元至元十四年（1277年）為贛州路治，后曾一度為嶺北省治。明、清為贛州府治，并依次為嶺北道、贛南道、吉南贛道、吉南贛寧道治所。民國(guó)三年（1914年）為贛南道治。民國(guó)二十一年（1932年）為第十一行政區(qū)專署駐地。民國(guó)二十二年（1933年）為贛南專區(qū)專員公署駐地。民國(guó)二十三年（1934年）為第九行政區(qū)專員公署駐地。民國(guó)二十四年（1935年）為第四行政區(qū)專員公署駐地。民國(guó)二十五年（1936年）將城區(qū)設(shè)城東、城西、城南、城北、東效五鎮(zhèn)。民國(guó)三十二年（1943年）五鎮(zhèn)合并，名贛州鎮(zhèn)。
　　1949年8月14日解放，8月15日將贛州鎮(zhèn)從贛縣劃出設(shè)市，并成立贛州市人民政府。1949年屬贛西南行署區(qū)。1950年屬贛西南行署區(qū)，1951年屬贛州專區(qū)，1954年屬贛南行政區(qū)，1964年屬贛州專區(qū)，1970年屬贛州地區(qū)。1998年，國(guó)務(wù)院（國(guó)函字[1998]114號(hào)）批復(fù)同意撤銷贛州地區(qū)和縣級(jí)贛州市，設(shè)立地級(jí)贛州市，市政府駐新設(shè)立的章貢區(qū)。以原縣級(jí)贛州市的行政區(qū)域?yàn)檎仑晠^(qū)的行政區(qū)域，區(qū)政府駐陽(yáng)明路。1999年正式撤市設(shè)區(qū)。

　　1987年，恢復(fù)設(shè)置市水上辦事處（贛民函[1987]90號(hào)批復(fù)）。1987年4月5日，沙石鄉(xiāng)、蟠龍鄉(xiāng)改設(shè)沙石鎮(zhèn)、蟠龍鎮(zhèn)（贛府廳字[1987]165號(hào)）。1989年11月23日，設(shè)立蛤湖、龍埠二鄉(xiāng)（贛民字[1989]149號(hào)批復(fù)）。1993年11月17日，撤銷水東鄉(xiāng)，設(shè)立水東鎮(zhèn)（贛民字[1993]167號(hào)批復(fù)）。
　　1997年6月5日，設(shè)立黃金街道辦事處（贛民字[1997]116號(hào)批復(fù)）。全市面積478.8平方千米，人口41.5萬(wàn)，轄5個(gè)街道、3個(gè)鎮(zhèn)、6個(gè)鄉(xiāng)：解放街道、贛江街道、南外街道、水上街道、黃金嶺街道、蟠龍鎮(zhèn)、沙石鎮(zhèn)、水東鎮(zhèn)、水西鄉(xiāng)、水南鄉(xiāng)、湖邊鄉(xiāng)、沙河鄉(xiāng)、蛤湖鄉(xiāng)、龍埠鄉(xiāng)。市政府駐陽(yáng)明路。
　　1998年8月5日，撤銷湖邊鄉(xiāng)、水南鄉(xiāng)、沙河鄉(xiāng)，設(shè)立湖邊鎮(zhèn)、水南鎮(zhèn)、沙河鎮(zhèn)（贛民字[1998]126號(hào)批復(fù)）。1998年8月5日，將南外街道辦事處分設(shè)為東外、南外街道辦事處（贛民字[1998]130號(hào)批復(fù)）。
　　1998年12月7日，撤銷水上辦事處，將其所轄交解放街道辦事處（贛民字[1998]225號(hào)批復(fù)）。
　　2000年，全區(qū)轄5個(gè)街道、6個(gè)鎮(zhèn)、3個(gè)鄉(xiāng)。根據(jù)第五次人口普查數(shù)據(jù)，全區(qū)總?cè)丝?94600人；其中：解放街道37704人、贛江街道74330人、南外街道93393人、東外街道56459人、黃金嶺街道13453人、水東鎮(zhèn)31221人、水南鎮(zhèn)30376人、蟠龍鎮(zhèn)30166人、湖邊鎮(zhèn)26954人、沙石鎮(zhèn)32622人、沙河鎮(zhèn)18569人、水西鄉(xiāng)30774人、龍埠鄉(xiāng)10378人、蛤湖鄉(xiāng)8201人。
　　2000年12月8日，撤銷水西鄉(xiāng)，設(shè)立水西鎮(zhèn)，鎮(zhèn)政府遷至赤珠嶺（贛民字[2000]369號(hào)批復(fù)）。2001年3月2日，撤銷龍埠鄉(xiāng)，劃歸沙石鎮(zhèn)；撤銷蛤湖鄉(xiāng)，劃歸湖邊鎮(zhèn)（贛民字[2001]97號(hào)批復(fù)）。
　　2002年底，章貢區(qū)轄5個(gè)街道、7個(gè)鎮(zhèn)，54個(gè)居委會(huì)、98個(gè)行政村。2003年底，全區(qū)總?cè)丝?4.6萬(wàn)人。2005年底，全區(qū)總?cè)丝?7.8萬(wàn)（不包含黃金嶺街道、蟠龍鎮(zhèn)人口）。