區內有聞名遐邇的“青云譜道院”（即“八大山人紀念館”），青云譜區名稱由此而來。宋朝學者樂史在其編著的《太平環宇記》中早有“青云浦在（南昌）城南十五里”的記載。明末清初畫家朱耷（八大山人）在此隱居，改“青云浦”為“青云圃”。清嘉慶20年（1815年），禮部尚書戴均元又將“圃”改為“譜”，即今名。
　　此地先后隸屬豫章郡（漢）、宜善縣（新莽）、洪州（唐至北宋）、隆興府（南宋、元初）、龍興路（元）、南昌府（明、清）。民國時期，先后直隸豫章道，省轄；后隸屬江西省第一行政區（其中1939－1941年隸屬第11行政區）。
　　解放后，1949年9月以前，曾劃為南昌市第六區的一部分；同年10月，一度劃到南昌縣；1950年下半年，又劃為南昌市第六區；到1958年10月，由三家店鎮、青云譜鄉、城南鄉三者合并成立青云譜區。

　　1997年，青云譜區位于市區南端，面積18平方千米，人口17.3萬。轄5個街道，區政府駐井岡山大道94號。京九鐵路縱貫全區，迎賓大道和井岡山大道穿境。有青云譜道院、清代大畫家八大山人紀念館。
　　1998年1月5日，將郊區青云譜鄉（不含辛家庵、楞上行政村）和青云譜農場劃歸青云譜區；岱山街道辦事處的前萬、石馬行政村劃入青云譜鄉；辛家庵、楞上行政村劃歸郊區湖坊鄉。
　　2000年，全區轄5個街道、1個鄉。根據第五次人口普查數據，全區總人口229141人，其中：洪都街道57098人、三家店街道21379人、京山街道52452人、徐家坊街道29440人、岱山街道22085人、青云譜鄉46687人。
　　2002年8月8日，撤銷青云譜鄉，設立青云譜鎮（贛民字[2002]181號批復）。
　　2002年底，青云譜區面積37平方千米，總人口21.9萬人，其中非農業人口18.7萬人。郵編330001。轄5個街道辦事處、1個鎮：徐家坊街道、京山街道、三家店街道、岱山街道、洪都街道、青云譜鎮，37個居委會、9個行政村。區政府駐井岡山大道。
　　三家店街道　辦事處駐井岡山大道。面積0.9平方千米，人口2.393萬人，郵編330001。轄6個居委會：包家花園、新溪橋、三家店、南苑、何坊東、昌南。
　　洪都街道　辦事處駐新溪橋東一路。面積0.9平方千米，人口2.363萬人，郵編330024。轄11個居委會：洪東、洪干、洪鷹、洪校、洪紡、洪園、洪翔、洪科、洪西、洪招、洪惠。
　　京山街道　辦事處駐何坊西路。面積4.5平方千米，人口4.434萬人，郵編330001。轄9個居委會：象湖、梨園南、梨園北、何坊北、新街、何坊南、京山西、京山東、絲網塘。
　　徐家坊街道　辦事處駐井岡山大道。面積1.7平方千米，人口2.553萬人，郵編330002。轄6個居委會：五糧電、徐家坊、錦聯、新村、建東、建西。
　　岱山街道　辦事處駐南墻路。面積6.9平方千米，人口3.254萬人，郵編330001。轄5個居委會：南蓮、岱山、八大山人、迎賓、五四九廠。
　　青云譜鎮　鎮政府駐井岡山大道。面積18.8平方千米，人口1.9萬人，郵編330001。轄9個行政村：三店、熊坊、黃溪、萬溪、城南、施堯、下堯、石馬、前萬。
　　以上根據《江西省行政區劃簡冊2003》整理

　　2003年底，全區總人口24.1萬人。
　　2004年9月7日，國務院批準（國函[2004]70號）調整南昌市市轄區部分行政區劃：將西湖區十字街街道的谷市街、洪城路、南關口、九四、新豐5個居委會，上海路街道的草珊瑚集團、南昌腸衣廠、電子計算機廠、江西滌綸廠、江地基礎公司、曙光、商標彩印廠、南昌市染整廠、江南蓄電池廠、四機床廠、二進、國樂新村12個居委會，南站街道的解放西路東居委會，青山湖區湖坊鎮的楞上、太和、熱心3個村劃歸青云譜區管轄。調整后，青云譜區轄三家店、洪都、京山、徐家坊、岱山5個街道和青云譜鎮，區政府駐井岡山大道。調整前，青云譜區面積37平方千米，人口22萬（區劃人口數據根據簡冊2004，有關政府網站中面積為37.22平方千米）。
　　2004年底，全區轄三家店、洪都、京山、徐家坊、岱山5個街道和青云譜鎮。
　　三家店街道　轄：新溪橋、包家花園、昌南、三家店、南苑、何坊東6個社區居委會。
　　洪都街道　轄：洪翔、洪干、洪鷹、洪校、洪園、洪科、洪東、洪西、洪招、洪惠、洪紡11個社區居委會。
　　岱山街道　轄：八大山人、岱山、南蓮、五四九、迎賓5個社區居委會。
　　徐家坊街道　轄：徐坊、五糧電、錦聯、新村、建東、建西、二進、新豐、洪城路、谷市街、解放西路東、曙光、南關口13個社區居委會；九四、江地、江南蓄電池廠、江西滌淪廠、江西電子計算機廠、草珊瑚集團、國樂新村、第四機床廠、江西商標彩印廠、南昌染整廠、南昌腸衣廠11個家委會。
　　京山街道　轄：象湖、梨園南、梨園北、何坊北、新街、何坊南、京山西、京山東、絲網塘9個社區居委會。
　　青云譜鎮　轄：三店、下堯、前萬、施堯、城南、熊坊、石馬、黃溪、萬溪、楞上、熱心、太和12個行政村。
　　2005年1月5日，青云譜區人民政府《關于對三家店、徐家坊、京山、岱山街道和青云譜鎮行政區劃調整的決定》（青政發[2005]1號）：根據南昌市人民政府《關于青云譜區行政區劃調整的批復》（洪府字[2004]33號）
　　一、將京山街道新街、何坊南、京山東3個居委會和岱山街道的南蓮居委會劃歸三家店街道管轄。調整后，三家店街道轄南苑、昌南、包家花園、三家店、何坊東、新溪橋、新街、何坊南、京山東、南蓮等10個居委會，辦事處駐井岡山大道320號。界線：北以何坊東居委會與熱心村交界線、何坊西路（江鈴立交橋至迎賓大道）為界；東以何坊東、包家花園居委會與洪都街道交界線、南苑居委會與熊坊村交界線、南蓮居委會與前萬村交界線為界；南以南蓮居委會南線為界；西以京九線（從南蓮居委會南線至江鈴東一路）、江鈴東一路、迎賓大道（何坊西路與迎賓大道交會點至江鈴東一路與迎賓大道交會點）為界。
　　二、將原西湖區十字街街道的谷市街、洪城路、南關口、九四、新豐5個居委會，上海路街道的草珊瑚集團、南昌腸衣廠、電子計算機廠、江西滌綸廠、江地基礎公司、曙光、商標彩印廠、南昌市染整廠、江南蓄電池廠、四機床廠、二進、國樂新村12個居委會，南站街道的解放西路東居委會劃歸徐家坊街道管轄。調整后，徐家坊街道轄建西、錦聯、谷市街、洪城路、南關口、九四、新豐、草珊瑚集團、南昌腸衣廠、電子計算機廠、江西滌綸廠、江地基礎公司、曙光、商標彩印廠、南昌市染整廠、江南蓄電池廠、四機床廠、二進、國樂新村、解放西路東20個居委會，辦事處駐井岡山大道681號。界線：北以洪城路、解放西路為界；東以原上海路街道染整廠居委會與楞上村交界線為界；南以原上海路街道與楞上、太和村交界線，原南站街道解放西路東居委會與太和村交界線、錦聯居委會與徐坊居委會交界線、井岡山大道（錦聯居委會與徐坊居委會交界線至建設路）、建設路為界；西以撫河故道西岸線為界。
　　三、將徐家坊街道建東、新村、五糧電、徐坊4個居委會劃歸京山街道管轄。調整后，京山街道轄何坊北、象湖、絲網塘、京山西、建東、新村、五糧電、徐坊8個居委會，辦事處駐何坊西路283號。界線：北以建設路為界；東以井岡山大道（建設路至錦聯居委會與徐坊居委會交界線）、錦聯居委會與徐坊居委會交界線、京九線（錦聯居委會與徐坊居委會交界線至江鈴立交橋）為界；南以何坊西路（江鈴立交橋至迎賓大道）、迎賓大道（何坊西路至江鈴西一路）、江鈴西一路為界；西以象湖東岸線、撫河故道西岸線為界。
　　四、將京山街道梨園南、梨園北2個居委會劃歸岱山街道管轄。調整后，岱山街道轄迎賓、岱山、八大山人、五四九、梨園南、梨園北6個居委會，辦事處駐南墻路5號。界線：北以江鈴東一路、江鈴西一路為界；東以京九線（八大山人居委會南線至江鈴東一路）為界；南以八大山人、岱山居委會與南昌縣交界線為界；西以象湖東岸線、岱山居委會與南昌縣交界線為界。
　　五、將原青山湖區湖坊鎮的熱心、太和、楞上3個行政村劃歸青云譜鎮管轄。調整后，青云譜鎮轄三店、熊坊、石馬、前萬、萬溪、黃溪、城南、施堯、下堯、太和、熱心、楞上等12個村和洪惠居委會，鎮政府駐井岡山大道82號。界線：青云譜鎮邊界呈一種環行邊界，外與青山湖區、南昌縣、西湖區交界，內與三家店、洪都、徐家坊、京山、岱山街道交界。

　　2005年年末青云譜區戶籍人口為26.01萬人，其中城市人口24.03萬人，鄉村人口1.98萬人；年末常住人口30.1萬人。行政區劃一覽：
　　洪都街道　　2005年轄11個社區：～001洪翔社區、～002_洪干社區、～003_洪鷹社區、～004_洪校社區、～005_洪園社區、～006_洪科社區、～007_洪東社區、～008_洪西社區、～009_洪招社區、～010_洪惠社區、～011_洪紡社區。現轄洪東、洪干、洪鷹、洪校、洪紡、洪園、洪翔、洪科、洪西、洪招等10個社區。
　　京山街道　　2005年轄8個社區：～001_象湖社區、～004_何坊北社區、～007_京山西社區、～009_象湖園社區、～010_徐坊社區、～011_五糧電社區、～012_新村社區、～013_建東社區。
　　三家店街道　　2005年轄10個社區：～001_新溪橋社區、～002_包家花園社區、～003_昌南社區、～004_三家店社區、～005_南苑社區、～006_何坊東社區、～007_新街社區、～008_何坊南社區、～009_京山東社區、～010_南蓮社區。
　　岱山街道　　2005年轄6個社區：～001_八大山人社區、～002_岱山社區、～004_五四九社區、～005_迎賓社區、～006_梨園南社區、～007_梨園北社區。
　　徐家坊街道　　2005年轄9個社區、11個家委會：～003_錦聯社區、～006_建西社區、～007_二進社區、～008_新豐社區、～009_洪城路社區、～010_谷市街社區、～011_解放西路東社區、～012_曙光社區、～013_南關口社區、～014_九四家委會、～015_江地家委會、～016_江南蓄電池廠家委會、～017_江西滌淪廠家委會、～018_江西電子計算機廠家委會、～019_草珊瑚集團家委會、～020_國樂新村家委會、～021_第四機床廠家委會、～022_江西商標彩印廠家委會、～023_南昌染整廠家委會、～024_南昌腸衣廠家委會。
　　青云譜鎮　　2005年轄12個行政村：～200_三店村、～201_下堯村、～202_前萬村、～203_施堯村、～204_城南村、～205_熊坊村、～206_石馬村、～207_黃溪村、～208_萬溪村、～209_楞上村、～210_熱心村、～211_太和村；～500_青云譜農場。
　　南昌昌南工業園　　代碼360104559