1952年設市。“喀什”系“喀什噶爾”的簡稱。“喀什”系突厥語“玉石”之意，“噶爾“系古伊朗語“石”或“山”之意，即“玉石”或“玉山”之意。另據《西域同文志》：系回語，“喀什謂石色。噶爾，謂磚房。其地富遮多磚房，故名”。據語言學方面的考證，認為是古和田塞語，意為“玉石之城”。

漢為疏勒國地，隸西域都護府。兩漢書、《魏書》、《隋書》、新、舊唐書、《宋史》均作疏勒國。唐上元二年（675年）設疏勒都督府。宋為喀喇汗王朝的陪都。元代稱乞思合兒、可失哈耳、可失哈里、乞失哈里等。《明史》作哈實哈兒，為東察合臺汗國重鎮。清代稱喀什噶爾。清乾隆二十四年（1759年）設喀什噶爾參贊大臣駐此。清光緒九年（1883年）設喀公地點噶爾道。1929年改稱喀什行政區，1943年改為喀什督察專區。新中國成立后先后設喀什專區、南疆行政區、喀什地區等。歷為官衙、公署所在地。1952年從疏附縣析置喀什市。1956年后隸屬喀什專區、喀什地區。

1982年11月6日，喀什行署決定，將喀什市浩罕、伯什克然木、阿瓦提、英吾斯坦4個公社及河內林場劃歸疏附縣。

1997年，喀什市轄4個街道、3個鄉：恰薩街道、庫木代爾瓦扎街道、亞瓦格街道、吾斯塘博依街道、夏馬勒巴格鄉、乃則爾巴格鄉、多來特巴格鄉。

1998年3月1日，經自治區政府批準，將疏附縣浩罕鄉、伯什克然木鄉5個村、阿瓦提鄉2個村、帕哈太克里鄉1個村、疏勒縣城關鎮1個村的3個村民小組劃歸喀什市管轄。

1999年末，喀什市總面積198.14平方千米，其中建城區面積18.52平方千米�？側丝�31.89萬人，其中少數民族26.19萬人，農業人口9.6萬人。轄4個鄉，4個街道：恰薩街道、庫木代爾瓦扎街道、亞瓦格街道、吾斯塘博依街道、夏馬勒巴格鄉、乃則爾巴格鄉、多來特巴格鄉、浩罕鄉。

2000年第五次人口普查，喀什市常住總人口340640人，其中：恰薩街道68929人、亞瓦格街道24448人、吾斯塘博依街道45426人、庫木代瓦扎街道50463人、乃則爾巴格鄉46196人、夏馬勒巴格鄉39601人、多來提巴格鄉38196人、浩罕鄉27381人。

2004年8月2日，經自治區政府批準，將疏附縣的色滿鄉、荒地鄉劃歸喀什市管轄。調整后，喀什市東西部與疏附縣接壤，北倚古瑪塔格山與克孜勒蘇柯爾克孜自治州阿圖什市毗鄰，南面與疏勒縣隔克孜勒蘇河遙相對望�？偯娣e294.21平方千米，總人口351874人。轄4街道、6個鄉：多來特巴格鄉、乃則爾巴格鄉、夏馬勒巴格鄉、浩罕鄉、色滿鄉、荒地鄉。市政府駐人民東路。

2005年2月24日，經自治區政府批準，將疏附縣的帕哈太克里鄉、伯什克然木鄉劃歸喀什市管轄。調整后，全市轄4個街道、8個鄉：恰薩街道、亞瓦格街道、吾斯塘博依街道、庫木代爾瓦扎街道、乃則爾巴格鄉、夏馬勒巴格鄉、多來特巴格鄉、浩罕鄉、色滿鄉、荒地鄉、帕哈太克里鄉、伯什克然木鄉。

2009年，撤銷乃則爾巴格鄉、夏馬勒巴格鄉，設立乃則爾巴格鎮、夏馬勒巴格鎮。

2010年第六次人口普查，喀什市常住總人口506640人，其中：恰薩街道88540人，亞瓦格街道26617人，吾斯塘博依街道50580人，庫木德爾瓦扎街50861人，乃則爾巴格鎮61096人，夏馬勒巴格鎮59769人，多來特巴格鄉56003人，浩罕鄉33476人，色滿鄉18851人，荒地鄉11209人，帕哈太克里鄉13622人，伯什克然木鄉36016人。

2013年3月，自治區政府（新政函[2013]35號）同意將疏附縣阿瓦提鄉劃歸喀什市管轄。2013年，自治區政府（新政函[2013]207號）批準同意將疏附縣英吾斯坦鄉劃歸喀什市管轄（11月20日正式實施）。阿瓦提鄉面積87.2平方千米，人口3.42萬人；英吾斯坦鄉面積109.16平方千米，人口3.98萬人。

2014年10月21日，自治區政府（新政函[2014]194號）同意將疏附縣阿克喀什鄉劃歸喀什市管轄。阿克喀什鄉面積約266平方千米，人口1萬余人。至此，全市轄4個街道、2個鎮、9個鄉：恰薩街道、亞瓦格街道、吾斯塘博依街道、庫木代爾瓦扎街道、乃則爾巴格鎮、夏馬勒巴格鎮、多來特巴格鄉、浩罕鄉、色滿鄉、荒地鄉、帕哈太克里鄉、伯什克然木鄉、阿瓦提鄉、英吾斯坦鄉、阿克喀什鄉。

2015年4月3日，自治區政府批復同意設立西域大道街道（新政函[2015]87號）、東湖街道（新政函[2015]88號）。調整后，全市轄6個街道、2個鎮、9個鄉。