“科爾沁”系蒙古語譯音，意為“帶弓箭的衛隊”。清順治七年（1650）設科爾沁左翼后旗，簡稱“科左后旗”。咸豐五年（1855）僧格林沁晉升為親王，賜“博多勒噶臺”號，又稱博多勒噶臺親王旗，簡稱“博王旗”。中華民國時期，先后劃入奉天省，遼北省。1947年劃入內蒙古自治區。1969～1979年曾屬吉林省轄。

1996年?，科爾沁左翼后旗面積11533平方千米，人口37.8萬人，其中蒙古族占70%。轄5鎮26蘇木3鄉：甘旗卡鎮、吉爾嘎朗鎮、金寶屯鎮、伊胡塔鎮、常勝鎮、哈日烏蘇蘇木、滿斗蘇木、潮海蘇木、散都蘇木、胡勒順淖爾蘇木、海斯改蘇木、浩坦蘇木、海魯吐蘇木、烏順艾勒蘇木、公河來蘇木、巴雅斯古愣蘇木、查日蘇蘇木、巴彥茫哈蘇木、阿古拉蘇木、努古斯臺蘇木、額莫勒蘇木、阿都沁蘇木、茂道吐蘇木、花燈蘇木、沙日塔拉蘇木、哈日額日格蘇木、烏蘭敖道蘇木、朝魯吐蘇木、巴彥毛都蘇木、布敦哈日根蘇木、巴嘎塔拉蘇木、向陽鄉、雙勝鄉、鐵牛鄉。

2000年第五次人口普查，科爾沁左翼后旗總人口387577人，其中：甘旗卡鎮50343人，盒寶屯鎮23015人，吉爾嘎朗鎮19371人，常勝鎮9527人，伊胡塔鎮10749人，查日蘇鎮14465人，散都鎮8015人，哈日烏蘇蘇木4375人，滿斗蘇木7211人，潮海蘇木4762人，鐵牛鄉9059人，胡勒順淖爾蘇木8326人，海斯改蘇木9956人，烏順艾里蘇木6328人，公河來蘇木10990人，浩坦蘇木18137人，巴雅斯古楞蘇木9372人，阿古拉蘇木10367人，向陽鄉21675人，雙勝鄉19660人，巴彥茫哈蘇木5887人，布敦哈日根蘇木8987人，巴嘎塔拉蘇木6751人，努古斯臺蘇木6555人，花燈蘇木5372人，額奠勒蘇木10621人，阿都沁蘇木7453人，茂道吐蘇木8593人，烏蘭敖道蘇木5786人，朝魯吐蘇木6098人，巴彥毛都蘇木6920人，沙日塔拉蘇木5627人，海力吐蘇木8272人，哈日額日格蘇木6689人，勝利農場7538人，孟根達壩牧場2027人，查金臺牧場2698人。

2000年，撤銷哈拉勿蘇、滿斗、潮海3個蘇木，并入甘旗卡鎮；撤銷鐵牛鄉、胡勒順淖爾蘇木，并入常勝鎮；撤銷烏順艾里蘇木，并入吉爾嘎朗鎮；撤銷布敦哈拉根蘇木，并入金寶屯鎮；撤銷海力吐蘇木、巴彥茫哈蘇木，合并設立海力吐鎮；撤銷阿古拉蘇木、哈日格蘇木，合并設立阿古拉鎮；撤銷努古斯臺蘇木、花燈蘇木，合并設立努古斯臺鎮；撤銷朝魯吐蘇木、沙日塔拉蘇木，合并設立朝魯吐鎮。

2000年末，科左后旗總人口103345戶389474人，其中蒙古族279011人，占全旗總人口的71.6%。2001年，科左后旗總面積11576.4平方千米，總人口389920人，其中蒙古族人口占全旗總人口的72.6%。

2005年，科爾沁左翼后旗轄12個鎮、10個蘇木、2個鄉：甘旗卡鎮、金寶屯鎮、吉爾嘎朗鎮、常勝鎮、伊胡塔鎮、查日蘇鎮、散都鎮、阿古拉鎮、努古斯臺鎮、朝魯吐鎮、海魯吐鎮、勝利鎮、海斯改蘇木、公河來蘇木、浩坦蘇木、巴雅斯古楞蘇木、向陽鄉、雙勝鄉、巴嘎塔拉蘇木、額莫勒蘇木、阿都沁蘇木、茂道吐蘇木、烏蘭敖道蘇木、巴彥毛都蘇木。

2006年，撤銷伊胡塔鎮、海斯改蘇木，并入甘旗卡鎮；撤銷散都鎮、公河來蘇木，并入常勝鎮；撤銷巴嘎塔拉蘇木，并入努古斯臺鎮；撤銷巴彥毛都蘇木，并入朝魯吐鎮；撤銷巴雅斯古楞蘇木，并入海魯吐鎮；撤銷額莫勒蘇木，并入阿都沁蘇木；撤銷烏蘭敖道蘇木，并入茂道吐蘇木；撤銷浩坦蘇木，并入查日蘇鎮；撤銷雙勝鄉、向陽鄉、勝利鎮，合并設立雙勝鎮。調整后，全旗轄10個鎮、2個蘇木：甘旗卡鎮、吉爾嘎朗鎮、金寶屯鎮、常勝鎮、查日蘇鎮、雙勝鎮、阿古拉鎮、朝魯吐鎮、努古斯臺鎮、海魯吐鎮、阿都沁蘇木、茂道吐蘇木。

2006年末，全旗總面積11543.13平方千米。轄10個鎮、2個蘇木、12個國營農牧林漁場，262個嘎查村。總人口398149人，其中，蒙古族290793人，占人口總數的73%，其他少數民族2314人，占人口總數的0.58%。

2009年末，全旗總面積11570平方千米。總人口40.65萬人。其中，蒙古族人口30.08萬人，漢族人口9.84萬人，滿族人口0.62萬人，回族0.07萬人。轄10個鎮、2個蘇木、12個國營農牧林漁場、1個街道辦事處，10個社區、15個居委會、262個嘎查村、21個分場。

2012年，設立巴胡塔蘇木、散都蘇木、巴彥毛都蘇。調整后，全旗轄10個鎮、5個蘇木：甘旗卡鎮、吉爾嘎朗鎮、金寶屯鎮、常勝鎮、查日蘇鎮、雙勝鎮、阿古拉鎮、朝魯吐鎮、努古斯臺鎮、海魯吐鎮、阿都沁蘇木、茂道吐蘇木、巴胡塔蘇木、散都蘇木、巴彥毛都蘇木。