黑河市，原稱“大黑河屯”。“大黑河屯”是區別“小黑河屯”的稱呼。“黑河”名稱的由來，一說因其瀕臨黑龍江，黑龍江又名“黑水”，亦稱“黑河”；一說蒙古語“安巴薩哈連”，意為“大黑河”。黑河市由愛輝縣演變而來。愛輝，原稱“璦琿”，取名于璦琿河，亦作“艾渾”、“艾滸”、“愛呼”等。“璦琿”為達斡爾語，意為“可畏”。1956年為更改生僻字地名，將“璦琿”改為“愛輝”。

黑河一帶，唐分屬室韋都督府和黑水都督府，遼屬東京道室韋部，金歸蒲峪路管轄，元屬開元路，明歸奴兒干都司，清屬黑龍江將軍管轄。1685年（清康熙二十四年），黑龍江將軍衙門由江東舊璦琿城遷往江西新建璦琿城（亦稱黑龍江城，今黑河市愛輝鎮）。1690年（清康熙二十九年），黑龍江將軍遷往墨爾根城（今嫩江縣城），留副都統一員駐守。1908年8月5日（清光緒三十四年七月初九日），裁撤副都統，設置璦琿兵備道，同時于璦琿城設置璦琿直隸廳，于大黑河屯設置黑河府，同屬璦琿道管轄。

中華民國成立后，1912年6月26日，因黑龍江省財政異常困難，決定裁撤黑河府，并入璦琿直隸廳；璦琿道移駐大黑河，改稱黑河道。1913年1月23日，黑龍江省都督府令，將璦琿直隸廳改為璦琿縣，駐璦琿城，隸屬黑河道。1929年2月，裁撤黑河道，璦琿縣隸屬黑河市政籌備處。東北淪陷后，1933年5月，撤銷黑河市政籌備處。同年9月，偽璦琿縣公署遷駐黑河。1934年12月，偽滿于黑河設置黑河省，璦琿縣改歸黑河省管轄。

1945年“九三”抗日戰爭勝利后，璦琿縣劃歸黑龍江省管轄。同年11月，成立黑河地區行政辦事處，璦琿縣歸黑河地區管轄。1947年2月，黑嫩聯合省成立后，歸第五專區管轄；同年9月黑嫩省分開，第五專區恢復為黑河專區，仍隸黑河專區。1956年12月11日，國務院批準，為更改生僻字地名，將璦琿縣改為愛輝縣。1959年將西南部的霍龍門鄉劃歸嫩江縣。

1980年11月15日，國務院批準，設立黑河市（縣級），以原愛輝縣的黑河鎮、幸福公社和西崗子公社的西崗子煤礦、宋集屯煤礦、東方紅煤礦的行政區域為黑河市的行政區域。隸屬黑河地區。1983年4月28日，國務院批準，撤銷愛輝縣，并入黑河市。

1992年末，黑河市位于黑龍江省北部，黑龍江上游右岸。北與呼瑪縣為鄰，西與嫩江縣毗連，南與孫吳縣接壤，東以黑龍江為界與俄羅斯布拉戈維申斯克市（海蘭泡）隔江相望。全市總面積13994平方千米。總人口15.89萬人，其中非農業人口9.27萬人；滿、達斡爾、蒙古、朝鮮、鄂倫春等少數民族人口約占9%。轄4個街道和12個鄉鎮。市政府駐地市區中央街路南。（以上摘自《黑龍江省志·地名錄》，有改動）

1993年2月8日，國務院批準（國函[1993]12號）：撤銷黑河地區，設立黑河市（地級）；撤銷黑河市，設立黑河市愛輝區，新設的黑河市和愛輝區人民政府均駐原黑河市市區內。

2000年，愛輝區轄4個街道、3個鎮、10個鄉：海蘭街道、花園街道、興安街道、西興街道、愛輝鎮、西崗子鎮、罕達汽鎮、幸福鄉、張地營子鄉、二站鄉、北師河鄉、新生鄂倫春族鄉、四嘉子滿族鄉、坤河達斡爾族、滿族鄉、上馬廠鄉、西峰山鄉。

2000年第五次人口普查，愛輝區總人口192764人，其中：花園街道39107人，興安街道28225人，海蘭街道21043人，西興街道24329人，西崗子鎮13145人，愛輝鎮8842人，罕達汽鎮4801人，幸福鄉16067人，四嘉子滿族鄉4734人，二站鄉3007人，金水鄉3035人，張地營子鄉5433人，北師河鄉1170人，西峰山鄉2634人，新生鄂倫春族鄉1504人，坤河達斡爾滿族鄉2509人，上馬廠鄉4524人，錦河農場8655人。

2008年9月1日，黑龍江省民政廳批復，同意黑河市愛輝區罕達汽鎮政府駐地由罕達汽村遷移至紅旗村。

愛輝區現轄4個街道、3個鎮、8個鄉（其中3個民族鄉）：花園街道、興安街道、海蘭街道、西興街道、西崗子鎮、愛輝鎮、罕達汽鎮、幸福鄉、四嘉子滿族鄉、坤河達斡爾族滿族鄉、上馬廠鄉、張地營子鄉、西峰山鄉、新生鄂倫春族鄉、二站鄉。

璦琿地名系滿語“可畏”之意，一名艾渾、愛呼、艾滸。以境內的艾虎河（一名鼎河，今蘇聯境內的藏嘎河）故名。此地遠在周以前為肅慎地；漢至三國時期為挹婁地；晉時入寇漫汗；后魏、北齊屬豆莫婁國；隋時分屬靺鞨黑水及北室韋地；唐同之；五代至遼屬五國部；金為扶余路的轄境；元時為斡赤斤分地，后屬開元路；明時在此設置考郎兀、忽里吉山、巴忽魯等衛。

清康熙二十二年（1683年）為抗擊沙皇俄國的入侵，于黑龍江左岸（今蘇聯境內的維笑勒依村）設置鎮守黑龍江等處的將軍，筑城駐兵，任命抗俄名將薩布素為第一任黑龍江將軍。康熙二十四年（1685年）黑龍江將軍移駐江右岸的達呼爾族城堡一托爾加城（今愛琿公社）并稱此地為新愛琿城，又名黑龍江城，將軍及副都統均移駐新愛琿城。而江左岸的城堡稱舊愛琿，設城守尉鎮守，康熙二十九年（1690年）根據將軍薩布素關于墨爾根“首尾易制”的奏請，黑龍江將軍駐地移至墨爾根城，黑龍江城由城守尉駐守。

庚子事變后，曖琿、黑河及黑龍江右岸的各都市均為俄軍占領。光緒三十二年（1906年），歸還后，清政府復設璦琿副都統，同時又設置了興東道，二者以遜河為界。同年在黑河設交涉局，光緒三十四年（1908年）撤消交涉局，并于此地設置黑河副部統府，黑河副都統府設立后的第二年，即宣統元年（1909年）撤消璦琿副部統府。以兵備道代之，道臺駐璦琿，與此同時設置璦琿廳。

民國元年（1912年）黑河副都統府撤消，所管事務均移交璦琿廳及兵備道管理，同年改兵備道為觀察使，并移駐黑河。民國二年（1913年）改接澤廳為璦琿縣，此后觀察使改為道尹，稱之為黑河道尹，璦琿縣為黑河道所轄。民國十八年（1929年）東北政務委員會成立，廢道制，縣歸省直轄，本縣直隸黑龍江省為一等縣。偽滿大同二年（1933年）縣公署由璦琿移駐大黑河。康德元年（1934年）十二月一日，偽滿洲國改行帝制，實行地方行政機構改革，成立黑河管公署，此地為黑河省省會所在地。民國三十四年（1945年）東北光復，民國三十六年（1947年），將偽北安，黑河二省合并為黑龍江省，本縣劃歸黑龍江省所轄。

1949年建國后，全縣劃為黑河城區、愛輝區、四嘉子區、西崗子區、張地營子區、罕達汽區、霍龍門區，共7個行政區，轄8個街、28個行政村、137個自然屯。1950年，將霍龍門區并入罕達汽區，全縣由原來7個行政區變為6個行政區，共轄48個行政村。

1956年4月，實行撤區劃鄉，撤銷原來的四嘉子、愛輝、西崗子、張地營子的區級機構。因黑河鎮人口多，對私營工商業改造任務繁重，罕達汽地處山區，鄉村分散，又是新區，所以仍保留黑河鎮區和罕達汽區（撤區劃分鄉后的行政區劃見《愛輝縣志》相關表格）。1957年區、鄉又有所變化（具體見《愛輝縣志》相關表格）。

1958年，人民公社的建立，實行了鄉社合一，它既是行政單位又是經濟單位。當時，全縣有：黑河鎮人民公社、火箭人民公社（后改稱幸福人民公社）、四嘉子人民公社、愛輝人民公社、西崗子人民公社、上馬廠人民公社、張地營子人民公社、罕達汽人民公社、新生人民公社。1965年5月，新建二站人民公社。1977年1月，新建西峰山人民公社。1979年9月，新建北師河人民公社。

1980年11月15日，國務院批準設立黑河市，以愛輝縣的黑河鎮、幸福公社和西崗子公社的西崗子煤礦、宋集屯煤礦、東方紅煤礦為其行政區域。1983年4月28日，國務院批準撤銷愛輝縣，將該縣行政區域并入黑河市。【1980年12月原愛輝縣所屬黑河鎮、幸福公社、西崗子煤礦、東方紅煤礦分出組建黑河市，1983年又撤銷愛輝縣并入黑河市。（根據《愛輝縣志》）】