西漢至西晉本江陽縣地，成漢（304—347年）時(shí)江陽郡為夷僚（少數(shù)民族）所據(jù)，江陽郡寄武陽縣地（今井研縣南），后寄治武陽縣治（今彭山縣東北），稱西江陽郡，后復(fù)故土。東晉穆帝（345—361年）于此（今納溪區(qū)大渡口鎮(zhèn)）置漢安縣，初屬江陽郡，后為東江陽郡郡治。《永樂大典·瀘州志》：“［北］宋皇祐三年（1051年）于納溪口置軍寨，元豐元年（1078年）徙都巡檢使主之，紹定中（紹定五年，即1232年）升［納溪］寨為縣，縣治距州城下流三十里。”屬瀘州瀘川郡。《永樂大典·瀘州志》：“納溪，古寨名。……昔諸葛武侯平云南，于溪右立寨［招］降。……納溪縣，縣名。古之有溪，上控永寧界首，下注瀘江，昔諸葛武侯平定云南，蠻夷（少數(shù)民族）納貢而出此溪，因名納溪，又曰云溪。”

春秋戰(zhàn)國(guó)時(shí)，屬巴國(guó)、巴郡地。漢、晉、南北朝為江陽、漢安、綿水等縣地。隋分屬瀘川、江安、漢安等縣地，唐屬江安（漢安）、涇南縣地。北宋皇佑三年（1051年），在今永寧河入長(zhǎng)江的河口置納溪寨。南宋紹定五年（1232年）升納溪寨為納溪縣。先屬瀘州，后屬江安州。元、明、清三代均屬瀘州管轄。民國(guó)元年（1912年），屬川南軍政府，后屬下川南道、永寧道。民國(guó)十八年（1929年）撤銷永寧道，直屬四川省政府。民國(guó)二十四年（1935年），隸屬第七區(qū)行政督察專員公署。

1949年12月3日，納溪解放，同月12日成立納溪縣人民政府，隸屬瀘縣專署。1952年改屬隆昌專署，1953年初屬瀘州專署。1960年，改屬宜賓專區(qū)。1969年1月18日成立納溪縣革命委員會(huì)。1983年6月建立省轄瀘州市，納溪縣劃歸瀘州市管轄。（以上分別摘自《瀘州年鑒》2004年版及2005年版）

1995年12月24日，國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)（國(guó)函[1995]132號(hào)）：撤銷納溪縣，設(shè)立瀘州市納溪區(qū)；納溪區(qū)轄原市中區(qū)的安富街道辦事處和鄰玉鎮(zhèn)的先農(nóng)、紫陽2個(gè)村，原納溪縣的護(hù)國(guó)、花果、大渡口、白節(jié)、合面、上馬、打古、豐樂8個(gè)鎮(zhèn)和棉花坡鄉(xiāng)、龍車、渠壩、新樂、樂登5個(gè)鄉(xiāng)。1996年7月1日，納溪正式撤縣建區(qū)，區(qū)政府駐安富街道辦事處。

1996年，納溪區(qū)面積1139.7平方千米，人口45.8萬人，轄1個(gè)街道、8個(gè)鎮(zhèn)、5個(gè)鄉(xiāng)：安富街道、護(hù)國(guó)鎮(zhèn)、花果鎮(zhèn)、大渡口鎮(zhèn)、白節(jié)鎮(zhèn)、合面鎮(zhèn)、上馬鎮(zhèn)、打古鎮(zhèn)、豐樂鎮(zhèn)、棉花坡鄉(xiāng)、龍車鄉(xiāng)、渠壩鄉(xiāng)、新樂鄉(xiāng)、樂登鄉(xiāng)。區(qū)政府駐安富街道。　？年，樂登鄉(xiāng)改天仙鎮(zhèn)。調(diào)整后，納溪區(qū)轄1個(gè)街道、9個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)。

2000年第五次人口普查，納溪區(qū)總?cè)丝?25333人，其中：安富街道67916人，大渡口鎮(zhèn)37329人，護(hù)國(guó)鎮(zhèn)27252人，打古鎮(zhèn)30522人，上馬鎮(zhèn)25722人，合面鎮(zhèn)29948人，花果鎮(zhèn)27425人，豐樂鎮(zhèn)28437人，白節(jié)鎮(zhèn)31997人，天仙鎮(zhèn)14669人，棉花坡鄉(xiāng)39899人，新樂鄉(xiāng)24675人，渠壩鄉(xiāng)15462人，龍車鄉(xiāng)24080人。

2002年，納溪區(qū)轄1個(gè)街道、12個(gè)鎮(zhèn)：安富街道；豐樂、護(hù)國(guó)、渠道、合面、上馬、白節(jié)、打古、大渡口、龍車、天仙、棉花坡、新樂。共有238個(gè)村委會(huì)、35個(gè)居委會(huì)、9個(gè)社區(qū)，1844個(gè)村民小組。

2003年末，納溪區(qū)轄街道辦事處1個(gè)、鎮(zhèn)12個(gè)：大渡口鎮(zhèn)、護(hù)國(guó)鎮(zhèn)、打鼓鎮(zhèn)、上馬鎮(zhèn)、合面鎮(zhèn)、豐樂鎮(zhèn)、白節(jié)鎮(zhèn)、天仙鎮(zhèn)、棉花坡鎮(zhèn)、新樂鎮(zhèn)、渠壩鎮(zhèn)、龍車鎮(zhèn)、安富街道；共有238個(gè)村委會(huì)、19個(gè)社區(qū)（其中農(nóng)村社區(qū)10個(gè)，城市9個(gè)），3個(gè)居委會(huì)（原出處另一處沒有提到這3個(gè)居委會(huì)），1844個(gè)村民小組。總?cè)丝?70170人，139308戶，其中農(nóng)業(yè)人口385435人（占81.98%），107893戶；非農(nóng)業(yè)人口31415戶，84735人。有苗、回、彝、壯、滿、水、蒙古等17個(gè)少數(shù)民族400余人，主要分布在打古鎮(zhèn)內(nèi)。

2004年末，納溪區(qū)轄1個(gè)街道（安富）、12個(gè)鎮(zhèn)（護(hù)國(guó)、白節(jié)、合面、打古、上馬、豐樂、天仙、渠壩、新樂、龍車、大渡口、棉花坡），9個(gè)城市社區(qū)、10個(gè)農(nóng)村社區(qū)、238個(gè)行政村，1844個(gè)村民小組。

2010年第六次人口普查，納溪區(qū)常住總?cè)丝?51401人，其中：安富街道33196人，永寧街道50020人，大渡口鎮(zhèn)31871人，護(hù)國(guó)鎮(zhèn)54795人，打古鎮(zhèn)31038人，上馬鎮(zhèn)26543人，合面鎮(zhèn)33870人，棉花坡鎮(zhèn)33738人，豐樂鎮(zhèn)33628人，白節(jié)鎮(zhèn)35996人，天仙鎮(zhèn)14952人，新樂鎮(zhèn)28090人，渠壩鎮(zhèn)17526人，龍車鎮(zhèn)26138人。

2013年，省政府批復(fù)同意將棉花坡鎮(zhèn)的柿子村、九川村、大林村、大溪村、朱坪村、五頂村和五頂山社區(qū)共7個(gè)村（社區(qū)）所屬行政區(qū)域劃歸永寧街道管轄，將新樂鎮(zhèn)的炳靈村、百梯村和百梯社區(qū)共3個(gè)村（社區(qū)）所屬行政區(qū)域劃歸安富街道管轄。2013年末，全區(qū)1150.22面積平方千米，總?cè)丝?8.16萬人，其中非農(nóng)業(yè)人口9.45萬人。轄2個(gè)街道、12個(gè)鎮(zhèn)，22個(gè)城市社區(qū)、21個(gè)農(nóng)村社區(qū)、176個(gè)行政村。

2014年，瀘州市政府（瀘市府函[2014]33號(hào)）批復(fù)同意設(shè)立東升街道，轄柿子、九川、大林、大溪、五頂5個(gè)行政村。