今淳安縣包括原遂安縣。兩縣均建置于208年，為劃歙縣東鄉(xiāng)、南鄉(xiāng)而設(shè)，時稱始新縣和新定縣。新定縣于280年改名遂安縣。始新縣名幾經(jīng)更迭，于1131年定名淳安縣。1958年10月，撤銷遂安縣，并入淳安縣。
2000年第五次人口普查，淳安縣總?cè)丝?82347人，其中：千島湖鎮(zhèn)58065人、文昌鎮(zhèn)10653人、茶園鎮(zhèn)1051人、臨岐鎮(zhèn)18380人、威坪鎮(zhèn)21344人、唐村鎮(zhèn)11528人、姜家鎮(zhèn)10904人、梓桐鎮(zhèn)16706人、汾口鎮(zhèn)33914人、中洲鎮(zhèn)14452人、大墅鎮(zhèn)12962人、楓樹蛉鎮(zhèn)10969人、星商鄉(xiāng)8127人、金峰鄉(xiāng)4705人、富溪鄉(xiāng)3539人、富文鄉(xiāng)6480人、淡竹鄉(xiāng)2040人、許源鄉(xiāng)2403人、桐子塢鄉(xiāng)2793人、左口鄉(xiāng)5971人、汪宅鄉(xiāng)4447人、屏門鄉(xiāng)11071人、瑤山鄉(xiāng)8850人、光昌鄉(xiāng)5805人、葉家鄉(xiāng)11975人、王阜鄉(xiāng)9529人、嚴家鄉(xiāng)5189人、宋村鄉(xiāng)5614人、鳩坑鄉(xiāng)3795人、南賦鄉(xiāng)3319人、浪川鄉(xiāng)16157人、郭村鄉(xiāng)10343人、東亭鄉(xiāng)4116人、龍源鄉(xiāng)5995人、百畝畈鄉(xiāng)4752人、安陽鄉(xiāng)9715人、白馬鄉(xiāng)4689人。2000年末，全縣人口44.93萬人，轄25個鄉(xiāng)、12個鎮(zhèn)，899個行政村、16個居委會。
2001年8月10日，浙政函[2001]152號批復(fù)同意淳安縣部分行政區(qū)劃調(diào)整：撤銷茶園鎮(zhèn)、富溪鄉(xiāng)建制，合并設(shè)立石林鎮(zhèn)。石林鎮(zhèn)轄17村，駐富德村（原富溪鄉(xiāng)址）。撤銷東亭鄉(xiāng)、桐子塢鄉(xiāng)建制，合并設(shè)立界首鄉(xiāng)。界首鄉(xiāng)轄31村，駐姚家村（原東亭鄉(xiāng)址）。撤銷龍源鄉(xiāng)、百畝畈鄉(xiāng)建制，合并設(shè)立橫沿鄉(xiāng)。橫沿鄉(xiāng)轄28村，駐龍源村（原龍源鄉(xiāng)址）。撤銷許源鄉(xiāng)建制，與里商鄉(xiāng)合并。里商鄉(xiāng)轄31村，駐里陽村（原址）。撤銷南賦鄉(xiāng)建制，與鳩坑鄉(xiāng)合并。鳩坑鄉(xiāng)轄23村，駐中聯(lián)村（原南賦鄉(xiāng)址）。撤銷淡竹鄉(xiāng)建制，并入千島湖鎮(zhèn)。千島湖鎮(zhèn)轄34村、12居，駐騎龍巷22號（原址）。撤銷葉家鄉(xiāng)，并入威坪鎮(zhèn)。威坪鎮(zhèn)轄67村、1居，駐興華街321號（原址）。2001年末，淳安縣轄12個鎮(zhèn)、18個鄉(xiāng)：千島湖鎮(zhèn)、臨岐鎮(zhèn)、威坪鎮(zhèn)、姜家鎮(zhèn)、汾口鎮(zhèn)、大墅鎮(zhèn)、唐村鎮(zhèn)、梓桐鎮(zhèn)、中洲鎮(zhèn)、文昌鎮(zhèn)、石林鎮(zhèn)、楓樹嶺鎮(zhèn)、屏門鄉(xiāng)、浪川鄉(xiāng)、安陽鄉(xiāng)、王阜鄉(xiāng)、郭村鄉(xiāng)、里商鄉(xiāng)、金峰鄉(xiāng)、瑤山鄉(xiāng)、光昌鄉(xiāng)、宋村鄉(xiāng)、鳩坑鄉(xiāng)、嚴家鄉(xiāng)、白馬鄉(xiāng)、左口鄉(xiāng)、汪宅鄉(xiāng)、富文鄉(xiāng)、界首鄉(xiāng)、橫沿鄉(xiāng)。共有16個居民區(qū)、899個行政村。
2002年末，全縣總面積4452平方千米，人口45.11萬人。轄12個鎮(zhèn)、18個鄉(xiāng)，16個居民區(qū)、899個行政村。2003年末，淳安縣人口45.14萬人，轄12個鎮(zhèn)、18個鄉(xiāng)，8個社區(qū)、5個居民區(qū)、899個行政村。
2004年1月18日，浙政函[2004]13號批復(fù)同意橫沿鄉(xiāng)政府駐地由龍源村遷至橫沿村。2004年末，淳安縣轄12個鎮(zhèn)、18個鄉(xiāng)，10個社區(qū)、2個居民區(qū)、899個行政村。2005年末，全縣總?cè)丝?5.3萬人，共有10個社區(qū)、2個居民區(qū)、898個行政村。
千島湖鎮(zhèn)面積284平方千米，人口76339人，鎮(zhèn)政府駐騎龍巷22號，轄8個社區(qū)、34個行政村。文昌鎮(zhèn)面積198平方千米，人口11326人，鎮(zhèn)政府駐潭頭村，轄29個行政村。石林鎮(zhèn)面積144平方千米，人口4762人，鎮(zhèn)政府駐富德村富德44號，轄17個行政村。臨岐鎮(zhèn)面積222平方千米，人口19691人，鎮(zhèn)政府駐魚市街51號，轄38個行政村。威坪鎮(zhèn)面積201平方千米，人口41013人，鎮(zhèn)政府駐興華街321號，轄1個社區(qū)、67個行政村。唐村鎮(zhèn)面積100平方千米，人口14236人，鎮(zhèn)政府駐興唐街3號，轄26個行政村。姜家鎮(zhèn)面積120平方千米，人口13403人，鎮(zhèn)政府駐郁川街10號，轄1個居民區(qū)、33個行政村。梓桐鎮(zhèn)面積156平方千米，人口19665人，鎮(zhèn)政府駐府前街8號，轄38個行政村。汾口鎮(zhèn)面積122平方千米，人口40063人，鎮(zhèn)政府駐楊旗街17號，轄1個社區(qū)、72個行政村。中洲鎮(zhèn)面積166.33平方千米，人口19645人，鎮(zhèn)政府駐中洲街518號，轄42個行政村。大墅鎮(zhèn)面積163平方千米，人口15335人，鎮(zhèn)政府駐府前路11號，轄38個行政村。楓樹嶺鎮(zhèn)面積200平方千米，人口12754人，鎮(zhèn)政府駐楓林前街43號，轄43個行政村。里商鄉(xiāng)面積276平方千米，人口11731人，鄉(xiāng)政府駐里陽村，轄1個居民區(qū)、31個行政村。金峰鄉(xiāng)面積150平方千米，人口6084人，鄉(xiāng)政府駐塘畈村，轄23個行政村。富文鄉(xiāng)面積151平方千米，人口8257人，鄉(xiāng)政府駐富文村，轄18個行政村。左口鄉(xiāng)面積96平方千米，人口6876人，鄉(xiāng)政府駐顯后村，轄16個行政村。汪宅鄉(xiāng)面積72平方千米，人口5012人，鄉(xiāng)政府駐茂畈村，轄12個行政村。屏門鄉(xiāng)面積163平方千米，人口12739人，鄉(xiāng)政府駐屏門村8號，轄32個行政村�，幧洁l(xiāng)面積128平方千米，人口9444人，鄉(xiāng)政府駐何家村40號，轄20個行政村。光昌鄉(xiāng)面積120平方千米，人口6780人，鄉(xiāng)政府駐塘邊村，轄8個行政村。王阜鄉(xiāng)面積106平方千米，人口12014人，鄉(xiāng)政府駐鄭中村149號，轄28個行政村。嚴家鄉(xiāng)面積62平方千米，人口6077人，鄉(xiāng)政府駐大社村村，轄16個行政村。宋村鄉(xiāng)面積85平方千米，人口6934人，鄉(xiāng)政府駐史里村67號，轄21個行政村。鳩坑鄉(xiāng)面積104平方千米，人口8267人，鄉(xiāng)政府駐中聯(lián)村64號，轄23個行政村。浪川鄉(xiāng)面積109平方千米，人口19817人，鄉(xiāng)政府駐大聯(lián)村碣頭，轄36個行政村。郭村鄉(xiāng)面積107平方千米，人口12659人，鄉(xiāng)政府駐上郭村，轄25個行政村。界首鄉(xiāng)面積121平方千米，人口8775人，鄉(xiāng)政府駐姚家村130號，轄31個行政村。橫沿鄉(xiāng)面積115平方千米，人口14389人，鄉(xiāng)政府駐橫沿村，轄29個行政村。安陽鄉(xiāng)面積146平方千米，人口11484人，鄉(xiāng)政府駐虎山坪21號，轄31個行政村。白馬鄉(xiāng)面積108.7平方千米，人口5733人，鄉(xiāng)政府駐白馬村黃公山，轄21個行政村。（根據(jù)杭州地名網(wǎng)資料整理，約2005年資料）
2006年6月19日，浙江省政府（浙政函[2006]68號）批復(fù)同意淳安縣部分行政區(qū)劃調(diào)整：撤銷汪宅鄉(xiāng)建制，與千島湖鎮(zhèn)合并。調(diào)整后的千島湖鎮(zhèn)轄46個行政村、8個社區(qū)，鎮(zhèn)政府駐地不變（騎龍巷22號）�！〕蜂N橫沿鄉(xiāng)建制，與汾口鎮(zhèn)合并。調(diào)整后的汾口鎮(zhèn)轄101個行政村、1個社區(qū)，鎮(zhèn)政府駐地不變（楊旗街17號）�！〕蜂N唐村鎮(zhèn)建制，與威坪鎮(zhèn)合并。調(diào)整后的威坪鎮(zhèn)轄93個行政村、1個社區(qū)，鎮(zhèn)政府駐地不變（興華街321號）�！〕蜂N郭村鄉(xiāng)建制，與姜家鎮(zhèn)管轄。調(diào)整后的姜家鎮(zhèn)轄58個行政村、1個居民區(qū)，鎮(zhèn)政府駐地不變（郁川街10號）�！〕蜂N白馬鄉(xiāng)建制，其行政區(qū)域劃歸楓樹嶺鎮(zhèn)管轄。調(diào)整后的楓樹嶺鎮(zhèn)轄64個行政村，鎮(zhèn)政府駐地不變（楓嶺前街43號）�！〕蜂N嚴家鄉(xiāng)建制，其行政區(qū)域劃歸王阜鄉(xiāng)管轄。調(diào)整后的王阜鄉(xiāng)轄44個行政村，鄉(xiāng)政府駐地不變（鄭中村）。 撤銷光昌鄉(xiāng)建制，其中塘邊、石嶺后、雌龍源、雄龍源、龍源莊等5個行政村并入左口鄉(xiāng)，富山、楊岸、光昌邊等3個行政村并入文昌鎮(zhèn)。調(diào)整后，左口鄉(xiāng)轄21個行政村，鄉(xiāng)政府駐地不變（顯后村）；文昌鎮(zhèn)轄32個行政村，鎮(zhèn)政府駐地不變（潭頭村）。 此次行政區(qū)劃調(diào)整后，淳安縣轄千島湖、石林、文昌、臨岐、威坪、姜家、梓桐、汾口、中洲、大墅、楓樹嶺共11個鎮(zhèn)和里商、富文、左口、金峰、屏門、瑤山、鳩坑、王阜、宋村、浪川、界首、安陽共12個鄉(xiāng)。
2007年6月12日，浙政函[2007]78號批復(fù)同意左口鄉(xiāng)政府駐地由顯后村遷至下山村。2007年末，淳安縣轄11個鎮(zhèn)、12個鄉(xiāng)：千島湖鎮(zhèn)、文昌鎮(zhèn)、石林鎮(zhèn)、臨岐鎮(zhèn)、威坪鎮(zhèn)、姜家鎮(zhèn)、梓桐鎮(zhèn)、汾口鎮(zhèn)、中洲鎮(zhèn)、大墅鎮(zhèn)、楓樹嶺鎮(zhèn)、里商鄉(xiāng)、金峰鄉(xiāng)、富文鄉(xiāng)、左口鄉(xiāng)、屏門鄉(xiāng)、瑤山鄉(xiāng)、王阜鄉(xiāng)、宋村鄉(xiāng)、鳩坑鄉(xiāng)、浪川鄉(xiāng)、界首鄉(xiāng)、安陽鄉(xiāng)�？h政府駐千島湖鎮(zhèn)新安北路18號。