1948年設錦西縣第九區，1958年設馬仗房鎮，屬錦西縣。1961年設葫蘆島區，屬錦州市。1969年撤區設葫蘆島鎮，屬錦西縣。1983年復設葫蘆島區，屬錦州市【1982年8月13日國務院批準，1982年9月9日遼寧省政府批準：復設錦州市葫蘆島區，以錦西縣葫蘆島鎮和稻池公社的稻池大隊、玉皇閣大隊、齊家屯大隊、岔溝大隊、毛家屯大隊、茨山大隊、南荒地大隊、躍進大隊8個大隊，及先鋒漁業大隊、望海寺漁業大隊2個漁業大隊為葫蘆島區行政區域】。

1989年屬地級錦西市【1989年6月12日，國務院（國函[1989]42號）批準：錦西市恢復升格為地級市。葫蘆島區轄原管轄的4個街道辦事處和稻池鄉，原錦西市的獨樹溝鄉】。1994年9月20日，國務院批準，錦西市更名為葫蘆島市，原葫蘆島區同時更名為龍港區（10月正式實行）。

1993年6月，國務院批準設立葫蘆島經濟技術開發區。1995年，龍港區與省級開發區葫蘆島經濟技術開發區合署辦公。2006年3月（一說4月17日），葫蘆島經濟技術開發區與龍港區分立，獨立設立開發區管委會，由葫蘆島市委、市政府直接領導，但行政社會管理職能仍由龍港區行使。

1996年，龍港區面積116平方千米，人口約14.8萬人。轄7個街道、2個鎮：雙龍街道、馬仗房東街道、馬仗房西街道、濱海街道、望海寺街道、葫蘆島街道、龍灣街道、北港鎮、連灣鎮。

2000年第五次人口普查，龍港區常住總人口168673人，其中：馬仗房東街道19302人，馬仗房西街道30160人，望海寺街道20615人，葫蘆島街道6584人，濱海街道7405人，龍灣街道20951人，雙龍街道33990人，連灣鎮20590人，北港鎮9076人。

2001年?，馬杖房東街道、馬杖房西街道分別更名為東街道、西街道。2002年3月4日，省政府（遼政[2002]62號）批復同意撤銷連灣鎮、北港鎮，設立北港街道、連灣街道、玉皇街道。

2002年6月，龍港區轄10個街道：雙龍街道、東街道、西街道、濱海街道、望海寺街道、葫蘆島街道、龍灣街道、北港街道、連灣街道、玉皇街道。共有49個社區、18個行政村，面積138平方千米，人口約20.91萬人，區政府駐馬仗房。

2006年4月，將興城市雙樹鄉建制及其部分行政區域（約34平方千米）劃歸龍港區管轄，余下區域劃歸興城市古城街道。

2010年第六次人口普查，龍港區常住總人口244053人，其中：葫蘆島街道11115人，東街道18937人，西街道32561人，望海寺街道17295人，龍灣街道21483人，濱海街道22593人，雙龍街道37255人，玉皇街道41771人，連灣街道16782人，北港街道14095人，雙樹鄉9859人，葫蘆島經濟開發區195人，葫蘆島市專利技術園區112人。