冠縣因春秋時期在此設冠氏邑而得名（杜預曰：冠氏即館陶也）。隋開皇六年（586年）置冠氏縣。元初，屬東平路；至元六年（1269），冠氏縣升為冠州，直隸中書省。明洪武三年（1370）降州改稱冠縣，隸山東布政使司東昌府。清屬山東省東昌府。1913年屬山東省濟西道；1914年改屬東臨道；1927年廢道級建制，直隸山東�。�1937年，屬山東省第六區。

1937年，建立冠縣抗日縣政府，1939年屬魯西北行政委員會；1940年4月屬魯西北專署，同年11月屬魯西區第三專署；1941年7月屬冀魯豫區第三專署，同年9月屬晉冀魯豫邊區政府第十八專署。1943年7月屬冀南區第七專署；1945年6月屬冀魯豫區第七專署。1945年8月，冠縣并入永智縣；1945年10月，屬冀南第一專署。1945年12月，恢復冠縣，仍屬冀南第一專署。1949年8月，屬平原省聊城專署。1952年11月，平原省撤銷，改屬山東省聊城專區（1967年改稱聊城地區）。1998年3月，屬地級聊城市。

1996年，冠縣面積1161.3平方千米，人口約72.7萬人。轄7個、鎮15個鄉：冠城鎮、北館陶鎮、清水鎮、桑阿鎮、賈鎮、東古城鎮、柳林鎮、甘官屯鄉、辛集鄉、店子鄉、蘭沃鄉、煙莊鄉、斜店鄉、梁堂鄉、定遠寨鄉、白塔集鄉、楊召鄉、史莊鄉、孫疃鄉、范寨鄉、萬善鄉、元造戶鄉。縣政府駐冠城鎮。

2000年第五次全國人口普查，冠縣常住總人口707131人，其中：冠城鎮79605人，東古城鎮44626人，桑阿鎮32446人，賈鎮35656人，柳林鎮26743人，清水鎮32638人，北館陶鎮30749人，孫疃鄉28454人，斜店鄉33420人，梁堂鄉30917人，白塔集鄉25289人，定遠寨鄉30056人，煙莊鄉36152人，蘭沃鄉31458人，辛集鄉28326人，史莊鄉12984人，范寨鄉30555人，元造戶鄉19682人，甘官屯鄉40355人，店子鄉28350人，萬善鄉27770人，楊召鄉20906人。

2001年3月，孫疃鄉并入冠城鎮，白塔集鄉并入桑阿鎮，楊召鄉并入東古城鎮，史莊鄉并入辛集鄉，元造戶鄉并入柳林鎮。

2002年末，冠縣轄7個鎮、10個鄉：冠城鎮、清水鎮、柳林鎮、賈鎮、桑阿鎮、東古城鎮、北館陶鎮、斜店鄉、梁堂鄉、煙莊鄉、辛集鄉、范寨鄉、蘭沃鄉、店子鄉、萬善鄉、定遠寨鄉、甘官屯鄉。

2007年末，全縣總面積1152平方千米�？側丝�75.79萬人，其中城鎮人口6.34萬人，人口城鎮化率8.37％。有少數民族20個，16500人。轄7個鎮、10個鄉，754個行政村（居委會）。

2010年，撤銷冠城鎮、煙莊鄉，設立清泉街道、崇文街道、煙莊街道；撤銷店子鄉，設立店子鎮。調整后，全縣轄3個街道、7個鎮、8個鄉：清泉街道、崇文街道、煙莊街道、賈鎮、桑阿鎮、柳林鎮、清水鎮、東古城鎮、北館陶鎮、店子鎮、斜店鄉、梁堂鄉、定遠寨鄉、辛集鄉、范寨鄉、甘官屯鄉、蘭沃鄉、萬善鄉�？h政府駐清泉街道。

2010年第六次人口普查，冠縣常住總人口764864人，其中：清泉街道75714人，崇文街道53274人，煙莊街道39493人，賈鎮38752人，桑阿鎮60484人，柳林鎮49376人，清水鎮34403人，東古城鎮70579人，北館陶鎮35870人，店子鎮29188人，斜店鄉34450人，梁堂鄉32237人，定遠寨鄉33595人，辛集鄉42774人，范寨鄉32359人，甘官屯鄉42119人，蘭沃鄉31346人，萬善鄉28851人。

2012年末，全縣戶籍總人口81.18萬人。轄3個街道、7個鎮、8個鄉，共有754個行政村（居委會）。

2013年，撤銷定遠寨鄉、辛集鄉，設立定遠寨鎮、辛集鎮（魯政函民字[2013]34號）。調整后，全縣轄3個街道、9個鎮、6個鄉：清泉街道、崇文街道、煙莊街道、賈鎮、桑阿鎮、柳林鎮、清水鎮、東古城鎮、北館陶鎮、店子鎮、定遠寨鎮、辛集鎮、斜店鄉、梁堂鄉、范寨鄉、甘官屯鄉、蘭沃鄉、萬善鄉。