秦置方與縣，唐寶應元年改為魚臺縣。因境內有魯隱公觀魚臺而得名。1943年成立魚豐縣，1945年恢復魚臺縣。1956年并入金鄉縣，1964年復魚臺縣。

1995年5月18日，撤銷王魯鄉，設立王魯鎮。至此，魚臺縣面積654.2平方千米，人口約42.5萬人。轄4個鎮、10個鄉：谷亭鎮、魚城鎮、清河鎮、王魯鎮、老砦鄉、唐馬鄉、武臺鄉、石集鄉、張黃鄉、羅屯鄉、李閣鄉、陳樓鄉、周堂鄉、王廟鄉。縣政府駐谷亭鎮。

1996年8月18日，撤銷張黃鄉，設立張黃鎮（魯政函民字[1996]43號）。1998年7月28日，撤銷王廟鄉，設立王廟鎮（魯政函民字[1998]19號）。至此，魚臺縣轄6個鎮、8個鄉。

2000年第五次人口普查，魚臺縣總人口426172人，其中：谷亭鎮75279人，清河鎮22491人，魚城鎮39081人，王魯鎮38517人，張黃鎮29743人，王廟鎮31113人，老砦鄉26987人，唐馬鄉31410人，武臺鄉24860人，石集鄉17318人，羅屯鄉28031人，李閣鄉20475人，陳樓鄉16579人，周堂鄉24288人。

2000年12月1日，山東省政府（魯政函民字[2000]68號）批準：撤銷武臺鄉，將其行政區域并入王魯鎮；撤銷石集鄉，將其行政區域并入清河鎮；撤銷周堂鄉，將其行政區域并入王廟鎮；撤銷李閣鄉、陳樓鄉，合并設立李閣鎮，鎮政府駐原李閣鄉政府駐地。至此，魚臺縣轄7個鎮、3個鄉：谷亭鎮、王魯鎮、張黃鎮、清河鎮、李閣鎮、魚城鎮、王廟鎮、羅屯鄉、唐馬鄉、老砦鄉。

魚臺縣轄7個鎮、3個鄉：谷亭鎮、魚城鎮、王魯鎮、張黃鎮、清河鎮、王廟鎮、李閣鎮、老砦鄉、唐馬鄉、羅屯鄉。共6個居委會、386個村委會，939個自然村。總面積654.2平方千米，總人口452742人。（根據“濟寧地名網”，估計為2004年統計數據）

2007年12月，將王魯鎮部分區域（原武臺鄉）劃歸張黃鎮管轄。2007年底，全縣總面積654.2平方千米�？側丝�45.8萬人，其中城鎮人口76843人，人口城鎮化率27.6％。有少數民族21個，2820人。轄7個鎮、3個鄉：谷亭鎮、清河鎮、魚城鎮、王魯鎮、張黃鎮、王廟鎮、李閣鎮、唐馬鄉、老砦鄉、羅屯鄉，共有392個行政村（居委會）。

2010年，撤銷谷亭鎮，設立谷亭、濱湖2個街道；撤銷老砦鄉、唐馬鄉，設立老砦鎮、唐馬鎮。調整后，全縣轄2個街道、8個鎮、1個鄉：谷亭街道、濱湖街道、清河鎮、魚城鎮、王魯鎮、張黃鎮、王廟鎮、李閣鎮、老砦鎮、唐馬鎮、羅屯鄉�？h政府駐谷亭街道。

2013年1月，《山東省人民政府關于同意調整魚臺縣部分行政區劃的批復》（魯政函民字[2013]6號）同意撤銷羅屯鄉，以其原行政區域設立羅屯鎮，鎮政府駐原羅屯鄉政府駐地。（1月15日 濟政字[2013]18號）