1945年10月臺灣正式歸還。國民黨政府接管臺灣，考慮到地方自治的需要，乃將日本統(tǒng)治時(shí)期的五州三廳，改為八縣，并將日本統(tǒng)治時(shí)期的11市改為9省轄市、2縣轄市。其中：花蓮縣管轄區(qū)域：東為花蓮區(qū)大濁水溪河口，位于東經(jīng)121°46′16″；西為玉里區(qū)云峰東部，位于東經(jīng)120°58′48″；南為玉里區(qū)富里鄉(xiāng)，位于北緯23°5′26″；北為花蓮區(qū)大濁水南澳右岸，位于北緯24°22′23″。東臨太平洋，西隔中央山脈與臺中、高雄二縣為界，南鄰臺東縣，北以大濁水南溪與臺北縣為界。面積滿潮時(shí)為4628.5713平方千米，人口174919人。管轄縣轄市花蓮市及花蓮、鳳林、玉里等3區(qū)，共11鄉(xiāng)鎮(zhèn)（2鎮(zhèn)、9鄉(xiāng)）�？h政府于1946年1月12日正式成立，縣政府設(shè)于花蓮市中山路。

　　1946年4月，花蓮區(qū)的壽鄉(xiāng)更名為壽豐鄉(xiāng)、研海鄉(xiāng)更名為新城鄉(xiāng)；鳳林區(qū)的西新社鄉(xiāng)更名為豐濱鄉(xiāng)。1946年7月31日，撤銷花蓮區(qū)。1946年9月16日，玉里區(qū)的太平鄉(xiāng)更名為卓溪鄉(xiāng)。1946年10月1日，士林鄉(xiāng)更名為秀林鄉(xiāng)。1947年3月6日，鳳林區(qū)設(shè)立光復(fù)鄉(xiāng)，由鳳林鎮(zhèn)及瑞穗鄉(xiāng)各劃一部分增設(shè)。1948年1月1日，吉野鄉(xiāng)更名為吉安鄉(xiāng)。1948年1月15日，撤銷鳳林區(qū)。1950年，太平鄉(xiāng)改稱為卓溪鄉(xiāng)。

　　1950年臺灣省調(diào)整各縣市行政區(qū)域，其中花蓮縣行政區(qū)域照舊。花蓮縣管轄區(qū)域：東為秀林鄉(xiāng)大濁水溪河口，位于東經(jīng)121°46′16″；西為卓溪鄉(xiāng)云峰東部，位于東經(jīng)120°58′48″；南為富里鄉(xiāng)永豐村南方，位于北緯23°5′26″；北為秀林鄉(xiāng)大濁水溪右岸，位于北緯24°22′23″。東臨太平洋，西隔中央山脈與臺中、南投、高雄等縣接連，南鄰臺東縣，北接宜蘭縣。管轄花蓮市及鳳林、玉里二鎮(zhèn)，及新城、吉安、壽豐、光復(fù)、豐濱、瑞穗、富里、秀林、萬里、卓溪等10鄉(xiāng)，合計(jì)1市12鄉(xiāng)鎮(zhèn)。人口163428人，面積4628.5714平方千米�？h政府設(shè)于花蓮市。
　　1958年6月1日，萬里鄉(xiāng)更名為萬榮鄉(xiāng)。