相傳隋代此處有一風(fēng)穴，故名鳳里，后建鳳里庵，建有石亭，旁立一對(duì)石獅，名為石獅亭，商旅往來(lái)，以石獅為標(biāo)記，久之遂成慣稱。
1942年設(shè)石獅鎮(zhèn)，屬晉江縣。1949年9月2日解放。1987年12月17日，析晉江縣石獅、蚶江、永寧3個(gè)鎮(zhèn)和祥芝鄉(xiāng)，置石獅市，由泉州市代管。1988年9月30日石獅市正式成立。
唐武德元年（618年），石獅境內(nèi)行政區(qū)域?qū)俳ㄖ菽习部h。開元六年（718年），析南安東南地置晉江縣，石獅境域?qū)偃輹x江縣。宋初，石獅境域?qū)倨胶＼姇x江縣，后屬泉州晉江縣。元代，屬泉州路（一度改稱泉州府）晉江縣。明代，石獅境域?qū)偃莞畷x江縣。
清乾隆三十一年（1766年），增設(shè)晉江縣石獅分縣。以晉江縣貼堂縣丞駐石獅街，代管安海。乾隆三十五年，石獅縣丞移駐安海舊通判署，嗣后，改設(shè)安海分縣，石獅一帶事務(wù)仍歸晉江縣處理。清代，石獅境域?qū)偃莞畷x江縣。民國(guó)元年，石獅境域?qū)倌下返罆x江縣。民國(guó)三年，屬?gòu)B門道晉江縣。民國(guó)十六年，屬福建省晉江縣。民國(guó)廿三年7月，屬福建省第五行政督察區(qū)晉江縣。民國(guó)廿四年10月，屬福建省第四行政督察區(qū)晉江縣。
1949年9月，石獅境域?qū)俑＝ㄊ〉谖逍姓讲鞂T公署晉江縣。1980年1月，屬晉江地區(qū)晉江縣。1986年1月，屬泉州市晉江縣。1987年12月經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)，石獅由鎮(zhèn)升格為省轄縣級(jí)市，并作為福建省綜合改革試驗(yàn)區(qū)。
1990年10月，撤銷石獅鎮(zhèn)建制，成立石獅街道。1991年10月，撤銷祥芝鄉(xiāng)建制，成立祥芝鎮(zhèn)。
1993年7月，石獅街道一分為四，成立寶蓋鎮(zhèn)、靈秀鎮(zhèn)、鳳里街道、湖濱街道。
1997年，全市面積159.9平方千米，人口28.2萬(wàn)，轄2個(gè)街道5鎮(zhèn)。
？年，石獅市轄2個(gè)街道、5個(gè)鎮(zhèn)，15個(gè)居委會(huì)、100個(gè)行政村。
鳳里街道 面積3.98平方千米。轄8個(gè)居委會(huì)、3個(gè)行政村：東村、后花、寬仁、館頂、仁里、新華、華南、華侖；新華、五星、大侖。
湖濱街道 面積6.17平方千米。轄6個(gè)居委會(huì)、4個(gè)行政村：湖東、新湖、湖南、金林、仙跡、花園城；曾坑、新湖、長(zhǎng)福、林邊。
蚶江鎮(zhèn) 面積34.38平方千米。轄19個(gè)行政村：石漁、錦里、蓮東、石壁、錦亭、石農(nóng)、錦江、蓮中、東、水頭、大廈、蚶江、蓮西、洪窟、古山、厝仔、蓮塘、溪前、青蓮。（另有一說(shuō)面積38.47平方千米）
祥芝鎮(zhèn) 面積46.51平方千米。轄28個(gè)行政村：伍堡、西墩、祥漁、漁、祥農(nóng)、大堡、洪厝、古浮、蓮坂、后湖、丘下、赤湖、東店、楊厝、西港、東園、蓮厝、郭厝、厝上、錦尚、盧厝、港前、謝厝、深埕、東埔一、東埔二、東埔三、奈厝前。
永寧鎮(zhèn) 轄有1個(gè)居委會(huì)、20個(gè)行政村：永寧；沙堤、下宅、郭坑、山邊、院東、郭宅、塔石、西偏、洋厝、前埔、子英、西岑、港邊、梅林、外高、浯沙、金埭、沙美、新沙堤、后桿柄。
寶蓋鎮(zhèn) 面積21.53平方千米。轄15個(gè)行政村：玉浦、上浦、雪上、塘頭、龍穴、桿頭、坑?xùn)|、前園、前坑、塘后、后、松茂、侖后、龜湖、塘邊。
靈秀鎮(zhèn) 面積16.32平方千米。轄11個(gè)行政村：彭田、前廊、塔前、港塘、仕林、塘園、鈔坑、華山、靈獅、靈峰、靈山。
1999年9月，從祥芝鎮(zhèn)分設(shè)錦尚鎮(zhèn)。錦尚鎮(zhèn)面積13.72平方千米，人口2.24萬(wàn)人。
2000年，石獅市轄2個(gè)街道、7個(gè)鎮(zhèn)：鳳里街道辦事處、湖濱街道辦事處、靈秀鎮(zhèn)、寶蓋鎮(zhèn)、蚶江鎮(zhèn)、永寧鎮(zhèn)、祥芝填、鴻山鎮(zhèn)、錦尚鎮(zhèn)。 根據(jù)第五次人口普查數(shù)據(jù)，總?cè)丝?98786人，其中：湖濱街道81494人、鳳里街道79052人、靈秀鎮(zhèn)75261人、寶蓋鎮(zhèn)54757人、蚶江鎮(zhèn)56953人、祥芝鎮(zhèn)43714人、鴻山鎮(zhèn)33157人、錦尚鎮(zhèn)24666人、永寧鎮(zhèn)49732人。
2003年末，石獅市轄2個(gè)街道（鳳里、湖濱）、7個(gè)鎮(zhèn)（永寧、蚶江、祥芝、寶蓋、靈秀、鴻山、錦尚），2個(gè)居委會(huì)、19個(gè)社區(qū)、101個(gè)行政村。2003年末，全市總戶數(shù)79857戶，總?cè)丝?03120人，其中非農(nóng)業(yè)人口100934人。湖濱街道29984人、鳳里街道32449人、靈秀鎮(zhèn)52110人、寶蓋鎮(zhèn)67379人、蚶江鎮(zhèn)49586人、祥芝鎮(zhèn)30941人、鴻山鎮(zhèn)29444人、錦尚鎮(zhèn)22377人、永寧鎮(zhèn)53474人。
2005年，石獅市轄湖濱、鳳里2個(gè)街道，靈秀、寶蓋、蚶江、永寧、祥芝、鴻山、錦尚7個(gè)鎮(zhèn)，共有20個(gè)社區(qū)、1個(gè)居委會(huì)、101個(gè)行政村。