縣境有蒲子山，“相傳堯師伊蒲子隱處，漢以此山名縣”。一說，似當以盛產蒲草為名。北魏于今縣城西北15千米古縣村置平昌縣，屬北吐京郡。太和二十一年（497）于今縣城東南25千米黑龍關鎮別置石城縣，屬五城郡。北周于石城縣置石城郡。大象元年（579）廢石城郡、縣，改置蒲子縣，屬定陽郡，徙治今城關西8千米略東村。

隋開皇元年（581）平昌縣廢入蒲子縣，徙治平昌縣故治。大業二年（606）改蒲縣，徙治今城關西南1千米，屬龍泉郡。唐武德元年（618）徙治今城關。次年于縣置昌州；又于今城關西別置昌原縣，于今城關西南20千米別置常安縣，俱屬昌州。貞觀元年（627）廢昌州及昌原、常安2縣，蒲縣屬隰州。

金興定五年（1221）升蒲州。元復為蒲縣，后廢入隰川縣。旋復置，屬隰州。明屬平陽府。清先后屬吉州、隰州。民國初年屬河東道，道廢后直屬省。1949年屬臨汾專區。1954年屬晉南專區。1958年廢入呂梁縣。1961年復置。1967年屬晉南地區。1970年屬臨汾地區。

1997年，蒲縣轄4個鎮、11個鄉：城關鎮、克城鎮、薛關鎮、黑龍關鎮、公峪鄉、太林鄉、紅道鄉、化樂鄉、西坪垣鄉、山口鄉、山中鄉、喬家灣鄉、古縣鄉、曹村鄉、刁口鄉。縣政府駐城關鎮。

2000年第五次人口普查，全縣總人口98860人，其中：城關鎮22889人，薛關鎮7509人，黑龍關鎮13225人，克城鎮10900人，山中鄉2886人，山口鄉1006人，古縣鄉4389人，紅道鄉2342人，西坪垣鄉1306人，刁口鄉1019人，化樂鄉6517人，曹村鄉3550人，喬家灣鄉7385人，太林鄉9074人，公峪鄉4863人。

2001年區劃調整后，全縣轄4個鎮、5個鄉：蒲城鎮、薛關鎮、黑龍關鎮、克城鎮、山中鄉、古縣鄉、紅道鄉、喬家灣鄉、太林鄉。縣政府駐蒲城鎮。