舊城東有一臥龍岡，岡上樹繁草盛，其上空常被云霧籠罩。《史記·天官書》曰：“若煙非煙，若云非云，郁郁紛紛，蕭索輪囷，是謂卿云”。卿云，古以為祥瑞之氣，取其意，且卿通慶，故取名慶云。明洪武六年（1373）析樂安州北地置慶云縣，屬河間府滄州。清屬天津府，1958年并入鹽山縣，屬天津市。1961年復(fù)置慶云縣，屬滄州地區(qū)。1964年劃入山東省德州地區(qū)。今為德州市轄縣。

1993年8月25日，慶云縣行政區(qū)劃作了部分調(diào)整：撤銷小鄭鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入慶云鎮(zhèn)，鎮(zhèn)人民政府駐地由解集村遷至小鄭村；撤銷東郎塢鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入尚堂鄉(xiāng)；撤銷大丁廟鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入東辛店鄉(xiāng)；撤銷板營(yíng)鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入常家鄉(xiāng)；撤銷楊和尚寺鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入中丁鄉(xiāng)。1994年5月21日，將東辛店鄉(xiāng)的楊莊子、李博士、西南馬、王知縣四個(gè)村劃歸后張鄉(xiāng)。1995年6月20日，撤銷尚堂鄉(xiāng)、常家鄉(xiāng)，設(shè)立尚堂鎮(zhèn)、常家鎮(zhèn)。

1996年，慶云縣面積503.5平方千米，人口約26.5萬(wàn)人。轄4個(gè)鎮(zhèn)、7個(gè)鄉(xiāng)：慶云鎮(zhèn)、尚堂鎮(zhèn)、崔口鎮(zhèn)、常家鎮(zhèn)、大胡鄉(xiāng)、大靳鄉(xiāng)、中丁鄉(xiāng)、后張鄉(xiāng)、東辛店鄉(xiāng)、嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)、徐園子鄉(xiāng)。縣政府駐慶云鎮(zhèn)。

2000年6月15日，撤銷后張鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入慶云鎮(zhèn)；撤銷大胡鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入常家鎮(zhèn)；撤銷大靳鄉(xiāng)，將其行政區(qū)域并入尚堂鎮(zhèn)。至此，慶云縣轄4個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)：慶云鎮(zhèn)、尚堂鎮(zhèn)、常家鎮(zhèn)、崔口鎮(zhèn)、中丁鄉(xiāng)、東辛店鄉(xiāng)、徐園子鄉(xiāng)、嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)。

2000年第五次全國(guó)人口普查，慶云縣常住總?cè)丝?86427人，其中：慶云鎮(zhèn)79171人，常家鎮(zhèn)50451人，尚堂鎮(zhèn)56445人，崔口鎮(zhèn)14807人，嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)21516人，東辛店鄉(xiāng)26237人，中丁鄉(xiāng)20836人，徐園子鄉(xiāng)16964人。

2003年12月15日，慶云縣設(shè)立渤海路街道辦事處。將慶云鎮(zhèn)的文西、文中、青北、新建、新中、新興、光明、慶東、慶中、慶西等10個(gè)居委會(huì)和任店、范庵、洼于、小鄭、楊習(xí)武、東歪柳樹、西歪柳樹、信家、東周、喬萬(wàn)、解集、姜楊李、竇家、柳家、劉南純、甄家、齊家、都家、小李、東胡嶺、西胡嶺、養(yǎng)馬王、撒家、小解、李云曲、東杜樹劉、西杜樹劉、郭家樓等28個(gè)村及常家鎮(zhèn)的中石官堂、東石官堂、西石官堂等3個(gè)村，共41個(gè)村（居）劃歸渤海路街道辦事處管轄，辦事處機(jī)關(guān)駐渤海路20號(hào)。

2007年末，慶云縣總面積502平方千米。總?cè)丝?0.32萬(wàn)人，其中城鎮(zhèn)人口8.9萬(wàn)人，人口城鎮(zhèn)化率35％。有少數(shù)民族9個(gè)，8060人。轄1個(gè)街道、4個(gè)鎮(zhèn)、4個(gè)鄉(xiāng)：渤海街道、慶云鎮(zhèn)、常家鎮(zhèn)、尚堂鎮(zhèn)、崔口鎮(zhèn)、嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)、東辛店鄉(xiāng)、中丁鄉(xiāng)、徐園子鄉(xiāng)，共有381個(gè)行政村。縣政府駐渤海街道。

2010年6月，經(jīng)省政府批準(zhǔn)，撤銷東辛店鄉(xiāng)，設(shè)立東辛店鎮(zhèn)。調(diào)整后，全縣轄1個(gè)街道、5個(gè)鎮(zhèn)、3個(gè)鄉(xiāng)：渤海街道、慶云鎮(zhèn)、常家鎮(zhèn)、尚堂鎮(zhèn)、崔口鎮(zhèn)、東辛店鎮(zhèn)、嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)、中丁鄉(xiāng)、徐園子鄉(xiāng)。

2010年第六次人口普查，慶云縣常住總?cè)丝?94684人，其中：渤海路街道62560人，慶云鎮(zhèn)36135人，常家鎮(zhèn)46801人，尚堂鎮(zhèn)57241人，崔口鎮(zhèn)13747人，東辛店鎮(zhèn)23400人，嚴(yán)務(wù)鄉(xiāng)19713人，中丁鄉(xiāng)19070人，徐園子鄉(xiāng)16017人。