2003年，云南省轄8地級市、2地區、8自治州，9縣級市、79縣、29自治縣、12市轄區，580鎮、762鄉、175民族鄉、57街道。
縣級以上行政區劃一覽
昆明市 5區、1市、5縣、3自治縣
盤龍區 五華區 官渡區 西山區 東川區
安寧市
呈貢縣(龍城鎮) 晉寧縣(昆明鎮) 富民縣(永定鎮) 宜良縣(匡遠鎮) 嵩明縣(嵩陽鎮)
石林彝族自治縣(鹿阜鎮) 祿勸彝族苗族自治縣(屏山鎮) 尋甸回族彝族自治縣(仁德鎮)
曲靖市 1區、1市、7縣、1自治縣
麒麟區
宣威市
馬龍縣(通泉鎮) 沾益縣(西平鎮) 富源縣(中安鎮) 羅平縣(羅雄鎮) 師宗縣(丹鳳鎮)
陸良縣(中樞鎮) 會澤縣(金鐘鎮)
玉溪市 1區、6縣、3自治縣
紅塔區
江川縣(大街鎮) 澄江縣(鳳麓鎮) 通海縣(秀山鎮) 華寧縣(寧州鎮) 易門縣(龍泉鎮)
峨山彝族自治縣(雙江鎮) 新平彝族傣族自治縣(桂山鎮)
元江哈尼族彝族傣族自治縣(灃江鎮)
保山市 1區、4縣
隆陽區
施甸縣(甸陽鎮) 騰沖縣(城關鎮) 龍陵縣(龍山鎮) 昌寧縣(右甸鎮)
昭通市 1區、10縣
昭陽區
魯甸縣(文屏鎮) 巧家縣(新華鎮) 鹽津縣(鹽井鎮) 大關縣(翠華鎮) 永善縣(景新鎮)
綏江縣(中城鎮) 鎮雄縣(烏峰鎮) 彝良縣(角奎鎮) 威信縣(扎西鎮) 水富縣(云富鎮)
麗江市 1區、2縣、2自治縣
古城區
華坪縣(中心鎮) 永勝縣(永北鎮) 玉龍納西族自治縣(黃山鎮) 寧蒗彝族自治縣(大興鎮)
思茅市 1區、9自治縣
翠云區
普洱哈尼族彝族自治縣(寧洱鎮) 墨江哈尼族自治縣(聯珠鎮) 景東彝族自治縣(錦屏鎮)
景谷傣族彝族自治縣(威遠鎮) 鎮沅彝族哈尼族拉祜族自治縣(恩樂鎮)
江城哈尼族彝族自治縣(勐烈鎮)縣 孟連傣族拉祜族佤族自治縣(孟連鎮)
瀾滄拉祜族自治縣(勐朗鎮) 西盟佤族自治縣(勐梭鄉)
臨滄市 1區、5縣、3自治縣
臨翔區
鳳慶縣(鳳山鎮) 云 縣(愛華鎮) 永德縣(德黨鎮) 鎮康縣(南傘鎮)
雙江拉祜族佤族布朗族傣族自治縣(勐勐鎮)
耿馬傣族佤族自治縣(耿宣鎮) 滄源佤族自治縣(勐董鎮)
文山壯族苗族自治州 駐文山縣 8縣
文山縣(開化鎮) 硯山縣(江那鎮) 西疇縣(西灑鎮) 麻粟坡縣(麻粟鎮) 馬關縣(馬白鎮)
丘北縣(錦屏鎮) 廣南縣(蓮城鎮) 富寧縣(新華鎮)
紅河哈尼族彝族自治州 駐蒙自縣 2市、8縣、3自治縣
個舊市 開遠市
蒙自縣(文瀾鎮) 綠春縣(大興鎮) 建水縣(臨安鎮) 石屏縣(異龍鎮) 彌勒縣(彌陽鎮)
瀘西縣(中樞鎮) 元陽縣(南沙鎮) 紅河縣(迤薩鎮)
金平苗族瑤族傣族自治縣(金河鎮) 河口瑤族自治縣(河口鎮) 屏邊苗族自治縣(玉屏鎮)
西雙版納傣族自治州 駐景洪市 1市、2縣
景洪市
勐海縣(勐海鎮) 勐臘縣(勐臘鎮)
楚雄彝族自治州 駐楚雄市 1市、9縣
楚雄市
雙柏縣(妥甸鎮) 牟定縣(共和鎮) 南華縣(龍川鎮) 姚安縣(棟川鎮) 大姚縣(金碧鎮)
永仁縣(永定鎮) 元謀縣(元馬鎮) 武定縣(近城鎮) 祿豐縣(金山鎮)
大理白族自治州 駐大理市 1市、8縣、3自治縣
大理市
祥云縣(祥城鎮) 賓川縣(金牛鎮) 彌渡縣(彌城鎮) 永平縣(老街鎮) 云龍縣(石門鎮)
洱源縣(玉湖鎮) 劍川縣(金華鎮) 鶴慶縣(云鶴鎮) 漾濞彝族自治縣(上街鎮)
南澗彝族自治縣(南澗鎮) 巍山彝族回族自治縣(南詔鎮)
德宏傣族景頗族自治州 駐潞西市 2市、3縣
潞西市 瑞麗市
梁河縣(遮島鎮) 盈江縣(平原鎮) 隴川縣(章鳳鎮)
怒江傈僳族自治州 駐瀘水縣六庫鎮 2縣、2自治縣
瀘水縣(魯掌鎮) 福貢縣(上帕鎮)
貢山獨龍族怒族自治縣(茨開鎮) 蘭坪白族傈僳族自治縣(金頂鎮)
迪慶藏族自治州 駐香格里拉縣 3縣、1自治縣
香格里拉縣(建塘鎮) 德欽縣(升平鎮) 維西傈僳族自治縣(保和鎮)
縣級以上行政區劃變更情況
★紅河哈尼族彝族自治州人民政府駐地由個舊市遷移至蒙自縣。（2003年1月29日國務院【國函12號】批復）
★2003年10月30日國務院【國函113號】批復：
1．同意撤銷思茅地區和縣級思茅市，設立地級思茅市。市人民政府駐新成立的翠云區思茅鎮月光路。
2．思茅市設立翠云區，以原縣級思茅市的行政區域為翠云區的行政區域，區人民政府駐思茅鎮過街樓路。
3．地級思茅市轄原思茅地區的普洱哈尼族彝族自治縣、墨江哈尼族自治縣、景東彝族自治縣、鎮沅彝族哈尼族拉祜族自治縣、景谷傣族彝族自治縣、江城哈尼族彝族自治縣、瀾滄拉祜族自治縣、孟連傣族拉祜族佤族自治縣、西盟佤族自治縣和新設立的翠云區。
★2003年12月26日國務院【國函136號】批復：
1．同意撤銷臨滄地區和臨滄縣，設立地級臨滄市。市人民政府駐新設立的臨翔區鳳翔鎮南屏西路。
2．臨滄市設立臨翔區，以原臨滄縣的行政區域為臨翔區的行政區域。區人民政府駐鳳翔鎮南塘街。
3．臨滄市轄原臨滄地區的鳳慶縣、云縣、永德縣、鎮康縣、雙江拉祜族佤族布朗族傣族自治縣、耿馬傣族佤族自治縣、滄源佤族自治縣和新設立的臨翔區。
鄉鎮一級調整情況
2003年3月20日，云政復[2003]19號：撤銷西山區馬街鎮、黑林鋪鎮，設立馬街、黑林鋪街道辦事處。
2003年3月20日，云政復[2003]21號：撤銷官渡區關上、前衛、金馬、聯盟、龍泉、茨壩六鎮和福海鄉，設立關上、前衛、金馬、聯盟、龍泉、茨壩、福海街道辦事處。
2003年3月28日，云政復[2003]24號：撤銷彌勒縣彌陽鎮、彌東鎮，設立彌陽鎮。
2003年3月28日，云政復[2003]25號：撤銷屏邊縣玉屏鎮、滴水層鄉，設立玉屏鎮。
2003年3月29日，云政復[2003]26號：撤銷石屏縣異龍鎮、陶村鎮、冒合鎮，設立異龍鎮；撤銷寶秀鎮、亞房子鄉設立寶秀鎮。
2003年3月28日，云政復[2003]27號：撤銷建水縣臨安鎮、東壩鎮、陳官鎮，設立臨安鎮；撤銷曲江鎮、東山壩鄉設立曲江鎮。
2003年4月25日，云政復[2003]33號：撤銷蒙自縣文瀾鎮、紅寨鎮、十里鋪鎮、多法勤鎮，設立文瀾鎮。
2003年4月25日，云政復[2003]34號：撤銷個舊市黃草壩鄉、蔓耗鎮，合并設立蔓耗鎮。
2003年7月25日，云復政[2003]48號：調整元謀縣元馬鎮、能禹鎮、老城鎮行政區劃。
2003年10月9日，云政復[2003]62號：撤銷麗江市古城區大研鎮，設立束河、西安、大研、祥和4個街道事處。