西周時期巨葛莊一帶就有人煙，宋代為宋遼對峙前沿。元代豐材鹽場（今塘沽鹽場）、原財鹽場建署葛沽，興國鹽場、富國鹽場建署咸水沽。清雍正九年（1731年）隸屬天津縣。1953年撤天津縣，建津南郊區。1955年改稱南郊區，一度劃歸河西區。1992年更名為津南區。

1986年，南郊區面積429平方千米，人口34.65萬人，其中農業人口27.6萬人。區政府駐咸水沽鎮。轄小站、葛沽、咸水沽3個鎮和雙閘、雙港、辛莊、南洋、北閘口、雙橋河、八里臺7個鄉，下設30個居委會、157個行政村。

1996年，津南區面積385.7平方千米，人口約36.2萬人。轄8鎮2鄉：咸水沽鎮、小站鎮、葛沽鎮、雙港鎮、八里臺鎮、南洋鎮、雙閘鎮、辛莊鎮、北閘口鄉、雙橋河鄉。區政府駐咸水沽鎮。

？年，津南區轄咸水沽、葛沽、小站、雙港、辛莊、南洋、雙橋河、北閘口、八里臺、雙閘10個鎮，173個行政村。

2000年第五次人口普查，津南區總人口417254人，其中：咸水沽鎮76472人、葛沽鎮54008人、小站鎮62461人、雙港鎮51522人、辛莊鎮32024人、南洋鎮27465人、雙橋河鎮29165人、八里臺鎮28579人、北閘口鎮34483人、雙閘鎮19081人、雙林農場1994人。

2001年，撤銷南洋鎮，并入咸水沽鎮；撤銷雙閘鎮，并入八里臺鎮。調整后，津南區轄8個鎮：咸水沽鎮、小站鎮、葛沽鎮、雙港鎮、八里臺鎮、辛莊鎮、北閘口鎮、雙橋河鎮。