1995年10月27日，國(guó)務(wù)院（國(guó)函[1995]96號(hào)）批準(zhǔn)同意貴港市升格為地級(jí)市，設(shè)立港南區(qū)、港北區(qū)，市政府駐港北區(qū)。港北區(qū)轄原縣級(jí)貴港市的貴城、大圩、石卡、三里、覃塘、黃練、東龍7個(gè)鎮(zhèn)和附城、武樂(lè)、慶豐、根竹、中里、奇石、大嶺、五里、蒙公、山北、古樟、振南12個(gè)鄉(xiāng)，區(qū)政府駐江濱大道。原縣級(jí)貴港市的東津、橋圩、湛江、木格、木梓5個(gè)鎮(zhèn)和八塘、新塘、瓦塘、橫嶺、平悅、思懷6個(gè)鄉(xiāng)和貴城鎮(zhèn)南江村公所、木松嶺居委會(huì)劃歸港南區(qū)管轄。
1995年，撤銷附城、慶豐、五里、八塘4鄉(xiāng)，設(shè)立港城、慶豐、五里、八塘4鎮(zhèn)；港北區(qū)實(shí)際管轄貴城、大圩、石卡、三里、覃塘、黃練、東龍、港城、慶豐、五里10個(gè)鎮(zhèn)和武樂(lè)、根竹、中里、奇石、大嶺、蒙公、山北、古樟、振南9個(gè)鄉(xiāng)；港南區(qū)實(shí)際管轄東津、橋圩、湛江、木格、木梓、八塘6個(gè)鎮(zhèn)和新塘、瓦塘、橫嶺、平悅、思懷5個(gè)鄉(xiāng)及貴城鎮(zhèn)南江村公所、木松嶺居委會(huì)。
1996年6月18日，自治區(qū)政府批復(fù)將港南區(qū)南江村公所、木松嶺居委會(huì)，八塘鎮(zhèn)的高北、大新，新塘鄉(xiāng)的大鄭、西村、榪桕、山邊、三平、三岸、陳村，橫嶺鄉(xiāng)的新陸、蘇灣、新蒙、湴村等15個(gè)村公所（居委會(huì)）劃歸貴城鎮(zhèn)管轄。
1996年，港北區(qū)面積2445平方千米，人口約104萬(wàn)人。轄10個(gè)鎮(zhèn)、9個(gè)鄉(xiāng)：貴城鎮(zhèn)、大圩鎮(zhèn)、石卡鎮(zhèn)、三里鎮(zhèn)、黃練鎮(zhèn)、港城鎮(zhèn)、覃塘鎮(zhèn)、東龍鎮(zhèn)、慶豐鎮(zhèn)、五里鎮(zhèn)、大嶺鄉(xiāng)、山北鄉(xiāng)、中里鄉(xiāng)、古樟鄉(xiāng)、奇石鄉(xiāng)、武樂(lè)鄉(xiāng)、根竹鄉(xiāng)、振南鄉(xiāng)、蒙公鄉(xiāng)。區(qū)政府駐貴城鎮(zhèn)江濱大道。
2000年第五次人口普查，港北區(qū)總?cè)丝?020701人。其中：貴城鎮(zhèn)247244人，港城鎮(zhèn)59588人，大圩鎮(zhèn)76917人，慶豐鎮(zhèn)67117人，覃塘鎮(zhèn)67252人，東龍鎮(zhèn)48400人，三里鎮(zhèn)42084人，黃練鎮(zhèn)34647人，石卡鎮(zhèn)63059人，五里鎮(zhèn)31762人，奇石鄉(xiāng)25003人，中里鄉(xiāng)62485人，根竹鄉(xiāng)24862人，武樂(lè)鄉(xiāng)27511人，山北鄉(xiāng)30163人，古樟鄉(xiāng)43246人，振南鄉(xiāng)16493人，蒙公鄉(xiāng)29510人，大嶺鄉(xiāng)23358人。
2001年2月28日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2001]26號(hào)）同意將港北區(qū)貴城鎮(zhèn)的木松嶺居委會(huì)、南江、三平、山邊、大鄭、烏桕、三岸、新陸、新蒙、蘇灣、高北、大新、陳村、西村、湴村村委會(huì)劃歸港南區(qū)管轄；港南區(qū)與港北區(qū)以郁江為界。
2003年3月6日，國(guó)務(wù)院（國(guó)函[2003]37號(hào)）批準(zhǔn)將港北區(qū)的覃塘鎮(zhèn)、黃練鎮(zhèn)、東龍鎮(zhèn)、三里鎮(zhèn)、五里鎮(zhèn)、石卡鎮(zhèn)、蒙公鄉(xiāng)、山北鄉(xiāng)、古樟鄉(xiāng)、振南鄉(xiāng)、大嶺鄉(xiāng)劃歸新設(shè)立的覃塘區(qū)管轄。調(diào)整后，港北區(qū)轄4個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)：貴城鎮(zhèn)、港城鎮(zhèn)、大圩鎮(zhèn)、慶豐鎮(zhèn)、奇石鄉(xiāng)、中里鄉(xiāng)、根竹鄉(xiāng)、武樂(lè)鄉(xiāng)。
2005年7月19日，廣西壯族自治區(qū)政府（桂政函[2005]206號(hào)）同意撤銷港北區(qū)貴城鎮(zhèn)，改設(shè)街道辦事處，以原貴城鎮(zhèn)的行政區(qū)域?yàn)樵摻值擂k事處的轄區(qū)。調(diào)整后，全區(qū)轄1個(gè)街道、3個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)：貴城街道、港城鎮(zhèn)、大圩鎮(zhèn)、慶豐鎮(zhèn)、奇石鄉(xiāng)、中里鄉(xiāng)、根竹鄉(xiāng)、武樂(lè)鄉(xiāng)。區(qū)政府駐貴城街道。