西周時(shí)屬鐘離國。秦屬九江郡，今市境設(shè)有曲陽、鐘離、陰陵、東城等縣。南北朝時(shí)境內(nèi)曾置有南譙州。隋開皇初年改南譙州為滁州。因滁水為名。元屬河南江北行省。明為鳳陽府和滁州直隸州，分別管轄有鳳陽、臨淮、定遠(yuǎn)、天長和來安、全椒等縣。清初屬江南省左布政使司，康熙六年(1667年)改屬新設(shè)立的安徽省。1912年撤滁州改滁縣。
　　抗日戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期，市境為淮南抗日根據(jù)地，先后成立了津浦路東聯(lián)防辦事處、津浦路西聯(lián)防辦事處、淮南行政公署以及滁縣、來安、全椒、天長、鳳陽、定遠(yuǎn)、嘉山、定東南、滁全、定鳳懷等縣抗日民主政府。1949年1月，全境相繼解放。
　　1949年6月設(shè)滁縣專區(qū)，屬皖北行署區(qū)。滁縣專署駐滁縣。轄滁縣、來安（駐新安鎮(zhèn)）、江浦、全椒（駐襄河鎮(zhèn)）、定遠(yuǎn)（駐定城鎮(zhèn)）、鳳陽（駐府城鎮(zhèn)）、嘉山（駐明光鎮(zhèn)）、盱眙、炳輝（原天長縣改稱）等9縣。人口187.8萬人。1952年滁縣專區(qū)屬安徽省領(lǐng)導(dǎo)，原巢湖專區(qū)所屬肥東縣劃入滁縣專區(qū)，將江浦縣劃歸江蘇省揚(yáng)州專區(qū)。1955年將盱眙縣劃歸江蘇省淮陰專區(qū)。
　　1956年撤銷滁縣專區(qū)，將滁縣、來安、嘉山、炳輝、全椒、定遠(yuǎn)、鳳陽、肥東8縣劃歸蚌埠專區(qū)。1961年復(fù)設(shè)滁縣專區(qū)，專署駐滁縣。原蚌埠專區(qū)所屬滁縣、嘉山（駐明光鎮(zhèn)）、來安（駐新安鎮(zhèn)）、天長（駐天長鎮(zhèn)）、全椒（駐襄河鎮(zhèn)）、定遠(yuǎn)（駐定城鎮(zhèn)）、鳳陽（駐府城鎮(zhèn)）7縣及原由合肥市領(lǐng)導(dǎo)的肥東縣（駐店埠鎮(zhèn)）劃入滁縣專區(qū)。1965年將肥東縣劃歸巢湖專區(qū)。
　　1971年滁縣專區(qū)改稱滁縣地區(qū)，地區(qū)駐滁縣。轄滁縣、嘉山（駐明光鎮(zhèn)）、天長、來安（駐新安鎮(zhèn)）、全椒（駐襄河鎮(zhèn)）、定遠(yuǎn)（駐定城鎮(zhèn)）、鳳陽（駐府城鎮(zhèn)）等7縣。1982年改滁縣為縣級(jí)滁州市。
　　1992年12月20日，國務(wù)院批準(zhǔn)撤銷滁縣地區(qū)、滁州市，設(shè)立滁州市(地級(jí))、瑯琊區(qū)、南譙區(qū)，新設(shè)的滁州市轄瑯琊區(qū)、南譙區(qū)，及原滁縣地區(qū)的天長縣、來安縣、金椒縣、定遠(yuǎn)縣、鳳陽縣、嘉山縣。
　　1996年，面積13524平方千米，人口407.6萬，市政府駐瑯琊區(qū)。轄瑯琊、南譙2區(qū)和定遠(yuǎn)、鳳陽、來安、全椒4縣，代管天長、明光2個(gè)縣級(jí)市。
　　2000年第五次全國人口普查，滁州市總?cè)丝?001488人；瑯琊區(qū)246424人，南譙區(qū)247311人，來安縣449188人，全椒縣413220人，定遠(yuǎn)縣801966人，鳳陽縣683049人，天長市590745人，明光市569585人。
　　2004年底，全市共有16個(gè)街道、86個(gè)鎮(zhèn)、78個(gè)鄉(xiāng)。